LA JOLLA–Các nhà nghiên cứu sắp chào đón một trung tâm tổng hợp mới cung cấp thông tin quan trọng về cách hệ thống miễn dịch nhắm mục tiêu đến bệnh ung thư. Viện Ung thư Quốc gia (NCI) thuộc Viện Y tế Quốc gia đã cấp hơn 4.2 triệu đô la để khởi động Cơ sở dữ liệu và Tài nguyên Phân tích Biểu mô Ung thư (CEDAR), do Giáo sư Alessandro Sette, Tiến sĩ Biol của Viện Miễn dịch học La Jolla (LJI) dẫn đầu. Sci., và Bjoern Peters, Ph.D.

Peters cho biết: “Chúng tôi rất biết ơn vì Viện Ung thư Quốc gia đã nhận ra sự cần thiết của loại cơ sở hạ tầng này để thúc đẩy nghiên cứu trong lĩnh vực này”.

Liệu pháp miễn dịch ung thư, bao gồm vắc-xin hoặc thuốc ức chế phong tỏa điểm kiểm soát, giải phóng các tế bào T của hệ thống miễn dịch để tìm và tiêu diệt tế bào ung thư. Chiến lược này đã được chứng minh là có hiệu quả ở một số bệnh nhân, nhưng nhiều bệnh ung thư vẫn trốn tránh các liệu pháp điều trị.

Với CEDAR, các nhà nghiên cứu sẽ có cơ sở dữ liệu miễn phí, dễ dàng tìm kiếm về các mục tiêu tiềm năng của hệ thống miễn dịch đối với nhiều loại tế bào ung thư. Điều quan trọng là bất kỳ nhà khoa học nào trên thế giới đều có thể đóng góp dữ liệu của họ, dữ liệu này sẽ do nhóm LJI tận tâm phụ trách.

Sette cho biết: “CEDAR là một bước tiến quan trọng đối với tất cả những người làm việc trong lĩnh vực liệu pháp miễn dịch ung thư. “Trong vài năm gần đây, đã có sự bùng nổ về sự quan tâm và tiến bộ trong lĩnh vực liệu pháp miễn dịch ung thư với các chất ức chế phong tỏa điểm kiểm soát, cũng như sự nhiệt tình mới đối với vắc-xin ung thư được cá nhân hóa dựa trên những đột biến cụ thể xảy ra ở mỗi bệnh nhân ung thư. Nhu cầu thực sự về một nguồn tài nguyên tập trung có thể tích hợp tất cả các dữ liệu và thử nghiệm mới này.”

Đối với Viện Ung thư Quốc gia, CEDAR là một cột mốc quan trọng đối với chương trình Công nghệ tin học dành cho nghiên cứu ung thư, một nỗ lực được triển khai vào năm 2012.

Jerry Li, MD, Tiến sĩ, Giám đốc Chương trình của Khoa Sinh học Ung thư, Sinh học Cấu trúc và Ứng dụng Phân tử của Viện Ung thư Quốc gia cho biết: “Viện Ung thư Quốc gia đang nỗ lực khuyến khích phát triển các nguồn lực tin học để hỗ trợ nghiên cứu ung thư trên diện rộng”. Chi nhánh.

Giáo sư LJI Stephen Schoenberger, Tiến sĩ, thành viên của Trung tâm Liệu pháp Miễn dịch Ung thư của Viện, đã ủng hộ việc ra mắt cơ sở dữ liệu miễn dịch ung thư tập trung như CEDAR. Ông cho biết nguồn tài nguyên mới này sẽ giúp các nhà khoa học dự đoán và xác nhận loại kháng nguyên mới ung thư nào là quan trọng để nhắm tới ở từng bệnh nhân.

Schoenberger cho biết: “Tôi nghĩ CEDAR sẽ chứng tỏ là một nguồn tài nguyên vô giá cho cộng đồng các nhà nghiên cứu quan tâm đến những hiểu biết cơ bản về sinh học miễn dịch của bệnh ung thư, cũng như các bác sĩ lâm sàng quan tâm đến việc nhắm mục tiêu hiệu quả hơn vào các khối u”.

Xây dựng dựa trên chuyên môn của LJI

Sette và Peters có kinh nghiệm tập hợp các nhà nghiên cứu cho một dự án quy mô này. Năm 2003, cặp đôi này đã ra mắt Cơ sở dữ liệu biểu mô miễn dịch (IEDB), được tài trợ bởi Viện Dị ứng và Bệnh Truyền nhiễm Quốc gia (NIAID). IEDB là nơi lưu trữ rất nhiều dữ liệu được quản lý chặt chẽ về các mối đe dọa sức khỏe từ HIV đến SARS-CoV-2.

Sette cho biết: “IEDB đã tuyển chọn các mẫu vật liên quan đến khả năng tự miễn dịch, dị ứng, bệnh truyền nhiễm và cấy ghép, nhưng chúng tôi chưa tích hợp khía cạnh ung thư”.

Peters cho biết nhóm LJI sẽ áp dụng kiến ​​thức chuyên môn và thuật toán mà họ đã phát triển cho IEDB – cũng như những phản hồi của người dùng trong nhiều năm – để củng cố CEDAR.

Peters cho biết thêm: “Việc triển khai nỗ lực tương tự đối với bệnh ung thư mà chúng tôi đã thực hiện đối với các phát hiện về hệ thống miễn dịch trong IEDB thực sự là một bước đột phá”. “Sẽ thật tuyệt khi có những nguồn tài nguyên này dưới cùng một mái nhà.”

Li cho biết thêm: “Chúng tôi rất vui khi thấy rằng dự án CEDAR có thể tận dụng cơ sở dữ liệu đó và chuyên môn của các nhà nghiên cứu”.

Giảng viên LJI Zeynep Ko?alo?lu-Yalç?n, Tiến sĩ và Giám đốc Dự án LJI Nina Blazeska đang làm việc để thiết lập và vận hành CEDAR.

Ko?alo?lu-Yalç?n đang lãnh đạo nhóm phát triển công cụ, nhóm sẽ thiết lập các công cụ tính toán để phân tích và dự đoán các biểu mô ung thư mà không chỉ các nhà tin sinh học mà còn các nhà nghiên cứu và bác sĩ lâm sàng về ung thư có thể dễ dàng tiếp cận. Nhóm của Ko?alo?lu-Yalç?n sẽ kết hợp phản hồi của người dùng để đảm bảo rằng các công cụ này đáp ứng nhu cầu của nhà nghiên cứu và dễ sử dụng. Ko?alo?lu-Yalç?n cho biết: “Chúng tôi cũng sẽ cung cấp miễn phí những công cụ này”. Nhóm cũng sẽ sử dụng dữ liệu trong CEDAR để đánh giá và đánh giá các công cụ hiện có cũng như phát triển các phương pháp để dự đoán tốt hơn các mục tiêu có khả năng được các tế bào miễn dịch nhận ra.

Blazeska đang điều phối năm nhóm khác nhau để biến CEDAR trở thành một nguồn tài nguyên mạnh mẽ: người phụ trách khoa học, nhóm tiếp cận cộng đồng, nhóm báo cáo và truy vấn cơ sở dữ liệu, phát triển công cụ và cơ sở hạ tầng CNTT. Cô giải thích rằng việc thu thập dữ liệu về bệnh ung thư có thể đòi hỏi một cách tiếp cận hơi khác so với công việc về bệnh truyền nhiễm đang diễn ra của nhóm. Ví dụ: các trường dữ liệu mới sẽ cần được thêm vào để quản lý, chẳng hạn như giai đoạn ung thư I – IV, để đảm bảo rằng CEDAR thu thập tất cả dữ liệu liên quan cho cộng đồng ung thư. Vì lý do này, ý kiến ​​từ các chuyên gia về ung thư sẽ rất cần thiết trong suốt quá trình lập kế hoạch và phát triển.

Blazeska nói: “Chúng ta cần tập trung vào việc có một nền tảng vững chắc. “Tất cả chúng tôi đều rất vui mừng. Việc này đã được thực hiện trong nhiều năm.”

# # #

Đây là số cấp NCI U24CA248138.

Giới thiệu về Viện Miễn dịch học La Jolla

Viện Miễn dịch học La Jolla chuyên tìm hiểu sự phức tạp và sức mạnh của hệ thống miễn dịch để chúng tôi có thể áp dụng kiến ​​thức đó nhằm tăng cường sức khỏe con người và ngăn ngừa nhiều loại bệnh tật. Kể từ khi thành lập vào năm 1988 với tư cách là một tổ chức nghiên cứu độc lập, phi lợi nhuận, Viện đã đạt được nhiều tiến bộ hướng tới mục tiêu của mình: cuộc sống không bệnh tật.