Folding@home crowdsourced computerproject passeert 1 miljoen downloads te midden van coronavirusonderzoek

Folding@home-software voor het doneren van compute voor medisch onderzoek de 1 miljoen downloads gepasseerd, zei directeur Greg Bowman vandaag in een tweet. De Folding @ home Consortium bestaat uit 11 laboratoria over de hele wereld die de moleculaire structuur van ziekten zoals kanker, ALS en griep bestuderen. Onderzoek naar COVID-19 is eerder deze maand gestart. De crowdsourcing-inspanning wordt nu mogelijk gemaakt door honderdduizenden Nvidia GPU's en tienduizenden AMD GPU's.

Er zijn nu meer dan 1 miljoen apparaten actief @koninklijkhuis ! Dit omvat meer dan 356K @nvidia GPU's, meer dan 79K @AMD GPU's en meer dan 593K CPU's! Dank aan al onze vrijwilligers! We plannen meer blogposts op onze # COVID19 werk/resultaten deze week, houd ons in de gaten.

- Greg Bowman (@drGregBowman) 30 maart 2020

Volgens een Nvidia-blog post over de mijlpaal, hebben bijna 400,000 gamers de afgelopen dagen GPU's gedoneerd aan de inspanning.

Vorige week zei Folding@home het kruiste de ene exaflop in rekenkracht mijlpaal, of gezamenlijk groter dan welke supercomputer dan ook die ooit is geassembleerd. Ter vergelijking: de Top supercomputer bij Oak Ridge National Laboratory in Tennessee heeft herhaaldelijk de eerste plaats behaald in de Top500 supercomputing-rangen en is in staat om 148 petaflops aan rekenkracht te verzamelen.

De computer wordt gebruikt om "mogelijk medicijnbare eiwitdoelen" te simuleren en te begrijpen hoe het virus dat COVID-19 veroorzaakt, interageert met de ACE2-receptor, volgens de Folding@home website.

"Hoewel we de simulatiedatasets snel zullen vrijgeven voor anderen om te gebruiken of te analyseren, streven we naar alternatieve conformaties en verborgen zakken binnen de meest veelbelovende medicijndoelen, die alleen te zien zijn in simulatie en niet in statische röntgenstructuren", organisator John Chodera zei op 10 maart blogpost om een ​​reeks eiwitvouwprojecten in productie te nemen.

In een ander recent initiatief op het snijvlak van gaming en medisch onderzoek, eerder deze maand de Universiteit van Washington introduceerde FoldIt, een puzzel om uitdagingen op het gebied van eiwitvouwing op te lossen. Aan het werk op het snijvlak van eiwitvouwing en AI, Google's DeepMind uitgebracht voorspellingen van onderbelichte eiwitten geassocieerd met SARS-CoV-2 gegenereerd door de nieuwste versie van AlphaFold.

A aantal open source-projecten is aan de gang om de voortgang naar genezing te versnellen. Cloud computing-providers in China zoals Alibaba, Baidu en Tencent, evenals AWS, Google Cloud en Azure in de VS lenen ook computers uit aan onderzoekers. De CORD-19 dataset bestaat uit tienduizenden wetenschappelijke werken en werd vorige week beschikbaar gesteld voor zowel medische als NLP-onderzoekers door een groep waaronder Microsoft Research, het Allen AI Institute en het Witte Huis.