Greenough, L. và cộng sự. Điều chỉnh điện di trên gel mao mạch như một phương pháp nhạy cảm, hiệu suất cao để đẩy nhanh đặc tính của các enzyme chuyển hóa axit nucleic. Axit nucleic Res. 44, e15 (2016).
Farag, N. và cộng sự. Công tắc nano DNA gấp lại khi sửa chữa để theo dõi hoạt động của các enzym sửa chữa DNA. Angew. Chèm. 133, 7359 tầm 7365 (2021).
Luo, X. & Hsing, I.-M. Xét nghiệm DNA polymerase điện hóa không cố định. phân tích điện 23, 923 tầm 926 (2011).
Boehr, DD, Nussinov, R. & Wright, PE Vai trò của các quần thể hình dạng động trong nhận dạng phân tử sinh học. Nat. Hóa. Biol. 5, 789 tầm 796 (2009).
Henzler-Wildman, K. & Kern, D. Tính cách năng động của protein. Thiên nhiên 450, 964 tầm 972 (2007).
Leveson-Gower, RB, Mayer, C. & Roelfes, G. Tầm quan trọng của sự hỗn tạp xúc tác đối với việc thiết kế và tiến hóa enzyme. tự nhiên Linh mục Chem. 3, 687 tầm 705 (2019).
Rotman, B. Đo hoạt độ của các phân tử đơn lẻ β-d-galactosidase. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 47, 1981 tầm 1991 (1961).
Vogelstein, B. & Kinzler, KW Digital PCR. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 96, 9236 tầm 9241 (1999).
Rondelez, Y. và cộng sự. Các mảng buồng femtoliter được chế tạo vi mô cho phép thực hiện enzyme phân tử đơn. Nat. Công nghệ sinh học. 23, 361 tầm 365 (2005).
Xét nghiệm enzyme kỹ thuật số Ono, T., Ichiki, T. & Noji, H. sử dụng mảng giọt attoliter. Phân tích 143, 4923 tầm 4929 (2018).
Quan, Z. và cộng sự. Phương pháp nhỏ giọt vi lỏng song song cao cho phép đếm từng phân tử để phát hiện enzyme kỹ thuật số. Chất lỏng sinh học 8, 014110 (2014).
Rojek, MJ & Walt, DR Quan sát các phân tử enzyme đơn lẻ chuyển đổi lẫn nhau giữa các trạng thái hoạt động khi đun nóng. PLoS One 9, e86224 (2014).
Rissin, DM & Walt, DR Đọc nồng độ kỹ thuật số của các phân tử enzyme đơn lẻ bằng cách sử dụng mảng femtoliter và thống kê Poisson. Lá thư Nano. 6, 520 tầm 523 (2006).
Liebherr, RB và cộng sự. Xét nghiệm enzyme ba trong một dựa trên việc phát hiện phân tử đơn lẻ trong mảng femtoliter. Hậu môn. Bioanal. Chèm. 407, 7443 tầm 7452 (2015).
Obayashi, Y., Iino, R. & Noji, H. Một xét nghiệm enzyme kỹ thuật số đơn phân tử sử dụng phosphatase kiềm với chất nền fluorogen dựa trên cumarin. Phân tích 140, 5065 tầm 5073 (2015).
Gorris, HH, Rissin, DM & Walt, DR Chất ức chế Stochastic giải phóng và liên kết từ các phân tử enzyme đơn. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 104, 17680 tầm 17685 (2007).
Tiếng Anh, BP và cộng sự. Các phân tử enzyme đơn luôn dao động: Xem lại phương trình Michaelis–Menten. Nat. Hóa. Biol. 2, 87 tầm 94 (2006).
Hsin, T.-M. & Yeung, ES Phản ứng đơn phân tử trong liposome. Tức giận. Hóa. Nội bộ Ed. 46, 8032 tầm 8035 (2007).
Ueno, H., Kato, M., Minagawa, Y., Hirose, Y. & Noji, H. Làm sáng tỏ và kiểm soát các quần thể phân tử phosphatase kiềm có hoạt tính thấp và cao để định lượng sinh học kỹ thuật số. Protein khoa học. 30, 1628 tầm 1639 (2021).
Jiang, Y., Li, X. & Walt, DR Phân tích đơn phân tử xác định isozyme của phosphatase kiềm ở người trong huyết thanh. Tức giận. Hóa. Nội bộ Ed. 59, 18010 tầm 18015 (2020).
Craig, DB, Arriaga, EA, Wong, JCY, Lu, H. & Dovichi, NJ Nghiên cứu về các phân tử phosphatase kiềm đơn: tốc độ phản ứng và năng lượng kích hoạt của phản ứng được xúc tác bởi một phân tử đơn lẻ và ảnh hưởng của sự biến tính nhiệt—cái chết của một enzym. Mứt. Chem. Soc. 118, 5245 tầm 5253 (1996).
Sakuma, M. và cộng sự. Sự xáo trộn di truyền làm thay đổi các trạng thái chức năng trong phosphatase kiềm. Mứt. Chem. Soc. 145, 2806 tầm 2814 (2023).
Gorris, HH & Walt, DR Các khía cạnh cơ học của peroxidase cải ngựa được làm sáng tỏ thông qua các nghiên cứu đơn phân tử. Mứt. Chem. Soc. 131, 6277 tầm 6282 (2009).
Ehrl, BN, Liebherr, RB & Gorris, HH Động học phân tử đơn của peroxidase cải ngựa tiếp xúc trong các mảng lớn các buồng silic nung chảy có kích thước bằng femtoliter. Phân tích 138, 4260 tầm 4265 (2013).
Comellas-Aragonès, M. và cộng sự. Một lò phản ứng nano enzyme đơn dựa trên virus. Nat. Công nghệ nano. 2, 635 tầm 639 (2007).
Liebherr, RB, Renner, M. & Gorris, HH Quan điểm phân tử đơn lẻ về tính đa dạng chức năng của β-glucuronidase tiến hóa trong ống nghiệm. Mứt. Chem. Soc. 136, 5949 tầm 5955 (2014).
Giang, Y. và cộng sự. Nghiên cứu cơ học đơn phân tử về độ trễ của enzyme. Trung tâm ACS Khoa học. 5, 1691 tầm 1698 (2019).
Watanabe, R., Sakuragi, T., Noji, H. & Nagata, S. Phân tích đơn phân tử của sự xáo trộn phospholipid bằng TMEM16F. Sinh lý. J. 114, 558a (2018).
Tan, W. & Yeung, ES Theo dõi phản ứng của các phân tử enzyme đơn lẻ và các ion kim loại đơn lẻ. Hậu môn. Chèm. 69, 4242 tầm 4248 (1997).
Sakakihara, S., Araki, S., Iino, R. & Noji, H. Một xét nghiệm enzyme đơn phân tử trong mảng giọt femtoliter có thể truy cập trực tiếp. Chip phòng thí nghiệm 10, 3355 tầm 3362 (2010).
Watanabe, R. và cộng sự. Buồng hai lớp lipid được sắp xếp cho phép phân tích đơn phân tử về hoạt động vận chuyển màng. Nat. Cộng đồng. 5, 4519 (2014).
Ueno, H., Sano, M., Hara, M. & Noji, H. Thử nghiệm phân tầng kỹ thuật số đối với các enzyme sản xuất ADP hoặc ATP bằng thiết bị mảng lò phản ứng femtoliter. Cảm biến ACS. 8, 3400 tầm 3407 (2023).
Noji, H., Minagawa, Y. & Ueno, H. Công nghệ xét nghiệm sinh học kỹ thuật số dựa trên enzyme—các chiến lược chính và triển vọng trong tương lai. Chip phòng thí nghiệm 22, 3092 tầm 3109 (2022).
Cox, KJ, Subramanian, HKK, Samaniego, CC, Franco, E. & Choudhary, A. Một phương pháp phổ biến để phát hiện các hạt nhân liên quan đến CRISPR nhạy cảm và không có tế bào. Chèm. Khoa học. 10, 2653 tầm 2662 (2019).
Sternberg, SH, Redding, S., Jinek, M., Greene, EC & Doudna, JA DNA thẩm vấn bằng endnuclease Cas9 hướng dẫn RNA CRISPR. Thiên nhiên 507, 62 tầm 67 (2014).
Montagne, K., Gines, G., Fujii, T. & Rondelez, Y. Tăng cường chức năng của các mạch DNA tổng hợp bằng cách hủy kích hoạt phù hợp. Nat. Cộng đồng. 7, 13474 (2016).
Gines, G. và cộng sự. Phát hiện kỹ thuật số đẳng nhiệt của microRNA bằng cách sử dụng mạch phân tử không có nền. Khoa học. Tư vấn. 6, eaay5952 (năm 2020).
Shenshin, VA, Lescanne, C., Gines, G. & Rondelez, Y. Giao diện hóa học phân tử nhỏ cho các chương trình phân tử. Axit nucleic Res. 49, 7765 tầm 7774 (2021).
Okumura, S. và cộng sự. Ra quyết định phi tuyến tính với mạng lưới thần kinh enzyme. Thiên nhiên 610, 496 tầm 501 (2022).
Li, Y. và cộng sự. Phát hiện đẳng nhiệt siêu nhạy của SARS-CoV-2 dựa trên sự khuếch đại sử dụng kẹp tóc tự mồi của chuỗi giàu G. Hậu môn. Chèm. 94, 17448 tầm 17455 (2022).
Richardson, CD, Ray, GJ, DeWitt, MA, Curie, GL & Corn, JE Tăng cường chỉnh sửa bộ gen theo hướng tương đồng bằng CRISPR-Cas9 hoạt động xúc tác và không hoạt động bằng cách sử dụng DNA của nhà tài trợ bất đối xứng. Nat. Công nghệ sinh học. 34, 339 tầm 344 (2016).
Raper, AT, Stephenson, AA & Suo, Z. Những hiểu biết sâu sắc về chức năng được tiết lộ bởi cơ chế động học của CRISPR/Cas9. Mứt. Chem. Soc. 140, 2971 tầm 2984 (2018).
Phaneuf, CR và cộng sự. Phát hiện đa loài siêu nhạy của CRISPR-Cas9 bằng nền tảng vi lỏng ly tâm di động. hậu môn. phương pháp 11, 559 tầm 565 (2019).
Trương, X.-P. & Heyer, W.-D. TRONG Tái tổ hợp DNA: Phương pháp và giao thức (ed. Tsubouchi, H.) 329–343 (Humana Press, 2011); https://doi.org/10.1007/978-1-61779-129-1_19
Tanford, C. ở Những tiến bộ trong Hóa học Protein tập. 23 (eds. Anfinsen, CB và cộng sự) 121–282 (Nhà xuất bản Học thuật, 1968).
Berlett, BS & Stadtman, ER Quá trình oxy hóa protein trong quá trình lão hóa, bệnh tật và stress oxy hóa. J. Biol. Chem. 272, 20313 tầm 20316 (1997).
Liu, G., Lin, Q., Jin, S. & Gao, C. Hộp công cụ CRISPR-Cas và công nghệ chỉnh sửa gen. Mol Ô 82, 333 tầm 347 (2022).
Phan, QA, Trường, LB, Medina-Cruz, D., Dincer, C. & Mostafavi, E. Cảm biến sinh học nano chạy bằng CRISPR/Cas để chẩn đoán. Biosens. Điện sinh học. 197, 113732 (2022).
Abate, AR, Hung, T., Mary, P., Agresti, JJ & Weitz, DA Tiêm thông lượng cao bằng vi lỏng sử dụng đầu phun picin. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 107, 19163 tầm 19166 (2010).
Mazutis, L. & Griffiths, AD Sự kết tụ các giọt có chọn lọc bằng hệ thống vi lỏng. Chip phòng thí nghiệm 12, 1800 tầm 1806 (2012).
Mattox, AK và cộng sự. Ứng dụng sinh thiết lỏng trong điều trị ung thư Khoa học. Dịch. Med. 11, eaay1984 (năm 2019).
Heitzer, E., Haque, IS, Roberts, CES & Speicher, MR Quan điểm hiện tại và tương lai của sinh thiết lỏng trong ung thư dựa trên gen. Nat. Mục sư. 20, 71 tầm 88 (2019).
Abbotts, R. & Madhusudan, S. Human AP endnuclease 1 (APE1): từ những hiểu biết cơ học đến mục tiêu có thể sử dụng được trong bệnh ung thư. Điều trị ung thư. Rev. 36, 425 tầm 435 (2010).
Collins, AR & Gaivão, I. Sửa chữa cắt bỏ cơ sở DNA như một dấu ấn sinh học trong nghiên cứu dịch tễ học phân tử. Mol. Asp. Med. 28, 307 tầm 322 (2007).
Zaher, DM và cộng sự. Những tiến bộ gần đây với isoenzym phosphatase kiềm và các chất ức chế chúng. Vòm. Dược phẩm. 353, e2000011 (2020).
Sachsenhauser, V. & Bardwell, JC Định hướng tiến hóa để cải thiện quá trình gấp protein trong cơ thể. Curr. ý kiến. cấu trúc. sinh học. 48, 117 tầm 123 (2018).
Dramé-Maigné, A. và cộng sự. Trong ống nghiệm enzyme tự chọn lọc bằng chương trình phân tử. Tổng hợp ACS. sinh học. https://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00385 (2024).
Xue, Q. & Yeung, ES Sự khác biệt về khả năng phản ứng hóa học của từng phân tử enzyme. Thiên nhiên 373, 681 tầm 683 (1995).
Craig, DB và cộng sự. Sự khác biệt trong hoạt động phân tử đơn trung bình của E. coli β-galactosidase: ảnh hưởng của nguồn, tuổi phân tử enzyme và nhiệt độ cảm ứng. J. Hóa chất Protein. 22, 555 tầm 561 (2003).
Tawfik, DS Sinh học lộn xộn và nguồn gốc của những đổi mới tiến hóa. Nat. Hóa. Biol. 6, 692 tầm 696 (2010).
Willensdorfer, M., Bürger, R. & Nowak, MA Tỷ lệ đột biến kiểu hình và sự phong phú của các protein bất thường trong nấm men. Máy tính PLoS. sinh học. 3, e203 (2007).
Yamagata, A., Masui, R., Kakuta, Y., Kuramitsu, S. & Fukuyama, K. Biểu hiện quá mức, tinh chế và mô tả đặc tính của protein RecJ từ nhiệt ưa nhiệt HB8 và miền cốt lõi của nó. Axit nucleic Res. 29, 4617 tầm 4624 (2001).
Menezes, R., Dramé-Maigné, A., Taly, V., Rondelez, Y. & Gines, G. Các xét nghiệm sinh học kỹ thuật số được sắp xếp hợp lý với bộ thay đổi mẫu in 3D. Phân tích 145, 572 tầm 581 (2019).
Lobato-Dauzier, N. và cộng sự. Buồng silicon để tăng cường quá trình ủ và chụp ảnh các giọt vi lỏng. Chip phòng thí nghiệm 23, 2854 tầm 2865 (2023).
Bắc Kinh, D. và cộng sự. Phát hiện định lượng và nhạy cảm các đột biến hiếm gặp bằng cách sử dụng vi lỏng dựa trên giọt nước. Chip phòng thí nghiệm 11, 2156 tầm 2166 (2011).
- Phân phối nội dung và PR được hỗ trợ bởi SEO. Được khuếch đại ngay hôm nay.
- PlatoData.Network Vertical Generative Ai. Trao quyền cho chính mình. Truy cập Tại đây.
- PlatoAiStream. Thông minh Web3. Kiến thức khuếch đại. Truy cập Tại đây.
- Trung tâmESG. Than đá, công nghệ sạch, Năng lượng, Môi trường Hệ mặt trời, Quản lý chất thải. Truy cập Tại đây.
- PlatoSức khỏe. Tình báo thử nghiệm lâm sàng và công nghệ sinh học. Truy cập Tại đây.
- nguồn: https://www.nature.com/articles/s41565-024-01617-1
