Nielsen, J., Larsson, C., van Maris, A. & Pronk, J. Kỹ thuật trao đổi chất của men để sản xuất nhiên liệu và hóa chất. Curr. Opin. Công nghệ sinh học. 24, 398 tầm 404 (2013).
DiCarlo, JE và cộng sự. kỹ thuật gen trong Saccharomyces cerevisiae sử dụng hệ thống CRISPR-Cas. Axit nucleic Res. 41, 4336 tầm 4343 (2013).
Schwartz, CM, Hussain, MS, Blenner, M. & Wheeldon, I. Các chất xúc tiến RNA polymerase III tổng hợp tạo điều kiện chỉnh sửa bộ gen qua trung gian CRISPR-Cas9 hiệu quả cao trong Yarrowia lipolytica. Tổng hợp ACS. sinh học. 5, 356 tầm 359 (2016).
Raschmanová, H., Weninger, A., Glieder, A., Kovar, K. & Vogl, T. Triển khai các công nghệ CRISPR-Cas trong các loại men thông thường và không thông thường: Hiện trạng và triển vọng trong tương lai. Công nghệ sinh học. Tư vấn. 36, 641 tầm 665 (2018).
Tsai, CS và cộng sự. Quá trình tái cấu trúc nhanh chóng và không có chất đánh dấu của các chủng nấm men lên men xyloza bằng Cas9/CRISPR. Công nghệ sinh học. Bioeng. 112, 2406 tầm 2411 (2015).
Jessop-Fabre, MM và cộng sự. EasyClone-MarkerFree: Một bộ công cụ vector để tích hợp các gen vào Saccharomyces cerevisiae thông qua CRISPR-Cas9. Công nghệ sinh học. NS. 11, 1110 tầm 1117 (2016).
Wang, L. và cộng sự. Chỉnh sửa bộ gen ghép kênh qua trung gian CRISPR-Cas9 hiệu quả trong nấm men. Công nghệ sinh học. Nhiên liệu sinh học 11, 277 (2018).
Liu, Q. và cộng sự. Tích hợp đa vùng gen qua trung gian CRISPR-Cas9 trong Pichia mục sư. Vi mô. Sự thật tế bào. 18, 44 (2019).
Holkenbrink, C. và cộng sự. EasyCloneYALI: Hộp công cụ tổng hợp dựa trên CRISPR/Cas9 dành cho kỹ thuật men Yarrowia lipolytica. Công nghệ sinh học. NS. 13, e1700543 (2018).
Tiếng cười, MF et al. Các vectơ mới để chỉnh sửa bộ gen CRISPR-Cas9 đơn giản và hợp lý trong Saccharomyces cerevisiae. Men 32, 711 tầm 720 (2015).
Cai, P., Gao, J. & Zhou, Y. Chỉnh sửa bộ gen qua trung gian CRISPR trong các loại men phi truyền thống cho các ứng dụng công nghệ sinh học. Vi mô. Sự thật tế bào. 18, 63 (2019).
Kretzschmar, A. et al. Tăng tần số tích hợp tương đồng trong Yarrowia lipolytica các chủng khiếm khuyết trong việc kết thúc không tương đồng. Curr. gen 59, 63 tầm 72 (2013).
Babaei, M. et al. Kỹ thuật nấm men có dầu làm vật chủ để sản xuất axit succinic lên men từ glucose. Mặt trận Bioeng. công nghệ sinh học. 27, 361 (2019).
Gao, C. và cộng sự. Sản xuất mạnh axit succinic từ glycerol thô bằng kỹ thuật Yarrowia lipolytica. Công nghệ sinh học. Nhiên liệu sinh học 9, 179 (2016).
Milne, N. và cộng sự. Kỹ thuật trao đổi chất của Saccharomyces cerevisiae để sản xuất psilocybin de novo và các dẫn xuất tryptamine liên quan. Metab. Tiếng Anh 60, 25 tầm 36 (2020).
Makanae, K., Kintaka, R., Makino, T., Kitano, H. & Moriya, H. Xác định các gen nhạy cảm với liều lượng trong Saccharomyces cerevisiae sử dụng phương pháp kéo co di truyền. Hệ gen Res 23, 300 tầm 311 (2013).
Giaever, G. et al. Hồ sơ chức năng của Saccharomyces cerevisiae bộ gen. Thiên nhiên 418, 387 tầm 391 (2002).
Adames, NR, Gallegos, JE & Peccoud, J. Yeast sàng lọc tương tác di truyền trong thời đại CRISPR/Cas. Curr. gen 65, 307 tầm 327 (2019).
Babaei, M. et al. Mở rộng bộ công cụ EasyClone-MarkerFree cho Saccharomyces cerevisiae bộ gen với các trang web tích hợp mới. Nấm men FEMS Res. 21, foab027 (2021).
Yu, W., Gao, J., Zhai, X. & Zhou, YJ Sàng lọc các vị trí trung lập cho kỹ thuật trao đổi chất của men methylotrophic Ogataea đa hình. Synth. Syst. Công nghệ sinh học. 6, 63 tầm 68 (2021).
Li, M. và cộng sự. Tích hợp đa gen qua trung gian CRISPR cho phép tái cấu trúc con đường Shikimate để tăng cường sinh tổng hợp 2-phenylethanol trong Kluyveromyces marxianus. Công nghệ sinh học. Nhiên liệu sinh học 14, 3 (2021).
Brady, JR và cộng sự. Xác định các vị trí được cải thiện để tích hợp gen dị loại bằng ATAC-seq. Tổng hợp ACS. sinh học. 9, 2515 tầm 2524 (2020).
Lee, ME, DeLoache, WC, Cervantes, B. & Dueber, JE Một bộ công cụ men có đặc tính cao dành cho lắp ráp nhiều phần, mô-đun. Tổng hợp ACS. sinh học. 4, 975 tầm 986 (2015).
Nguyen, N., Quail, MMF & Hernday, AD Một hệ thống hiệu quả, nhanh chóng và có thể tái chế để chỉnh sửa bộ gen qua trung gian sắc nét trong Candida albicans. mSphere 2, e00149–17 (2017).
Gowers, G.-OF và cộng sự. Cải thiện quá trình sinh tổng hợp axit betulinic bằng cách sử dụng tái tổ hợp nhiễm sắc thể nấm men tổng hợp và sàng lọc LC-MS nhanh bán tự động. Nat. Cộng đồng. 11, 868 (2020).
Zhang, Y. và cộng sự. Một mảng gRNA-tRNA để chỉnh sửa bộ gen ghép kênh nhanh dựa trên CRISPR-Cas9 trong Saccharomyces cerevisiae. Nat. Cộng đồng. 10, 1053 (2019).
Li, XT và cộng sự. tCRISPRi: có thể điều chỉnh và đảo ngược, kiểm soát một bước biểu hiện gen. Khoa học Dân biểu 6, 39076 (2016).
McCleary, WR Ứng dụng các kỹ thuật hoán đổi trình khởi động để kiểm soát sự biểu hiện của gen nhiễm sắc thể. Ứng dụng Công nghệ sinh học Microbiol. 84, 641 tầm 648 (2009).
Rajkumar, AS, Varela, JA, Juergens, H., Daran, J.-MG & Morrissey, JP Các bộ phận sinh học cho Kluyveromyces marxianus sinh học tổng hợp. Mặt trận Bioeng. công nghệ sinh học. 7, 97 (2019).
Weninger, A. et al. Mở rộng bộ công cụ CRISPR/Cas9 cho Pichia mục sư với sự tích hợp hiệu quả của nhà tài trợ và các dấu hiệu kháng thuốc thay thế. J. Hóa sinh tế bào 119, 3183 tầm 3198 (2018).
Storici, F., Durham, CL, Gordenin, DA & Resnick, MA Các đứt gãy sợi đôi đặc hiệu tại vị trí nhiễm sắc thể được nhắm mục tiêu hiệu quả để sửa chữa bởi các oligonucleotide trong men. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 100, 14994 tầm 14999 (2003).
Park, YK & Ledesma-Amaro, R. Điều gì tạo nên Yarrowia lipolytica rất thích hợp cho ngành công nghiệp? Xu hướng Biotechnol. 41, 242 tầm 254 (2023).
Larroude, M., Trabelsi, H., Nicaud, J.-M. & Rossignol, T. Một bộ Yarrowia lipolytica Các vectơ CRISPR/Cas9 để khai thác tính đa dạng của chủng loại hoang dã. Công nghệ sinh học. Lett. 42, 773 tầm 785 (2020).
Baisya, D., Ramesh, A., Schwartz, C., Lonardi, S. & Wheeldon, I. Các màn hình chức năng trên toàn bộ bộ gen cho phép dự đoán các hướng dẫn CRISPR-Cas9 và -Cas12a hoạt động cao trong Yarrowia lipolytica. Nat. Cộng đồng. 13, 922 (2022).
Schwartz, C. & Wheeldon, I. Chỉnh sửa bộ gen qua trung gian CRISPR-Cas9 và kiểm soát phiên mã trong Yarrowia lipolytica. Phương pháp Mol. Biol. 1772, 327 tầm 345 (2018).
Celińska, E. et al. Hệ thống lắp ráp Golden Gate dành riêng cho thao tác đường dẫn phức tạp trong Yarrowia lipolytica. Vi mô. công nghệ sinh học. 10, 450 tầm 455 (2017).
Larroude, M. et al. Bộ công cụ Cổng Vàng dạng mô-đun dành cho Yarrowia lipolytica sinh học tổng hợp. Vi mô. công nghệ sinh học. 12, 1249 tầm 1259 (2019).
Li, YW và cộng sự. YALIcloneNHEJ: Bộ công cụ nhân bản mô-đun hiệu quả để tích hợp NHEJ của con đường đa gen và sản xuất terpenoid trong Yarrowia lipolytica. Mặt trận Bioeng. công nghệ sinh học. 9, 816980 (2021).
Egermeier, M., Sauer, M. & Marx, H. Chiến lược kỹ thuật trao đổi chất dựa trên Cổng Vàng cho các chủng vi khuẩn dại Yarrowia lipolytica. Giấy phép vi sinh vật FEMS. 366, fnz022 (2019).
Bredeweg, EL và cộng sự. Một hộp công cụ di truyền phân tử cho Yarrowia lipolytica. Công nghệ sinh học. Nhiên liệu sinh học 10, 2 (2017).
Wong, L., Engel, J., Jin, E., Holdridge, B. & Xu, P. YaliBricks, một bộ công cụ di truyền linh hoạt cho kỹ thuật con đường nhanh chóng và hợp lý hóa trong Yarrowia lipolytica. Metab. Tiếng Anh Commun. 5, 68 tầm 77 (2017).
He, Q., Szczepańska, P., Yuzbashev, TV, Lazar, Z. & Ledesma-Amaro, R. De novo sản xuất resveratrol từ glycerol bằng cách thiết kế các con đường trao đổi chất khác nhau trong Yarrowia lipolytica. Metab. Tiếng Anh Commun. 11, e00146 (2020).
Juretzek, T. và cộng sự. Các vectơ biểu hiện và khuếch đại gen trong nấm men Yarrowia lipolytica. Men 18, 97 tầm 113 (2001).
Albert, H., Dale, EC, Lee, E. & Ow, DW Tích hợp DNA theo từng vị trí cụ thể vào các vị trí lox hoang dại và đột biến được đặt trong bộ gen thực vật. Nhà máy J. 7, 649 tầm 659 (1995).
Martínez, LM, Martinez, A. & Gosset, G. Sản xuất melanin bằng vi sinh vật tái tổ hợp. Mặt trận Bioeng. công nghệ sinh học. 7, 285 (2019).
Shen, B. và cộng sự. Quá trình lên men sản xuất Vitamin E tocotrienols trong Saccharomyces cerevisiae dưới sự kiểm soát nhiệt độ do sốc lạnh. Nat. Cộng đồng. 11, 5155 (2020).
Ben Tahar, I., Kus-Liśkiewicz, M., Lara, Y., Javaux, E. & Fickers, P. Đặc tính của sắc tố pyomelanin không độc do nấm men tạo ra Yarrowia lipolytica. Công nghệ sinh học. Prog. 36, e2912 (2020).
Luttik, MAH và cộng sự. Giảm ức chế phản hồi trong Saccharomyces cerevisiae sinh tổng hợp axit amin thơm: định lượng tác động trao đổi chất. Metab. Tiếng Anh 10, 141 tầm 153 (2008).
Sản xuất Lütke-Eversloh, T. & Stephanopoulos, G. L-tyrosine bởi các chủng vi khuẩn đã được bãi bỏ quy định Escherichia coli. Appl. Vi sinh. Công nghệ sinh học. 75, 103 tầm 110 (2007).
Chao, YP, Lai, ZJ, Chen, P. & Chern, JT Tăng cường tỷ lệ chuyển đổi của L-phenylalanine bằng phản ứng kết hợp của aminotransferase và phosphoenolpyruvate carboxykinase trong Escherichia coli K-12. Công nghệ sinh học. Prog. 15, 453 tầm 458 (1999).
Romagnoli, G. và cộng sự. xóa của Saccharomyces cerevisiae ARO8 gen, mã hóa một axit amin thơm transaminase, tăng cường sản xuất phenylethanol từ glucose. Men 32, 29 tầm 45 (2015).
Liu, Q. và cộng sự. Tái tạo quá trình chuyển hóa carbon trong men để sản xuất hóa chất thơm ở mức độ cao. Nat. Cộng đồng. 10, 4976 (2019).
Gu, Y., Ma, J., Zhu, Y., Ding, X. & Xu, P. Engineering Yarrowia lipolytica như một khung gầm để tổng hợp de novo năm sản phẩm và hóa chất tự nhiên có nguồn gốc thơm. Tổng hợp ACS. sinh học. 9, 2096 tầm 2106 (2020).
Larroude, M., Onésime, D., Rué, O., Nicaud, JM & Rossignol, T. A Yarrowia lipolytica chủng được thiết kế để sản xuất pyomelanin. Vi sinh vật 9, 838 (2021).
Schmaler-Ripcke, J. et al. Sản xuất pyomelanin, một loại melanin thứ hai, thông qua con đường thoái hóa tyrosine trong một loại nấm thuộc chi Aspergillus. Môi trường ứng dụng. vi sinh vật 75, 493 tầm 503 (2009).
Fernández-Cañón, JM & Peñalva, MA Đặc điểm của gen isomerase maleylacetoacetate của nấm và xác định tương đồng của con người. J. Biol. Chem. 273, 329 tầm 337 (1998).
Bassel, J., Hambright, P., Mortimer, R. & Bearden, AJ Đột biến của men Saccharomycopsis lipolytica tích lũy và bài tiết protorphyrin IX. J. Vi khuẩn. 123, 118 tầm 122 (1975).
Barth, G. & Weber, H. Nghiên cứu di truyền về nấm men Saccharomycopsis lipolytica. Bất hoạt và gây đột biến. Z. Allg. Mikrobiol. 23, 147 tầm 157 (1983).
Tai, M. & Stephanopoulos, G. Kỹ thuật đẩy và kéo quá trình sinh tổng hợp lipid trong men dầu Yarrowia lipolytica để sản xuất nhiên liệu sinh học. Metab. Tiếng Anh 15, 1 tầm 9 (2013).
Larroude, M., Rossignol, T., Nicaud, JM & Ledesma-Amaro, R. Công cụ sinh học tổng hợp cho kỹ thuật Yarrowia lipolytica. Công nghệ sinh học. Tư vấn. 36, 2150 tầm 2164 (2018).
Xiong, X. & Chen, S. Mở rộng hộp công cụ biểu hiện gen của Yarrowia lipolytica để bao gồm các chất xúc tiến mới có thể cảm ứng, có thể kìm nén và lai. Tổng hợp ACS. sinh học. 9, 2208 tầm 2213 (2020).
Zhao, Y. và cộng sự. Chiến lược kỹ thuật promoter lai trong Yarrowia lipolytica: sản xuất rượu isoamyl như một nghiên cứu thử nghiệm. Công nghệ sinh học. Nhiên liệu sinh học 14, 149 (2021).
Fernández-Cañón, JM et al. Những con chuột thiếu men Maleylacetoacetate isomerase (MAAI/GSTZ) tiết lộ một quá trình bỏ qua không gây men phụ thuộc glutathione trong quá trình dị hóa tyrosine. mol. Tế bào sinh học. 22, 4943 tầm 4951 (2002).
Yuzbasheva, EY và cộng sự. Chất mang citrate ty thể trong Yarrowia lipolytica: Nhận dạng, đặc tính và ý nghĩa chức năng của nó đối với việc sản xuất axit xitric. Metab. Tiếng Anh 54, 264 tầm 274 (2019).
Sambrook, J., Fritsch, EF & Maniatis, T. Nhân bản phân tử: Sổ tay phòng thí nghiệm. (Phòng thí nghiệm Cold Spring Harbor, 1989). https://books.google.co.uk/books/about/Molecular_Cloning.html?id=8WViPwAACAAJ&redir_esc=y. Truy cập tháng 3 23, 2023.
Gibson, DG và cộng sự. Sự lắp ráp enzym của các phân tử DNA lên đến vài trăm kilobase. Nat. Phương pháp 6, 343 tầm 345 (2009).
Weber, E., Engler, C., Gruetzner, R., Werner, S. & Marillonnet, S. Một hệ thống nhân bản mô-đun để lắp ráp tiêu chuẩn hóa các cấu trúc đa gen. PLoS One 6, e16765 (2011).
Yu, D. và cộng sự. Một hệ thống tái tổ hợp hiệu quả cho kỹ thuật nhiễm sắc thể trong Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa Kỳ 97, 5978 tầm 5983 (2000).
Datsenko, KA & Wanner, BL Bất hoạt một bước các gen nhiễm sắc thể trong Escherichia coli K-12 sử dụng sản phẩm PCR. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa Kỳ 97, 6640 tầm 6645 (2000).
Russell, CB & Dahlquist, FW Trao đổi các alen nhiễm sắc thể và plasmid trong Escherichia coli bằng cách chọn lọc để mất dấu hiệu nhạy cảm với kháng sinh chiếm ưu thế. J. Vi khuẩn. 171, 2614 tầm 2618 (1989).
Shabbir Hussain, M., Gambill, L., Smith, S. & Blenner, MA Kiến trúc bộ khởi động kỹ thuật trong men có dầu Yarrowia lipolytica. Tổng hợp ACS. sinh học. 5, 213 tầm 223 (2016).
Borsenberger, V. et al. Nhiều tham số thúc đẩy hiệu quả của việc sửa đổi gen do CRISPR/Cas9 gây ra trong Yarrowia lipolytica. J. Mol. sinh học. 430, 4293 tầm 4306 (2018).
Blazeck, J., Liu, L., Redden, H. & Alper, H. Điều chỉnh biểu hiện gen trong Yarrowia lipolytica bằng cách tiếp cận promoter lai. ứng dụng môi trường. vi sinh vật 77, 7905 tầm 7914 (2011).
- Phân phối nội dung và PR được hỗ trợ bởi SEO. Được khuếch đại ngay hôm nay.
- PlatoData.Network Vertical Generative Ai. Trao quyền cho chính mình. Truy cập Tại đây.
- PlatoAiStream. Thông minh Web3. Kiến thức khuếch đại. Truy cập Tại đây.
- Trung tâmESG. Ô tô / Xe điện, Than đá, công nghệ sạch, Năng lượng, Môi trường Hệ mặt trời, Quản lý chất thải. Truy cập Tại đây.
- PlatoSức khỏe. Tình báo thử nghiệm lâm sàng và công nghệ sinh học. Truy cập Tại đây.
- ChartPrime. Nâng cao trò chơi giao dịch của bạn với ChartPrime. Truy cập Tại đây.
- BlockOffsets. Hiện đại hóa quyền sở hữu bù đắp môi trường. Truy cập Tại đây.
- nguồn: https://www.nature.com/articles/s42003-023-05202-5
