Mitchell, RS et al. Vpu đối kháng với việc hạn chế giải phóng HIV-2 qua trung gian BST-1 thông qua beta-TrCP và buôn bán nội lysosomal. PLoS Pathhog. 5, e1000450 (2009).
Roy, N., Pacini, G., Berlioz-Torrent, C. & Janvier, K. Các cơ chế phát tán virus qua trung gian HIV-1 Vpu. Trước mặt. Microbiol. 5, 177 (2014).
Strebel, K., Klimkait, T. & Martin, MA Một gen mới của HIV-1, vpu và sản phẩm 16 kilodalton của nó. Khoa học 241, 1221 tầm 1223 (1988).
Gonzalez, ME Vpu protein: Viroporin được mã hóa bởi HIV-1. Virus 7, 4352 tầm 4368 (2015).
Khan, N. & Geiger, JD Vai trò của protein U (Vpu) của virus trong nhiễm trùng và sinh bệnh học HIV-1. Virus 13, 1466 (2021).
Dube, M., Bego, MG, Paquay, C. & Cohen, EA Điều chế tương tác giữa vật chủ HIV-1: Vai trò của protein phụ kiện Vpu. Nghiên cứu retrovirus 7, 114 (2010).
Cohen, EA, Terwilliger, EF, Sodroski, JG & Haseltine, WA Xác định protein được mã hóa bởi gen vpu của HIV-1. Thiên nhiên 334, 532 tầm 534 (1988).
Strebel, K., Klimkait, T., Maldarelli, F. & Martin, MA Phân tích phân tử và sinh hóa của protein vpu loại 1 của virus gây suy giảm miễn dịch ở người. J.Virol. 63, 3784 tầm 3791 (1989).
Ramirez, PW et al. Các yếu tố hạn chế liên quan đến màng huyết tương và sự chống lại chúng của các protein phụ HIV-1. Tế bào 8, 1020 (2019).
Hussain, A., Das, SR, Tanwar, C. & Jameel, S. Quá trình oligome hóa của virus gây suy giảm miễn dịch ở người loại 1 (HIV-1) Vpu protein – một phân tích di truyền, sinh hóa và sinh lý. Viro. J. 4, 81 (2007).
Langer, S. et al. HIV-1 Vpu là chất ức chế phiên mã mạnh mẽ các phản ứng miễn dịch kháng virus do NF-kappaB tạo ra. Elife https://doi.org/10.7554/eLife.41930 (2019).
Mẹ, C. et al. Biểu hiện, tinh chế và hoạt động của các phiên bản đầy đủ và rút gọn của protein màng tích hợp Vpu từ HIV-1. Protein khoa học. 11, 546 tầm 557 (2002).
Maldarelli, F., Chen, MY, Willey, RL & Strebel, K. Protein Vpu loại 1 của virus gây suy giảm miễn dịch ở người là một loại protein màng nguyên chất loại I. J.Virol. 67, 5056 tầm 5061 (1993).
Neil, SJ, Sandrin, V., Sundquist, WI & Bieniasz, PD Cơ chế liên kết do interferon-alpha gây ra ức chế sự giải phóng hạt vi rút HIV-1 và Ebola nhưng bị phản tác dụng bởi protein Vpu HIV-1. Máy chủ tế bào vi khuẩn 2, 193 tầm 203 (2007).
Neil, SJ, Zang, T. & Bieniasz, PD Tetherin ức chế sự giải phóng retrovirus và bị HIV-1 Vpu đối kháng. Thiên nhiên 451, 425 tầm 430 (2008).
Majeed, S. et al. Hiểu biết sâu sắc về cấu trúc oligomeric của protein Vpu HIV-1. J. Kết cấu. Biol. 215, 107943 (2023).
Hsu, YT, Wolter, KG & Youle, RJ Cytosol phân phối lại màng của Bax và Bcl-X(L) trong quá trình apoptosis. Proc. Natl. Acad Khoa học. Hoa Kỳ 94, 3668 tầm 3672 (1997).
Lesieur, C., Vecsey-Semjen, B., Abrami, L., Fivaz, M. & Gisou van der Goot, F. Chèn màng: Các chiến lược của chất độc (đánh giá). Mol. Thành viên. Biol. 14, 45 tầm 64 (1997).
Scheres, SH RELION: Triển khai phương pháp Bayesian để xác định cấu trúc cryo-EM. J. Kết cấu. Biol. 180, 519 tầm 530 (2012).
Tăng, G. et al. EMAN2: Bộ xử lý hình ảnh có thể mở rộng cho kính hiển vi điện tử. J. Kết cấu. Biol. 157, 38 tầm 46 (2007).
Bell, JM, Chen, M., Baldwin, PR & Ludtke, SJ Tinh chỉnh hạt đơn có độ phân giải cao trong EMAN2.1. Phương pháp 100, 25 tầm 34 (2016).
Bell, JM, Chen, M., Durmaz, T., Fluty, AC & Ludtke, SJ Các công cụ phần mềm mới trong EMAN2 lấy cảm hứng từ thử thách bản đồ EMDatabank. J. Kết cấu. Biol. 204, 283 tầm 290 (2018).
Henderson, R. et al. Kết quả của cuộc họp nhóm đặc nhiệm xác nhận kính hiển vi điện tử đầu tiên. Structure 20, 205 tầm 214 (2012).
Ludtke, SJ Phân tích độ biến thiên và sàng lọc hạt đơn trong EMAN2.1. Phương pháp Enzymol. 579, 159 tầm 89 (2016).
Chen, M. & Ludtke, SJ Mô hình hỗn hợp Gaussian đa chiều dựa trên học tập sâu để mô tả đặc tính biến đổi trong Cryo-EM. Nat. Phương pháp 18, 930 tầm 936 (2021).
Borbat, PP & Freed, JH Cộng hưởng spin electron lưỡng cực xung: Đo khoảng cách. Cấu trúc. Thông tin Thông số nội tại của nhãn Spin. Cent. Sinh học. 152, 1 tầm 82 (2014).
Đo khoảng cách Jeschke, G. DEER trên protein. Annu. Rev. Phys. Chèm. 63, 419 tầm 446 (2012).
Milov, AD, Ponomarev, AB & Tsvetkov, YD Nhịp điệu điều chế tín hiệu cộng hưởng electron-electron kép trong tiếng vang spin cho các hệ thống hai cực. J. Cấu trúc. Chem. 25, 710 tầm 713 (1984).
Borbat, PP, Georgieva, ER & Freed, JH Cải thiện độ nhạy cho các phép đo khoảng cách xa trong các phân tử sinh học: Cộng hưởng electron-electron kép năm xung. J. Vật lý. Hóa. Lett. 4, 170 tầm 175 (2013).
Borbat, PP, Crepeau, RH & Freed, JH Biến đổi Fourier hai chiều đa tần số ESR: Máy quang phổ băng tần X/Ku. J. Magn. cộng hưởng. 127, 155 tầm 167 (1997).
Jeschke, G. & Polyhach, Y. Đo khoảng cách trên các đại phân tử sinh học được gắn nhãn spin bằng cộng hưởng thuận từ điện tử xung. Vật lý. Hóa. Hóa. Vật lý. 9, 1895 tầm 1910 (2007).
Gamliel, D. & Freed, JH Lý thuyết về ESR 2 chiều với sự điều biến hạt nhân. J. Magn. cộng hưởng. 89, 60 tầm 93 (1990).
Borbat, PP & Freed, JH Pulse lưỡng cực ESR: Đo khoảng cách. TRONG Cấu trúc và liên kết Tập. 152 (eds Timmel, CR & Harmer, JR) 1–82 (Springer Heidelberg, 2014).
Tăng, SG et al. Cơ sở cấu trúc để kích hoạt, lắp ráp và liên kết màng của sợi ESCRT-III Snf7. Elife https://doi.org/10.7554/eLife.12548 (2015).
Borbat, PP & Freed, JH Đo khoảng cách bằng quang phổ ESR lưỡng cực xung: Histidine kinase có nhãn spin. Phương pháp Enzymol. 423, 52 tầm 116 (2007).
Đo khoảng cách Jeschke, G. DEER trên protein. Ann. Rev. Phys. Chèm. 63, 419 tầm 446 (2012).
Cabra, V. & Samso, M. Nên và không nên làm đối với kính hiển vi điện tử đông lạnh: Tài liệu cơ bản về chuẩn bị mẫu và thu thập dữ liệu chất lượng cao để tái tạo mô hình 3D phân tử. J. Vis. Hết hạn. https://doi.org/10.3791/52311 (2015).
Cooper, RS, Georgieva, ER, Borbat, PP, Freed, JH & Heldwein, EE Cơ sở cấu trúc để neo màng và điều hòa phản ứng tổng hợp của virus herpes simplex fusogen gB. Nat. Kết cấu. Mol. Biol. 25, 416 tầm 424 (2018).
Georgieva, ER, Xiao, S., Borbat, PP, Freed, JH & Eliezer, D. Tau liên kết với các bề mặt màng lipid thông qua các vòng xoắn lưỡng tính ngắn nằm trong các đoạn lặp liên kết với vi ống của nó. Sinh lý. J. 107, 1441 tầm 1452 (2014).
Georgieva, ER Nanoscale mô phỏng màng lipid trong nghiên cứu quang phổ cộng hưởng thuận từ và ghi nhãn spin về cấu trúc và chức năng của protein. Công nghệ nano. Rev. 6, 75 tầm 92 (2017).
Torricella, F., Pierro, A., Mileo, E., Belle, V. & Bonucci, A. Nhãn quay Nitroxide và quang phổ EPR: Một sự liên kết mạnh mẽ cho các nghiên cứu động lực học protein. sinh học. lý sinh học. Acta Protein Proteom. 1869, 140653 (2021).
McHaourab, HS, Steed, PR & Kazmier, K. Hướng tới chiều thứ tư của cấu trúc protein màng: Hiểu biết sâu sắc về động lực học từ quang phổ EPR dán nhãn spin. Structure 19, 1549 tầm 1561 (2011).
Zhang, H., Lin, EC, Das, BB, Tian, Y. & Opella, SJ Xác định cấu trúc của protein virus U từ HIV-1 bằng NMR trong môi trường màng. Sinh học. Sinh lý. Acta 1848, 3007 tầm 3018 (2015).
Willbold, D., Hoffmann, S. & Rosch, P. Cấu trúc thứ cấp và nếp gấp bậc ba của miền tế bào chất protein U (Vpu) của virus gây suy giảm miễn dịch ở người trong dung dịch. Eur. J. Hóa sinh. 245, 581 tầm 588 (1997).
Borbat, PP, Georgieva, ER & Freed, JH Cải thiện độ nhạy cho các phép đo khoảng cách xa trong các phân tử sinh học: Cộng hưởng electron-electron kép năm xung. J. Vật lý. Hóa. Lett. 4, 170 tầm 175 (2013).
Georgieva, ER et al. Ảnh hưởng của điều kiện đóng băng đến khoảng cách và sự phân bố của chúng bắt nguồn từ cộng hưởng electron kép (DEER): Một nghiên cứu về lysozyme T4 có nhãn spin kép. J. Magn. cộng hưởng. 216, 69 tầm 77 (2012).
Georgieva, ER, Borbat, PP, Ginter, C., Freed, JH & Boudker, O. Tập hợp hình dạng của chất vận chuyển aspartate kết hợp với natri. Nat. Kết cấu. Mol. Biol. 20, 215 tầm 221 (2013).
Borbat, PP et al. Chuyển động hình dạng của chất vận chuyển ABC MsbA gây ra bởi quá trình thủy phân ATP. Sinh học PLoS. 5, e271 (2007).
Borbat, PP, McHaourab, HS & Freed, JH Xác định cấu trúc protein bằng cách sử dụng các ràng buộc khoảng cách xa từ ESR kết hợp lượng tử kép: nghiên cứu về lysozyme T4. Mứt. Chem. Soc. 124, 5304 tầm 5314 (2002).
Douglas, JL et al. Vpu điều khiển sự suy thoái của yếu tố hạn chế virus gây suy giảm miễn dịch ở người BST-2/Tetherin thông qua cơ chế phụ thuộc TrCP {beta. J.Virol. 83, 7931 tầm 7947 (2009).
Ewart, GD, Sutherland, T., Gage, PW & Cox, GB Protein Vpu của virus gây suy giảm miễn dịch ở người loại 1 tạo thành các kênh ion chọn lọc cation. J.Virol. 70, 7108 tầm 7115 (1996).
Phân tích kính hiển vi điện tử Nygaard, R., Kim, J. & Mancia, F. của các protein màng nhỏ. Curr. ý kiến. cấu trúc. sinh học. 64, 26 tầm 33 (2020).
Coscia, F. et al. Sự kết hợp với giàn giáo oligomeric đồng nhất cho phép phân tích cryo-EM của một loại protein nhỏ. Khoa học Dân biểu 6, 30909 (2016).
Selmke, B. et al. Dạng mở và đóng của protein liên kết maltose ở trạng thái hình cầu tự nhiên và nóng chảy được nghiên cứu bằng phương pháp quang phổ cộng hưởng thuận từ điện tử. Sinh vật hóa học 57, 5507 tầm 5512 (2018).
Chen, CP et al. Sự lắp ráp protein màng: Hai vị trí serine được phosphoryl hóa trong tế bào chất của Vpu từ HIV-1 ảnh hưởng đến quá trình oligome hóa. Khoa học Dân biểu 6, 28866 (2016).
Lu, JX, Sharpe, S., Ghirlando, R., Yau, WM & Tycko, R. Trạng thái oligome hóa và cấu trúc siêu phân tử của đoạn xuyên màng protein Vpu HIV-1 trong lớp kép phospholipid. Protein khoa học. 19, 1877 tầm 1896 (2010).
Sharpe, S., Yau, WM & Tycko, R. Cấu trúc và động lực của miền xuyên màng Vpu HIV-1 được tiết lộ bởi NMR trạng thái rắn với khả năng quay góc ma thuật. Sinh vật hóa học 45, 918 tầm 933 (2006).
Park, SH, De Angelis, AA, Nevzorov, AA, Wu, CH & Opella, SJ Cấu trúc ba chiều của miền xuyên màng của Vpu từ HIV-1 trong các bicelle phospholipid thẳng hàng. Sinh lý. J. 91, 3032 tầm 3042 (2006).
Stangl, M. & Schneider, D. Cạnh tranh chức năng trong màng: Nhận biết lipid so với quá trình oligome hóa xoắn ốc xuyên màng. Sinh học. Sinh lý. Acta 1848, 1886 tầm 96 (2015).
- Phân phối nội dung và PR được hỗ trợ bởi SEO. Được khuếch đại ngay hôm nay.
- PlatoData.Network Vertical Generative Ai. Trao quyền cho chính mình. Truy cập Tại đây.
- PlatoAiStream. Thông minh Web3. Kiến thức khuếch đại. Truy cập Tại đây.
- Trung tâmESG. Ô tô / Xe điện, Than đá, công nghệ sạch, Năng lượng, Môi trường Hệ mặt trời, Quản lý chất thải. Truy cập Tại đây.
- PlatoSức khỏe. Tình báo thử nghiệm lâm sàng và công nghệ sinh học. Truy cập Tại đây.
- ChartPrime. Nâng cao trò chơi giao dịch của bạn với ChartPrime. Truy cập Tại đây.
- BlockOffsets. Hiện đại hóa quyền sở hữu bù đắp môi trường. Truy cập Tại đây.
- nguồn: https://www.nature.com/articles/s41598-023-41873-0
