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全長単一分子タンパク質のフィンガープリンティング – Nature Nanotechnology

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  • Aebersold、R. et al.ヒトのプロテオフォームは何種類あるのでしょうか? Nat。 Chem。 バイオ 14、206 –214(2018)

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    Google Scholarの
     

  • Kim、HK、Pham、MHC、Ko、KS、Rhee、BD、Han、J。健康と病気における選択的スプライシング アイソフォーム。 プフルゲルアーチ。 470、995 –1016(2018)

  • Paronetto, MP、Passacantilli, I. & Sette, C. 選択的スプライシングと細胞生存: 組織恒常性から疾患まで。 細胞死は異なります。 23、1919 –1929(2016)

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    Google Scholarの
     

  • Lin, H. & Caroll, KS はじめに: 翻訳後タンパク質修飾。 Chem。 牧師 118、887 –888(2018)

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    Google Scholarの
     

  • Carbonara, K.、Andonovski, M. & Coorssen, JR プロテオームはプロテオフォームであり、複雑さを受け入れています。 プロテオーム 9、38(2021)

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  • Benson, MD、Ngo, D.、Ganz, P. & Gerszten, RE ハイスループットプロテオミクス向けの新たなアフィニティー試薬: 信頼しますが、検証してください。 循環 140、1610 –1612(2019)

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    Google Scholarの
     

  • ヤン、Yら。糖タンパク質分析におけるハイブリッド質量分析アプローチと、生物学的類似性のスコアリングにおけるその使用。 Nat。 コミュニ 7、13397(2016)

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  • Čaval, T.、Tian, W.、Yang, Z.、Clausen, H. & Heck, AJR 糖鎖操作エリスロポエチン変異体の直接品質管理。 Nat。 コミュニ 9、3342(2018)

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    Google Scholarの
     

  • Siuti, N. & Kelleher, NL トップダウン質量分析法を使用したタンパク質修飾の解読。 Nat。 方法 410、817 –821(2007)

    記事 

    Google Scholarの
     

  • Wang, Y.、Zhao, Y.、Bollas, A.、Wang, Y. & Au、KF ナノポア シーケンス テクノロジー、バイオインフォマティクスおよびアプリケーション。 Nat。 バイオテクノロジー。 39、1348 –1365(2021)

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    Google Scholarの
     

  • Ardui, S.、Ameur, A.、Vermeesch, JR & Hestand, MS 単一分子リアルタイム (SMRT) シークエンシングの時代が到来: 医療診断用のアプリケーションとユーティリティ。 核酸リサーチ 46、2159 –2168(2018)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Restrepo-Pérez, L.、Joo, C.、Dekker, C. 単一分子タンパク質配列決定への道を開く。 Nat。 ナノテク。 13、786 –796(2018)

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    Google Scholarの
     

  • アルファロ、JA et al.単一分子タンパク質配列決定技術の新たな状況。 Nat。 方法 18、604 –617(2021)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • フロイド、BM & マルコット、EM タンパク質配列決定、一度に 1 分子。 アンヌ。 バイオフィス牧師。 51、181 –200(2022)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Timp, W. & Timp, G. 質量分析を超えた、プロテオミクスの次のステップ。 サイエンス。 前売 6、eaax8978(2020)。

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    Google Scholarの
     

  • Swaminathan, J.、Boulgakov, AA & Marcotte, EM 単一分子ペプチド配列決定の理論的正当性。 PLoS計算。 Biol。 11、eXNUMX(XNUMX)。

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Rodriques, SG、Marblestone, AH & Boyden, ES 弱い結合スペクトルによる単一分子タンパク質の配列決定の理論的分析。 PLoSのONE 14、eXNUMX(XNUMX)。

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Yao, Y.、Docter, M.、Van Pinkel, J.、De Ridder, D. & Joo, C. フィンガープリンティングによる単一分子タンパク質の配列決定: コンピューターによる評価。 物理学。 バイオル。 12、10 –16(2015)

    記事 

    Google Scholarの
     

  • de Lannoy、CV 他。単一分子タンパク質フィンガープリンティングのための FRET X の評価。 アイサイエンス 24、103239(2021)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Yu、L.ら。ナノポアを通した全長タンパク質の一方向一列輸送。 ナット。 バイオテクノロジー. 41、1130 –1139(2023)

  • ヴァン・ギンケル、J. 他単一分子ペプチドのフィンガープリンティング。 手順 Natl Acad サイ。 米国 115、3338 –3343(2018)

  • スワミナサン、J. et al.ゼプトモルスケールの混合物中のタンパク質の単一分子を高度に並行して同定します。 Nat。 バイオテクノロジー。 36、1076 –1082(2018)

    記事 
    CAS 

    Google Scholarの
     

  • シュレスタ、P. et al. DNA ナノスイッチ キャリパーを使用した単一分子の機械的フィンガープリンティング。 Nat。 ナノテク. 16、1362 –1370(2021)

  • Filius, M.、Kim, SH、Severins, I. & Joo, C. DNA 交換による高分解能単一分子 FRET (FRET X)。 ナノレット。 21、3295 –3301(2021)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • M. フィリウス、R. ヴァン ウィー、C. ジュー 単一分子分析: 方法とプロトコル (ヘラー編、I. 他)203–213(Springer、2024)。

  • Van Wee, R.、Filius, M. & Joo, C. キャンバスの完成: DNA-PAINT 超解像度イメージングの進歩と課題。 トレンド生化学。 科学 11、918 –930(2021)


    Google Scholarの
     

  • Schnitzbauer, J.、Strauss, MT、Schlichthaerle, T.、Schueder, F. & Jungmann, R. DNA-PAINT による超解像顕微鏡。 Nat。 プロトタイプ。 12、1198 –1228(2017)

    記事 
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    PubMedの 

    Google Scholarの
     

  • Shi、Xら。単一分子イメージングのためのアルデヒドタグ付きタンパク質の定量的蛍光標識。 Nat。 方法 9、499 –503(2012)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Schuler, B. & Hofmann, H. タンパク質フォールディングダイナミクスの単一分子分光法 - 範囲とタイムスケールの拡大。 現在。 意見。 構造。 生物。 23、36 –47(2013)

    記事 
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    PubMedの 

    Google Scholarの
     

  • Yang, X. & Qian, K. プロテイン O-GlcNAc化: 新たなメカニズムと機能。 ナットモル牧師CellBiol。 18、452 –465(2017)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Vellosillo, P. & Minguez, P. タンパク質の翻訳後修飾の種類とヒトの遺伝病との関連性を示す世界地図。 アイサイエンス 24、102917(2021)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • マウリ、T.ら。 O-GlcNAc化の予測: 未達成の目標。 上級応用バイオインフォーム。化学。 14、87 –102(2021)

  • Shi、J.、Ruijtenbeek、R. & Pieters、RJ の謎を解く O-GlcNAc化: ペプチド基質からのヒント。 糖鎖生物学 28、814 –824(2018)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • シェン、DLら。触媒的な乱交 O-GlcNAc トランスフェラーゼは、2-アジド-2-デオキシ-グルコースを使用した細胞質タンパク質の予期せぬ代謝工学を可能にします。 ACS Chem。 バイオル。 12、206 –213(2017)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Mayer, A.、Gloster, TM、Chou, WK、Vocadlo、DJ & Tanner、ME 6'-Azido-6'-deoxy-UDP-N-グリコシルトランスフェラーゼ基質としてのアセチルグルコサミン。 Bioorg。 中 Chem。 Lett。 21、1199 –1201(2011)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Macdonald, JI、Munch, HK、Moore, T. & Francis, MB 2-ピリジンカルボキシアルデヒドによるネイティブタンパク質のワンステップ部位特異的修飾。 Nat。 Chem。 バイオ 11、326 –331(2015)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Wang, S. et al.炎症におけるS100A8/A9。 フロント。 免疫。 9、1298(2018)

    記事 
    PubMedの 
    PubMed Centralの 

    Google Scholarの
     

  • ビジャヤン、AL 他。プロカルシトニン: 敗血症および抗生物質療法の有望な診断マーカー。 J. 集中治療 5、51(2017)

    記事 
    PubMedの 
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    Google Scholarの
     

  • 先輩、AW 他深層学習のポテンシャルを使用してタンパク質構造予測を改善しました。 自然 577、706 –710(2020)

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    Google Scholarの
     

  • ジャンパー、J.ら。 AlphaFold による高精度なタンパク質構造予測。 自然 596、583 –589(2021)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Jungmann、R.ら。 DNA-PAINT および Exchange-PAINT による多重化された 3D セルラー超解像度イメージング。 Nat。 方法 11、313 –318(2014)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • エリクソン、HP沈降、ゲルろ過、および電子顕微鏡によって決定されたナノメートルレベルでのタンパク質分子のサイズと形状。 Biol。 続行します。 オンライン 11、32 –51(2009)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Ree, R.、Varland, S. & Arnesen, T. タンパク質の N 末端アセチル化にスポットライトを当てる。 Exp。 モル。 Med。 50、1 –13(2018)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • ブルーム、S.ら。酸化電位を介した天然タンパク質の部位選択的な生体結合のための脱炭酸アルキル化。 Nat。 Chem。 10、205 –211(2018)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • ラミレス、DH 他近接指向のエンジニアリング O- 選択的タンパク質のための GlcNAc トランスフェラーゼ O-細胞内のGlcNAc化。 ACS Chem。 バイオル。 15、1059 –1066(2020)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Yang, Y.-Y.、Ascano, JM & Hang, HC タンパク質のアセチル化をモニタリングするための生体直交化学レポーター。 J. Am。 Chem。 Soc。 132、3640 –3641(2010)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Westcott, NP、Fernandez, JP、Molina, H. & Hang, HC 化学プロテオミクスにより、酸化ストレス中の低分子 GTPase の ADP リボシル化が明らかになりました。 Nat。 Chem。 バイオ 13、302 –308(2017)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Rabuka, D.、Hubbard, SC、Laughlin, ST、Argade, SP & Bertozzi, CR 糖タンパク質のフコシル化をプローブする化学レポーター戦略。 J. Am。 Chem。 Soc。 128、12078 –12079(2006)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • Boeggeman、E. et al.非還元GlcNAc残基の直接同定 N-新しい化学酵素法を使用した糖タンパク質のグリカン。 バイオコンジュゲート化学。 18、806 –814(2007)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • ヴァン・ギール、R. 他有毒ペイロードの世界的に保存された物質への化学酵素的結合 Nネイティブ mAbs のグリカンは、均一で非常に有効な抗体と薬物の複合体を提供します。 バイオコンジュゲート化学。 26、2233 –2242(2015)

    記事 

    Google Scholarの
     

  • テイト、EW、カレシュ、KA、ラニヨンホッグ、T.、ストーク、EM、ティノン、E。化学プロテオミクス技術を使用したタンパク質脂質化のグローバルプロファイリング。 Curr。 意見。 化学。 Biol。 24、48 –57(2015)

    記事 
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    Google Scholarの
     

  • アンダーソン、ニュージャージー州およびアンダーソン、ニュージャージー州 ヒト血漿プロテオーム: 歴史、性格、および診断の見通し。 モル。細胞。プロテオム。 1、845 –867(2002)

    記事 
    CAS 

    Google Scholarの
     

  • Han, X.、Aslanian, A. & Yates, JR プロテオミクスのための質量分析。 Curr。 意見。 化学。 Biol。 12、483 –490(2008)

    記事 
    CAS 
    PubMedの 
    PubMed Centralの 

    Google Scholarの
     

  • フィリウス、M.ら。プロテイン支援DNA-PAINTによる高速超解像イメージング。 ナノレット。 20、2264 –2270(2020)

    記事 
    ADS 
    CAS 
    PubMedの 
    PubMed Centralの 

    Google Scholarの
     

  • Kim、SH、Kim、H.、Jeong、H.、Yoon、TY 単一分子 FRET を使用した DNA バーコード内の複数の仮想シグナルのエンコード。 ナノレット。 21、1694 –1701(2021)

    記事 
    ADS 
    CAS 
    PubMedの 

    Google Scholarの
     

  • McCann, JJ、Choi, UB、Zheng, L.、Weninger, K. & Bowen, ME 固定化された単一分子から絶対 FRET 効率を回復するための最適化方法。 生物物理学。 J. 99、961 –970(2010)

    記事 
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    PubMedの 
    PubMed Centralの 

    Google Scholarの
     

  • クリスティアニーニ、N. & ショーテイラー、J. サポート ベクター マシンとその他のカーネルベースの学習方法の紹介 (ケンブリッジ大学出版局、2000)。

  • ペドレゴサ、F.ら。 Scikit-learn: Python での機械学習。 J.マッハ 学ぶ。 解像度 12、2825 –2830(2011)

    MathSciNet 

    Google Scholarの
     

  • パブスト、M.ら。原核生物のタンパク質のグリコシル化を探索する一般的なアプローチにより、アナモックス細菌の独特な表層調節が明らかになります。 ISMEJ。 16、346 –357(2022)

    記事 
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    PubMedの 

    Google Scholarの
     

  • Chuh, KN、Zaro, BW、Pillar, F.、Pillar, V. & Pratt, MR 代謝化学レポーター構造の変化により、次のような選択的プローブが得られます。 O-GlcNAc修飾。 J. Am。 Chem。 Soc。 136、12283 –12295(2014)

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