Zephyrnet-logotyp

NCI:s CPTAC släpper ny proteogenomisk datauppsättning

Datum:

En konsepuell bild av en forskare som pipetterar lite vätska i ett provrör. Kemiska strukturer flyter runt bilden.

Den omfattande proteogenomiska datamängden kan möjliggöra många nya upptäckter av cancerforskning.

Kredit: iStock

Vad

National Institutes of Health släpper en omfattande datauppsättning som standardiserar genomisk, proteomisk, avbildnings- och klinisk data från individuella studier av mer än 1,000 10 tumörer i XNUMX cancertyper. Forskare från hela världen kommer att kunna använda denna allmänt tillgängliga resurs för att upptäcka nya molekylära insikter om hur cancer utvecklas och utvecklas. Datauppsättningen genererades av Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) vid National Cancer Institute, en del av National Institutes of Health.

Den pan-cancer proteogenomiska datauppsättningen, som beskrivs i en papper publicerat i Cancercell, bygger på decennier av tekniska framsteg inom proteomvetenskap. Lanseringen av denna datauppsättning stöder Biden-Harris Administrations mål om Cancer Moonshot℠ att påskynda cancerforskningen genom förbättrad delning av data. Ytterligare två forskningsartiklar publicerade i Cell av CPTAC-utredare ger en första demonstration av datasetets potential som en värdefull resurs för vetenskaplig upptäckt. I den första artikeln är multiomiska analyser vana vid koppla ihop cancerförarmutationer med proteinmönster. Den andra uppsatsen fördjupar sig proteinmodifieringar som reglerar cellsignalering och fysiologi att visa samband med DNA-reparation, metabolism och immunitet över olika tumörtyper.

Den pan-cancer proteogenomiska datauppsättningen kommer att vara allmänt tillgänglig genom NCI Cancer Research Data Commons repositories. Proteomics data kan nås via Proteomic Data Commons på https://pdc.cancer.gov/pdc/cptac-pancancer. Genomisk och transkriptomisk data kan nås via Genomic Data Commons på https://portal.gdc.cancer.gov och Cancerdatatjänsten kl https://dataservice.datacommons.cancer.gov/.

Vem

Henry Rodriguez, Ph.D., MBA, och Ana I. Robles, Ph.D., Division of Cancer Treatment and Diagnosis, National Cancer Institute

Studierna

"Proteogenomiska data och resurser för pan-canceranalys” visas 14 augusti in Cancercell. "Pan-Cancer Proteogenomics kopplar onkogena drivrutiner till funktionella tillstånd"Och"Pan-canceranalys av posttranslationella modifieringar avslöjar delade mönster för proteinreglering” visas 14 augusti in Cell.

Om National Cancer Institute (NCI): NCI leder det nationella cancerprogrammet och NIH: s ansträngningar för att dramatiskt minska förekomsten av cancer och förbättra liv för cancerpatienter och deras familjer genom forskning om förebyggande och cancerbiologi, utveckling av nya interventioner och utbildning och mentorskap för nya forskare. För mer information om cancer, besök NCI: s webbplats på cancer.gov eller ring NCI: s kontaktcenter, Cancer Information Service, på 1-800-4-CANCER (1-800-422-6237).

Om National Institute of Health (NIH): NIH, landets medicinska forskningsbyrå, omfattar 27 institut och centra och är en del av US Department of Health and Human Services. NIH är den primära federala myndigheten som bedriver och stöder grundläggande, klinisk och translationell medicinsk forskning och undersöker orsaker, behandlingar och botemedel för både vanliga och sällsynta sjukdomar. För mer information om NIH och dess program, besök nih.gov.

plats_img

Senaste intelligens

plats_img