Kinderen die voor kanker worden behandeld met benaderingen zoals chemotherapie, kunnen therapiegerelateerde myeloïde neoplasmata (een tweede soort kanker) ontwikkelen met een sombere prognose. Wetenschappers van het St. Jude Children's Research Hospital hebben de genomische afwijkingen van 84 van dergelijke myeloïde neoplasmata gekarakteriseerd, met mogelijke implicaties voor vroege interventies om de ziekte te stoppen. Een artikel met details over het werk werd vandaag gepubliceerd in Nature Communications.

De somatische (kanker) en kiemlijn (erfelijke) genomische veranderingen die therapiegerelateerde myeloïde neoplasmata bij kinderen veroorzaken, zijn tot nu toe niet uitgebreid beschreven. De onderzoekers gebruikten een verscheidenheid aan sequencingtechnieken (hele exoom, hele genoom en RNA) om het genomische profiel van 84 pediatrische therapiegerelateerde myeloïde neoplasmata te karakteriseren. De gegevens waren afkomstig van patiënten met leukemie, solide tumoren of hersentumoren die werden behandeld met verschillende soorten chemotherapie en die later allemaal myeloïde neoplasmata ontwikkelden.

“Een ding dat we al lang weten is dat zodra kinderen deze secundaire tumor ontwikkelen, de uitkomst erg slecht is”, zegt co-corresponderend auteur Jeffery Klco, MD, Ph.D., St. Jude Pathology. “De veranderingen die deze tumoren veroorzaken zijn bij kinderen anders dan bij volwassenen, wat de noodzaak onderstreept om deze tumoren specifiek in de kindergeneeskunde te bestuderen.”

Samenwerking levert nieuwe inzichten op

Resultaten van de studie onthulden verschillende opmerkelijke mutaties in de somatische setting, waaronder veranderingen in de Ras / MAPK-route, veranderingen in RUNX1 of TP53 en herschikkingen van KMT2A. Bovendien toonden de resultaten een verhoogde expressie van een transcriptiefactor genaamd MECOM, die werd geassocieerd met de abnormale nabijheid van MECOM tot een versterker als gevolg van genetische herschikkingen.

Het onderzoek profiteerde van computerhulpmiddelen die bij St. Jude zijn ontwikkeld en die gericht zijn op het verminderen van foutenpercentages, waaronder CleanDeepSeq en SequencErr. Deze benaderingen helpen onderscheid te maken tussen echte mutaties en sequentiefouten.

Met deze tools konden de onderzoekers de mutaties terugvoeren tot twee jaar voordat een therapiegerelateerd myeloïde neoplasma zich ontwikkelde, toen vroege interventies mogelijk ten goede zouden kunnen komen aan patiënten.

"Dit werk geeft aan dat we dit type maligniteit in een vroeg stadium kunnen opsporen, om te onderzoeken of preventieve therapieën patiënten ten goede kunnen komen", zei senior co-auteur Xiaotu Ma, Ph.D., St. Jude Computational Biology.

###

De andere co-corresponderende auteur van de studie is Tanja Gruber, Stanford University School of Medicine. Co-eerste auteurs zijn Jason Schwartz, Vanderbilt University Medical Center; Jing Ma, St. Judas; en Jennifer Kamens, Stanford University School of Medicine. Andere St. Jude-auteurs van de studie zijn Tamara Westover, Michael Walsh, Samuel Brady, J. Robert Michael, Xiaolong Chen, Lindsey Montefiori, Guangchun Song, Gang Wu, Huiyn Wu, Ryan Hiltenbrand, Kim Nichols, Jamie Maciaszek, Yanling Liu, Priyadarshini Kumar, John Easton, Scott Newman, Jeffrey Rubnitz, Charles Mullighan, Stanley Pounds en Jinghui Zhang. Andere auteurs van artikelen zijn onder meer Cristyn Branstetter, Arkansas Children's Northwest Hospital; en Michael Walsh, Memorial Sloan Kettering Cancer Center.

Het onderzoek werd gedeeltelijk gefinancierd door subsidies van de National Institutes of Health (1K08HL150282-01, P30CA021765, R01HL144653), Alex's Lemonade Stand Foundation, Burroughs Wellcome Fund, EvansMDS Foundation en ALSAC, de fondsenwervende en bewustmakingsorganisatie van St. Jude.

St. Jude Children's Research Hospital

Het St. Jude Children's Research Hospital loopt voorop in de manier waarop de wereld kinderkanker en andere levensbedreigende ziekten begrijpt, behandelt en geneest. Het is het enige door het National Cancer Institute aangewezen Comprehensive Cancer Center dat zich uitsluitend op kinderen richt. De behandelingen die in St. Jude zijn ontwikkeld, hebben ertoe bijgedragen dat de totale overlevingskans van kinderkanker van 20% naar 80% is gestegen sinds de opening van het ziekenhuis meer dan 50 jaar geleden. St. Jude deelt openlijk de doorbraken die het boekt, en ieder kind dat bij St. Jude wordt gered betekent dat artsen en wetenschappers over de hele wereld die kennis kunnen gebruiken om nog duizenden kinderen te redden. Gezinnen ontvangen nooit een rekening van St. Jude voor behandeling, reizen, huisvesting en voedsel – omdat het enige waar een gezin zich zorgen over zou moeten maken, het helpen van hun kind is om te overleven. Ga voor meer informatie naar stjude.org of volg St. Jude op sociale media op @stjudeonderzoek.