Het doorzoeken van de triljoenen moleculen die krachtige medicinale effecten kunnen hebben, is een ontmoedigende taak, maar de oplossing die de biotechnologie heeft gevonden, is slimmer werken, niet harder. Genesis therapieën heeft een nieuwe simulatiebenadering en een multidisciplinair team dat duidelijk indruk heeft gemaakt: het bedrijf heeft zojuist een A-ronde van $ 52 miljoen opgehaald.
Genesis deed vorig jaar mee aan de Startup Battlefield bij Disrupt, en maakte indruk op juryleden met zijn potentieel, en duidelijk zagen anderen het ook - in het bijzonder Rock Springs Capital, dat de ronde leidde.
In de afgelopen jaren zijn er veel bedrijven gevormd op het gebied van geneesmiddelenontdekking, aangedreven door toegenomen reken- en simulatiekracht waarmee ze het potentieel van moleculen bij de behandeling van bepaalde ziekten kunnen bepalen. Dat is tenminste de theorie. De realiteit is een beetje rommeliger, en hoewel deze bedrijven de zoekopdracht kunnen verfijnen, kunnen ze niet zomaar zeggen "hier, een remedie voor Parkinson."
Oprichter Evan Feinberg kwam in het veld toen een ziekte die hij erfde, het traditionele laboratoriumwerk, als stagiair bij een groot farmaceutisch bedrijf, moeilijk voor hem maakte. De computationele kant van het veld was echter toegankelijker en absorbeerde hem uiteindelijk volledig.
Hij had al eerder in het gebied gedobbeld en kwam tot wat hij voelt als een doorbraak in hoe moleculen digitaal worden weergegeven. Machine learning heeft natuurlijk het werk op veel gebieden versneld, waaronder de biochemie, maar hij vond dat het potentieel van de technologie niet was benut.
"Ik denk dat de pogingen aanvankelijk waren om deep learning-technieken te knippen en te plakken, en moleculen weer te geven zoals afbeeldingen, en ze te classificeren - zoals je zou zeggen, dit is een foto van een kat of dit is geen foto van een kat," hij uitgelegd in een interview. “We geven de moleculen natuurlijker weer: als grafieken. Een reeks knooppunten of hoekpunten, dat zijn atomen, en dingen die ze verbinden, dat zijn bindingen. Maar we vertegenwoordigen ze niet zomaar band or geen band, maar met meerdere soorten contact tussen atomen, ruimtelijke afstanden en complexere kenmerken. "
De resulterende weergave is rijker en complexer, een completer beeld van een molecuul dan je zou krijgen van de chemische formule of een staafdiagram met de verschillende structuren en bindingen. Omdat in de wereld van biochemie niets zo eenvoudig is als een diagram. Elk molecuul bestaat als een gecompliceerde, veranderende 3D-vorm of -conformatie waarbij belangrijke aspecten, zoals de afstand tussen twee koolstofformaties of bindingsplaatsen, onderhevig zijn aan vele factoren. Genesis probeert zoveel mogelijk van deze factoren te modelleren.
"Stap één is de representatie", zei hij, "maar de logische volgende stap is: hoe gebruik je die representatie om een functie te leren die een invoer nodig heeft en een getal uitvoert, zoals bindingsaffiniteit of oplosbaarheid, of een vector die meerdere voorspelt eigendommen tegelijk? "
Dat is het werk waarop ze zich als bedrijf hebben geconcentreerd - niet alleen het creëren van een beter modelmolecuul, maar het in staat zijn om een theoretisch molecuul in simulatie te brengen en te zeggen: het zal dit doen, het zal dit niet doen, het heeft deze kwaliteit maar niet die.
Een deel van dit werk kan worden gedaan in partnerschappen, zoals die Genesis met Genentech heeft aangeslagen, maar de teams zouden heel goed kandidaat-geneesmiddelen kunnen vinden die onafhankelijk zijn van deze, en om die reden zet het bedrijf ook een intern ontwikkelingsproces op.
De infusie van $ 52 miljoen zou veel moeten doen om dat vooruit te helpen, schreef Feinberg in een e-mail:
“Deze fondsen stellen ons in staat om een aantal cruciale doelstellingen uit te voeren, vooral het verder pionieren van AI-technologieën voor de ontwikkeling van geneesmiddelen en het bevorderen van onze therapeutische pijplijn. We zullen meer eersteklas AI-onderzoekers, software-ingenieurs, medicinale chemici en biotech-talent aannemen, en ook onze eigen onderzoekslaboratoria bouwen. "
Andere bedrijven doen ook simulaties en blaffen in dezelfde boom, maar Feinberg zegt dat Genesis minstens twee benen heeft, ondanks de concurrentie die honderden miljoenen oplevert en al jaren bestaat.
"We zijn het enige bedrijf in de ruimte dat werkt op het kruispunt van moderne diepe neurale netwerkbenaderingen en biofysische simulatie - conformationele verandering van liganden en eiwitten," zei hij. “En we brengen dit supertechnische platform naar experts die door de FDA goedgekeurde medicijnen op de markt hebben gebracht. Alleen daaruit hebben we een enorme waardecreatie gezien - de chemici informeren ook de AI. "
De recente doorbraak van AlphaFold, dat de complexe taak van het simuleren van eiwitvouwing veel sneller uitvoert dan enig vorig systeem, is net zo opwindend voor Feinberg als voor alle anderen in het veld.
“Als wetenschappers zijn we ongelooflijk enthousiast over de recente vooruitgang in de voorspelling van de eiwitstructuur. Het is een belangrijke fundamentele wetenschappelijke vooruitgang die uiteindelijk belangrijke stroomafwaartse voordelen zal hebben voor de ontwikkeling van nieuwe therapieën ”, schreef hij. “Aangezien onze Dynamic PotentialNet-technologie uniek is in de manier waarop deze 3D-structurele informatie van eiwitten gebruikt, is computationele eiwitvouwing - vergelijkbaar met recente vooruitgang in cryo-EM - een mooie aanvullende wind in de rug voor het Genesis AI-platform. We juichen alle inspanningen toe om de eiwitstructuur toegankelijker te maken, zodat therapieën gemakkelijker kunnen worden ontwikkeld voor patiënten van alle aandoeningen. "
Ook namen T. Rowe Price Associates, Andreessen Horowitz (die de startronde leidde), Menlo Ventures en Radical Ventures deel aan de financieringsronde.
