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極限環境生物の合成生物学: バイオ製造の新しい波

日付:

    • クロムバーグ JM

    産業用バイオマニュファクチャリング: 化学生産の未来。

    科学。 2017。 355aag0804

    • フィリップ JC

    バイオベースの化学物質: グリーンケミストリーと産業用バイオテクノロジーの融合。

    トレンドバイオテクノロジー。 2013。 31: 219-222

    • スティーン EJ

    の代謝工学 サッカロマイセス·セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae) n-ブタノールの製造用。

    微生物。 セルファクトリー。 2008。 7: 36

    • 陳 GQ

    ポリヒドロキシアルカノエートを多様化するための生合成メカニズムのエンジニアリング。

    トレンドバイオテクノロジー。 2015。 33: 565-574

    • 牙H。

    の代謝工学 大腸菌 ビタミン B12 の de novo 生合成用。

    Nat。 コミュニ 2018。 9: 4917

    • 陳 GQ
    • 江 XR

    好極限性細菌に基づく次世代産業バイオテクノロジー。

    Curr。 意見。 バイオテクノロジー。 2018。 50: 94-100

    • 張X。

    生物生産のためのシャーシとしての好塩菌。

    アドバンスBiosyst。 2018。 21800088

    • コーカー JA

    極限環境生物の理解における最近の進歩。

    F1000リサーチ。 2019。 8: 1917

    • タンD。

    エンジニアリング ハロモナス ポリヒドロキシアルカノエートを低コストで製造するための TD01。

    メタブ。 エンジニアリング 2014。 26: 34-47

    • タオW。

    エンジニアリング ハロモナス CRISPRi による強化されたポリヒドロキシアルカノエート合成のための種 TD01。

    微生物。 セルファクトリー。 2017。 16: 48

    • イェ J.

    ポリ(3-ヒドロキシブチレート-)のパイロットスケールアップco-4-ヒドロキシブチレート) による生産 ハロモナス ブルーファジェネシス 細胞増殖に適応した最適化プロセスを介して。

    バイオテクノロジー。 NS。 2018。 13e1800074

    • サリルマイザーHK

    による微生物レバン産生の効果的な刺激因子 ハロモナス・スミルネンシス AAD6T。

    J.Biosci。 Bioeng。 2015。 119: 455-463

    • オブルカ S.

    好塩菌と好熱菌によるポリヒドロキシアルカノエートの合成:微生物バイオプラスチックの持続可能な生産に向けて。

    バイオテクノロジー。 前売 2022。 58107906

  • 水分活性の端でのポリヒドロキシアルカノエート生合成 -ハロアーキア バイオポリエステル工場として。

    バイオエンジニアリング(バーゼル)。 2019。 6: 34

    • クルウィッチ TA

    細菌のpHセンシングとホメオスタシスの分子的側面。

    ナット微生物牧師。 2011。 9: 330-343

    • トイヴァリ M.

    低pH D-キシロン酸生産 ピキアクドリャフゼビイ.

    バイオリソース。 技術 2013。 133: 555-562

    • シャオH。

    搾取 イサチェンキア・オリエンタリス コハク酸生産用SD108。

    微生物。 セルファクトリー。 2014。 13: 121

    • パク HJ

    新たに分離された耐酸性酵母を用いたd-乳酸の低pH生産 ピキアクドリャフゼビイ NG7。

    バイオテクノロジー。 Bioeng。 2018。 115: 2232-2242

    • Sousa JA

    の生態と応用 ハロアルカリ性嫌気性 微生物群集。

    Appl。 微生物。 バイオテクノロジー。 2015。 99: 9331-9336

    • ぴくたEV

    生命の限界にある極限環境微生物。

    クリティカル。 Rev.Microbiol. 2007。 33: 183-209

    • 朱 D.

    極限環境細菌の最近の開発とバイオリファイナリーへの応用。

    フロントバイオエン。 バイオテクノロジー。 2020。 8: 483

    • ウェルニック DG

    操作された極度の好アルカリ性による廃水の持続可能なバイオリファイニング バチルス・マルマレンシス.

    サイ。 担当者 2016。 6: 20224

    • バンディワド A.

    の代謝工学 サーモアナエロバクテリウム・サッカロリティクム n-ブタノール製造用。

    メタブ。 エンジニアリング 2014。 21: 17-25

    • ティアン L.

    の代謝工学 クロストリジウム・サーモセラム セルロースからのn-ブタノール製造用。

    バイオテクノロジー。 バイオ燃料。 2019。 12: 186

    • コント B.

    組換え体の発酵プロセス開発 ハンゼヌラ・ポリモルファ ガンマリノレン酸の生産に。

    J.Microbiol。 バイオテクノロジー。 2010。 20: 1555-1562

    • ロブス AK

    におけるエタノールおよび酢酸エチルの生合成を理解するための CRISPR-Cas9 対応の遺伝子破壊 クルイベロマイセス・マルシアヌス.

    バイオテクノロジー。 バイオ燃料。 2017。 10: 164

    • アタラ J.

    好熱菌とその酵素の新しい生体触媒としての応用。

    バイオリソース。 技術 2019。 280: 478-488

    • ジョバネラ P.

    極限環境微生物による金属および有機汚染物質のバイオレメディエーション。

    J.ハザード。 メイター。 2020。 382121024

    • ガバニ P.
    • シンOV

    放射線耐性極限環境微生物と、バイオテクノロジーと治療におけるその可能性。

    Appl。 微生物。 バイオテクノロジー。 2013。 97: 993-1004

    • シュクラ M.

    さまざまな生息地から得られた電離放射線耐性細菌分離株の多重ストレス耐性:ストレス間の相関。

    Curr。 微生物。 2007。 54: 142-148

    • イェ・JW
    • 陳 GQ

    ハロモナス シャーシとして。

    エッセイ生化学。 2021。 65: 393-403

    • ラン LH

    エンジニアリング ハロモナス 種。 バイオサーファクタントタンパク質PhaPの生産のための低コストの生産宿主として。

    バイオテクノロジー。 NS。 2016。 11: 1595-1604

    • XuT。

    エキソポリサッカライドとO抗原の欠乏は、 ハロモナス ブルーファジェネシス 自己凝集性で、電気変換に適しています。

    コミュン。 Biol。 2022。 5: 623

    • ベイカー TA
    • ウィックナー SH

    における DNA 複製の遺伝学と酵素学 大腸菌.

    アンヌ。 ジェネット牧師。 1992。 26: 447-477

    • チョン D.

    のための安定した複製シャトルベクターの構築 カルディセルロースシロップ 種: 遺伝的方法論をこの属の他のメンバーに拡張するために使用します。

    PLoS One。 2013。 8e62881

    • LiT。

    コアプロモーター領域の操作により、構成的および誘導可能なプロモーターの構築が可能になります ハロモナス エスピー。

    バイオテクノロジー。 NS。 2016。 11: 219-227

    • 趙H。

    に使用される新規の T7 様発現システム ハロモナス.

    メタブ。 エンジニアリング 2017。 39: 128-140

    • シェン R.

    強化された P(3HB-co-4HB)による生産 ハロモナス ブルーファジェネシス.

    ACS Synth。 バイオル。 2018。 7: 1897-1906

    • スパッツ K.

    での直接クローニング ラクトバチルスプランタルム: メチル化されていないプラスミド DNA を用いたエレクトロポレーションにより、形質転換効率が向上し、シャトル ベクターが不要になります。

    微生物。 セルファクトリー。 2012。 11: 141

    • マルティネス-ガルシア E.

    SEVA 3.0: 多様な細菌宿主間での遺伝子構築物の移植性を可能にするための標準欧州ベクター アーキテクチャの更新。

    核酸リサーチ 2020。 48: 1164-1170

    • ラメンスEM

    SEVAtile: 最適化された標準化された DNA アセンブリ方法 シュードモナス菌.

    微生物。 バイオテクノロジー。 2022。 15: 370-386

    • クラパッチ TR

    における制限エンドヌクレアーゼ活性 クロストリジウム・サーモセラム および クロストリジウム・サーモサッカロリティカム.

    Appl。 微生物。 バイオテクノロジー。 1996。 45: 127-131

    • クリフトンKP

    遺伝的絶縁体 RiboJ は、絶縁された遺伝子の発現を増加させます。

    J.Biol. 英文 2018。 12: 23

    • オルソン DG

    における遺伝子発現のためのプロモーターの同定 クロストリジウム・サーモセラム.

    メタブ。 エンジニアリングコミュン。 2015。 2: 23-29

    • ルオ Y.

    からの強力な構成的プロモーターのパネルの体系的な同定 ストレプトマイセス・アルバス.

    ACS Synth。 バイオル。 2015。 4: 1001-1010

    • 張Y。

    プロモーター エンジニアリングに基づく戦略により、ポリヒドロキシアルカノエートの生産が促進されます。 シュードモナス・プチダ KT2440。

    Int。 J.Biol。 マクロモル。 2021。 191: 608-617

    • サンW。

    リンゴ酸の微調整された生合成のための代謝経路操作とプロモーター工学の統合 バチルス・コアギュランス.

    バイオテクノロジー。 Bioeng。 2021。 118: 2597-2608

    • ラメンスEM

    非モデル細菌を操作するためのバクテリオファージの合成生物学の可能性を探る。

    Nat。 コミュニ 2020。 11: 5294

    • フエソ ギル A.

    調節配列の複数部位の多様化により、遺伝子デバイスの種間操作性が可能になります。

    ACS Synth。 バイオル。 2020。 9: 104-114

    • マイヤーズ A.

    での組換えタンパク質の発現のための細胞密度依存性自動誘導性プロモーター シュードモナス・プチダ.

    微生物。 バイオテクノロジー。 2019。 12: 1003-1013

    • 王X。

    遺伝子発現の二機能性動的制御のための可逆的熱調節 大腸菌.

    Nat。 コミュニ 2021。 12: 1411

    • 秦Q.

    極限環境微生物の CRISPR/Cas9 編集ゲノム ハロモナス spp。

    メタブ。 エンジニアリング 2018。 47: 219-229

    • 趙 C.

    設計された ハロモナス 種。 L-リジンとカダベリンの生産に。

    バイオリソース。 技術 2022。 349126865

    • 陰J。

    好塩菌ポリン合成オペロンに基づく染色体発現増強システムの開発 ハロモナス エスピー。

    Appl。 微生物。 バイオテクノロジー。 2014。 98: 8987-8997

    • ワン・LJ

    エンジニアリング ハロモナス ブルーファジェネシス 小さな調節 RNA を介して。

    メタブ。 エンジニアリング 2022。 73: 58-69

    • 陰J。

    によるポリヒドロキシアルカノエート合成に対する染色体遺伝子コピー数および位置の影響 大腸菌 および ハロモナス エスピー。

    Appl。 微生物。 バイオテクノロジー。 2015。 99: 5523-5534

    • マルクス CJ
    • リドストロム ME

    グラム陰性菌における抗生物質マーカーのリサイクルのための広い宿主範囲のcre-loxシステム。

    バイオテクニック。 2002。 33: 1062-1067

    • ワインストックMT

    Vibrionatriegens 分子生物学の急成長中のホストとして。

    Nat。 メソッド。 2016。 13: 849-851

    • XuT。

    での効率的なゲノム編集 クロストリジウム・セルロリティカム CRISPR-Cas9 ニッカーゼ経由。

    アプリケーション環境。 微生物。 2015。 81: 4423-4431

    • ウォーカーJE

    セルロース分解菌における IB 型および II 型 CRISPR/Cas ゲノム編集システムの開発 クロストリジウム・サーモセラム.

    メタブ。 エンジニアリングコミュン。 2020。 10e00116

    • シ F.

    グルタミン酸デカルボキシラーゼを発現し、γ-アミノ酪酸を産生するためのリボソーム結合部位配列およびプロモーター コリネバクテリウムグルタミカム.

    AMBエクスプレス。 2018。 8: 61

    • スティラーLM

    の塩誘導性エクトインプロモーター領域の操作 ハロモナス・エロンガタ 独自の安定化環境でのタンパク質発現用。

    遺伝子(バーゼル)。 2018。 9: 184

    • イェ J.

    におけるポリヒドロキシアルカノエート経路の刺激応答ベースの微調整 ハロモナス.

    メタブ。 エンジニアリング 2020。 57: 85-95

    • ゆうLP

    遺伝子操作による機能性ポリヒドロキシアルカノエートの生合成 ハロモナス ブルーファジェネシス.

    メタブ。 エンジニアリング 2020。 59: 119-130

    • マ・H

    の有理磁束調整 ハロモナス ブルーファジェネシス バイオプラスチック PHB とエクトインの共同生産用。

    Nat。 コミュニ 2020。 11: 3313

    • チェンY.

    におけるTCAサイクルの染色体工学 ハロモナス ブルーファジェネシス 3-ヒドロキシブチレートと 3-ヒドロキシバレレート (PHBV) のコポリマーの製造用。

    メタブ。 エンジニアリング 2019。 54: 69-82

    • デュ H.

    エンジニアリング ハロモナス ブルーファジェネシス L-スレオニン生産用。

    メタブ。 エンジニアリング 2020。 60: 119-127

    • グプタA。

    経路に依存しないクオラムセンシング回路を使用した、操作されたバクテリアにおける代謝フラックスの動的調節。

    Nat。 バイオテクノロジー。 2017。 35: 273-279

    • 五月。

    オレイン酸誘導システムのエンジニアリング ハロモナス, E. 大腸菌の および シュードモナス菌.

    メタブ。 エンジニアリング 2022。 72: 325-336

    • 江 XR

    による効率的なPHB生産のための細胞体積の制御 ハロモナス.

    メタブ。 エンジニアリング 2017。 44: 30-37

    • 王Z。

    の透過性をエンジニアリングする ハロモナス ブルーファジェネシス シャーシ特性を強化しました。

    メタブ。 エンジニアリング 2021。 67: 53-66

    • オウヤン P.

    ポリ(3-ヒドロキシブチレート)生産を改善するための酸素利用可能性の増加 ハロモナス.

    メタブ。 エンジニアリング 2018。 45: 20-31

    • リン C.

    エンジニアリング自己凝集 ハロモナスカンパニエンシス 廃水のないオープンで連続的な発酵のため。

    バイオテクノロジー。 Bioeng。 2019。 116: 805-815

    • リン C.

    エンジニアリング NADH/NAD+ の比率 ハロモナス ブルーファジェネシス ポリヒドロキシアルカノエート (PHA) の生産を促進します。

    メタブ。 エンジニアリング 2018。 49: 275-286

    • 劉X。

    CRISPR ベースの遺伝子発現ツールキットを開発するためのゲノム統合部位の同定 Yarrowialipolytica.

    微生物。 バイオテクノロジー。 2022。 15: 2223-2234

    • 劉X。

    緑色蛍光タンパク質で標識されたファジンに基づく生細胞に蓄積されたポリヒドロキシアルカノエートの迅速な定量化: qPHA メソッド。

    生体高分子。 2022。 23: 4153-4166

    • 王BL

    細胞外代謝産物の産生または消費に基づく選択のための単一細胞のマイクロ流体ハイスループット培養。

    Nat。 バイオテクノロジー。 2014。 32: 473-478

    • シュルツ S.

    古細菌プロテオーム プロジェクトは、包括的なプロテオミクスを通じて古細菌細胞生物学に関する知識を向上させます。

    Nat。 コミュニ 2020。 11: 3145

    • 森Y。
    • 白井T.

    人工代謝経路の設計、標的酵素の構築とその機能解析。

    Curr。 意見。 バイオテクノロジー。 2018。 54: 41-44

    • 趙Q。

    エンジニアによる高エクトイン生産 ハロモナス・ハイドロサーマルリス 減塩培地中のY2。

    微生物。 セルファクトリー。 2019。 18: 184

    • 劉M。

    好塩性植物の耐塩性に関与するグリシンベタイン生合成経路の同定 チオアルカリビブリオ ヴァーストゥス D301。

    フロント。 微生物。 2022。 13875843

    • ラムS。

    カロテノイド生産の代替バイオファクトリーとしての細菌:その用途、機会、および課題のレビュー。

    J.機能食品。 2020。 67103867

    • 張Y。

    システム代謝工学 Vibrionatriegens 1,3-プロパンジオールの製造用。

    メタブ。 エンジニアリング 2021。 65: 52-65

    • エルルーシュ S.

    Extremozymes - 極限環境微生物からの独自の特性を持つ生体触媒。

    Curr。 意見。 バイオテクノロジー。 2014。 29: 116-123

    • リーSY

    バイオベースの化学物質の生産のための包括的な代謝マップ。

    ナットCatal。 2019。 2: 18-33

    • キースリング J.

    高度なバイオ燃料の微生物生産。

    ナット微生物牧師。 2021。 19: 701-715

    • 孟 W.

    代謝操作された急速成長による海水による2,3-ブタンジオールの無菌発酵 Vibrionatriegens.

    フロントバイオエン。 バイオテクノロジー。 2022。 10955097

    • イブラヒム MH
    • シュタインビュッヘル A.

    ポリ(3-ヒドロキシブチレート)を蓄積する好熱菌の高細胞密度循環流加発酵、 ケラトコッカス sp。 MW10株。

    アプリケーション環境。 微生物。 2010。 76: 7890-7895

    • ペレグ M.

    アレニウスの式を再検討しました。

    クリティカル 食品科学大臣 Nutr。 2012。 52: 830-851

    • ブルム P.

    極限環境微生物の実験的微生物進化。

    に: ランペロット PH 極限環境微生物のバイオテクノロジー。 スプリンガー, 2016: 619-636

    • 王Y。

    ダウンストリーム処理を容易にするための微生物工学。

    バイオテクノロジー。 前売 2019。 37107365

    • シェン R.

    ポリヒドロキシアルカノエートの粒度の操作 ハロモナス ブルーファジェネシス.

    メタブ。 エンジニアリング 2019。 54: 117-126

    • DTHを行う

    従来とは異なる酵母ベースのバイオプロセスの原料としての有機廃棄物。

    微生物。 2019。 7: 229

    • モハンティSS

    バイオサーファクタント生産のための持続可能な基質としてのさまざまな原料に関する重要なレビュー:よりクリーンな生産への道。

    微生物。 セルファクトリー。 2021。 20: 120

    • ロペス M.

    貴重な化合物を生産するための廃食用油の微生物による評価 - レビュー。

    クリティカル。 エンバイロン牧師。 科学技術。 2019。 50: 2583-2616

    • チャバン S.

    廃原料を使用した好熱性微生物によるポリヒドロキシアルカノエート (PHA) バイオポリエステルの生産に関するレビュー。

    バイオリソース。 技術 2021。 341125900

    • LiM。

    再構築によるテーラーメイドのポリヒドロキシアルカノエート シュードモナス・エントモフィラ.

    前売 母校。 2021。 33e2102766

    • リンY。

    エンジニアリング ハロモナス ブルーファジェネシス デンプンからの生物生産のシャーシとして。

    メタブ。 エンジニアリング 2021。 64: 134-145

    • ヴァン・ダイクJS
    • プレチケ BI

    酵素加水分解と酵素間の相乗的協力を使用したリグノセルロース生物変換のレビュー - 酵素、変換、相乗効果に影響を与える要因。

    バイオテクノロジー。 前売 2012。 30: 1458-1480

    • 趙Z。

    微生物によるキシロースの取り込みと変換の生化学的経路。

    バイオテクノロジー。 バイオ燃料。 2020。 13: 21

    • ティソ T.

    ポリエチレンテレフタレートのバイオアップサイクルに向けて。

    メタブ。 エンジニアリング 2021。 66: 167-178

    • トロツェンコ YA
    • フメレニナ VN

    好極限性および極限耐性メタノトローフの生物学。

    アーチ。 微生物。 2002。 177: 123-131

    • グルド N.

    自動化と基本的な発見を、非伝統的な微生物の設計 - 構築 - テスト - 学習サイクルに統合します。

    トレンドバイオテクノロジー。 2022。 40: 1148-1159

    • 張X。

    の肝臓からのテトロドトキシンの超音波支援抽出の最適化のための応答曲面法 タキフグ シュードムス.

    毒素(バーゼル)。 2018。 10: 529

    • コステロZ。
    • マーティンHG

    時系列マルチオミクスデータから代謝経路のダイナミクスを予測するための機械学習アプローチ。

    NPJシステム生物。 アプリケーション 2018。 4: 19

    • シェパー T.

    デジタル化とバイオプロセッシング: 約束と課題。

    アドバンテージ生化学。 英文バイオテクノロジー。 2021。 176: 57-69

    • ダーリントンAPS
    • ベイツ DG

    転写と翻訳のリソース割り当てコントローラーを組み合わせたアーキテクチャ。

    セルシステム。 2020。 11: 382-392

    • 朱 J.

    生物栄養素除去および回収システムにおけるポリヒドロキシアルカノエート (PHA) 合成促進因子。

    IOP会議サー。 地球環境。 科学。 2018。 178012021

    • ロー TM

    細胞増殖を代謝産物産生から分離するための XNUMX 層遺伝子回路。

    セルシステム。 2016。 3: 133-143

    • キラグアマン J.

    中程度の好塩性物質によるポリ(β-ヒドロキシブチレート)の生成、 ハロモナス・ボリビエンシス デンプン加水分解物を基質として使用するLC1。

    J.Appl. 微生物。 2005。 99: 151-157

    • ユエH。

    組換えによるポリヒドロキシアルカノエート生産のための海水ベースのオープンで連続的なプロセス ハロモナスカンパニエンシス 混合基板で成長したLS21。

    バイオテクノロジー。 バイオ燃料。 2014。 7: 108

    • タンD。

    によるポリヒドロキシブチレートの無菌で連続的な生産 ハロモナス TD01。

    バイオリソース。 技術 2011。 102: 8130-8136

    • イェ J.

    のエンジニアリング ハロモナス ブルーファジェネシス グルコースからのポリ(3-ヒドロキシブチレート-co-4-ヒドロキシブチレート)の低コスト生産。

    メタブ。 エンジニアリング 2018。 47: 143-152

    • 王Z。

    外膜欠損による4-ヒドロキシブチレート(4HB)の割合が高いPHAコポリマーの過剰生産 ハロモナス ブルーファジェネシス バイオリアクターで栽培。

    微生物。 バイオテクノロジー。 2022。 15: 1586-1597

    • 江 XR

    による3-ヒドロキシプロピオン酸の過剰生産 ハロモナス ブルーファジェネシス.

    Nat。 コミュニ 2021。 12: 1513

    • フー XZ

    開発 ハロモナス 化学物質のオープン生産のホストとしての TD01。

    メタブ。 エンジニアリング 2014。 23: 78-91

    • Erkorkmaz BA

    費用対効果の高い生産プロセスの開発 ハロモナス・レヴァン.

    バイオプロセスBiosyst。 工学 2018。 41: 1247-1259

    • 般若 A.

    からのオキサロ酢酸の効率的な生産と分泌 ハロモナス sp。 有酸素条件下でのKM-1。

    AMBエクスプレス。 2017。 7: 209

    • 川田 由美

    からのピルビン酸の効率的な生産と分泌 ハロモナス sp。 有酸素条件下でのKM-1。

    AMBエクスプレス。 2016。 6: 22

    • マンフラオネット JHC

    使用の進歩 ハンゼヌラ・ポリモルファ 組換えタンパク質生産のシャーシとして。

    フロントバイオエン。 バイオテクノロジー。 2019。 7: 94

    • メリノ N.

    極限での生活: 地球環境における極限環境と生命の限界.

    フロント。 微生物。 2019。 10: 780

    • ダカール K.
    • パンディA。

    極限環境生物における広いpH範囲耐性: 将来のバイオテクノロジーにとって重要な現象の理解に向けて.

    Appl。 微生物。 バイオテクノロジー。 2016。 100: 2499-2510

    • 辻A.

    ゲノムDNA工学のための遺伝子ツールの確立 ハロモナス sp。 KM-1、生化学的生産の可能性を持つ細菌。

    微生物。 セルファクトリー。 2022。 21: 122

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