フラクタル ゲノム: IT 主導の製薬バイオテクノロジーにおけるインドの機会を救うポストゲノム時代の分析。
ゲスト執筆者: Ram MV Ramanujam、Propinquity Therapeutics 社長兼創設者兼 CEO (インド、バンガロール)。
ゲノミクスの先駆者と生物学における数学的アプローチは、反復的な自己相似プロセスがフラクタルゲノムの状態を支配することを明らかにした論文として例示されています。 インド、私たちの文化芸術、科学が数学だけでなくフラクタルの自己相似の繰り返しに深く根ざしているように、おそらく直接的な共鳴が起こったのでしょう。 インドの寺院は古代から「フラクタル建築」の例でした。 したがって、私たちは自然かつ即座にパイオニアの作品を受け入れました。」 私はインドにおける彼の躍進を熱烈に支持しており、フラクタル ゲノミクスにおける彼の発見とその先駆的なフラクタル アプローチに精通しています。 「インドではすべてがフラクタルである」ということがよく言われていますが、私たちは西洋文化について無知ではありません。 実際、ヨーロッパの数学者は非常に高く評価されています。 アルキメデス、ピタゴラス、ユークリッドなどは、1600 年代においてもフランスの哲学者であり自然科学者であるデカルトの心に大きな影響を与えていたことは明らかです。 ニュートンのユークリッド幾何学とアインシュタインの画期的な理論と観察は、哲学者イマヌエル・カントと同等でした。 私たちはユークリッドについてほとんど知りませんし、ピタゴラスについてもあまりにも知りません。 これらの線に沿って、いくつかの鋭い洞察が
生物学への応用は数学、すなわちオイラー、ガウス、ヤコビ、デイヴィッド・ヒルベルトによって形作られ、その後に物理学の巨人ニールス・ボーア、エルヴィン・シュレディンガー、ジョン・フォン・ノイマンが続いた。 思考機械はアラン・チューリングによって投影されました。 生物学とゲノミクスに興味を持つ物理学者は一般的でした。 エルヴィン・シュレーディンガー著「人生とは何か」を参照。
この時点で、フランスのフラクタルの巨人、ブノワ・マンデルブロが台頭しました。彼はフラクタルとフラクタル理論を受け入れましたが、ジョン・フォン・ノイマンが生物学に数学を適用するよう主張した後でも、生物学者には準備ができていないと推測し、生命科学からは距離を置きました。 大野晋氏が提唱したセントラル・ドグマはちょうど60年前に出版され、XNUMX年前には中国のBGIがシリコンバレーのコンプリート・ゲノミクス社を買収した。
数学はすべての科学の母です。 ノーバート・ウェイナーはフィードバックを中心とした独特の学問分野であるサイバネティクスを考案し、一方クリックと大野はセントラル・ドグマとジャンクDNAの「フィードバックなし」の概念を進めました。 ペリオニスの原理は両方の誤った公理を逆転させ、分子生物学を解放しました。 私たちが知っていることは、紀元前 5000 年までに始まったと推測されるインドのヴェーダ時代に、インドの数学と天文学がヴェーダの碑文に埋め込まれていたということです。 当時の主な科学者は、紀元前 4000 年のディルガタマス ママテヤで、古代インドを統治し、偉大な学者であり聖人でもあったバーラタ王の司祭でした。 「フラクタル」という用語は 1920 年代後半にマンデルブロ博士によって造られましたが、その概念はサルバストラに遡ります（スートラは「公式」を意味します）。 おそらく、シュリ ヤントラ図には、円周率と黄金比という 1900 つの無理数の適用が含まれています。 この「文化的世界旅行」は、現在のインドに由来するものと関連しているように思われる。 ベラ・ボロバス博士は、英国ケンブリッジのトリニティ・カレッジの王立協会のフェローになりました。 ボロバス教授は、マドラス市の港湾職員でトリニティ・カレッジに連れてこられたスリニヴァサ・ラマヌジャンが、19年代の英国数学界の巨人、GH・ハーディとリトルウッドらと協力してFRSを受賞した経緯を語った。 ヤコビなどと比較したラマヌジャンも、XNUMX 年代にフラクタルの強固な基礎を築きました。 故リュック・モンタニエ教授とJCペレス氏は、新型コロナウイルス感染症が異常なフラクタル特性を示したことをほぼ即座に世界に警告することができた。
アンドラス・ペリオニス博士は生物学者、生物物理学者、コンピューター科学者であり、現在では XNUMX つの基本公理の逆転、二重異端、大野進氏が提案したジャンク DNA の概念と、大野晋氏が提案した分子生物学のセントラル ドグマと考えられているものを提案しました。フランシス・クリック。 こうして、ゲノミクスにおけるポストモダンの時代は「再帰的ゲノム機能の原理」から始まりました。 ペリオニスの原理は、大野晋の「ジャンク DNA」とフランシス クリックの「セントラル ドグマ」の両方の誤った公理を覆しました。 故ブノワ・マンデルブロの評価は非常に遅れました。
私たちが一貫して信じていたのは、そもそもゲノム編集による遺伝性疾患の治療法が手頃な価格で低コストで提供されることであり、これは 1987 年と 2002 年に石野裕氏とモニカ氏による偶然の発見に基づいており、その後、ジェニファー・ダウドナ氏とエマヌル・シャルパンティエ氏が再プログラムしたツールが使用された。クリスパー。 その後、ゲノミクスとゲノミクスの数学化における美しいコラボレーションの精神と提案が生まれました。 遺伝子編集が必要です。 まず、疾患ゲノムのフラクタル欠陥の解読ですが、現在の限界と理解では、スペルチェッカーのように文法エラーをスキャンするようにカンマとピリオドを判断するだけで、小さなものから大きなものまでの欠失と追加を特定できません。これがそのようなフラクタル欠陥であることがわかっています。コピー数のバリエーション。 肺がんは、乳がん、結腸がん、前立腺がんと並んで、米国で最も蔓延している死亡者数です。 言ってみれば、肺はフラクタルの特徴です。 癌性腫瘍も同様です。
何を編集するか明確ではない現在、方程式の一部は十分に確立されていると考えられていますが、科学者たちが競い合って生殖細胞系列の編集に着手しているため、確立されていると考えられます。 CRISPR-CAS9 と TALENS の作用機序は確立されつつある一方で、我が国の科学者たちは名声を得るために競争して遺伝子を編集していますが、悲しいことに、がん型の複雑な疾患において何をどこを編集すればよいのかはわかっておらず、また、遺伝子の編集も制限されています。 -そうでなければ最小化する必要がある効果をターゲットにします。
私たちが行っているのは、横断的なアプローチです。 生物学者は、配列決定された T2 から T2 ゲノムの解析さえも完全には達成していません。 人々はゲノム配列の完全な解釈を行わずにただ配列を解いているだけですが、私たちは驚くべき速度でビッグデータを注ぎ続けています。
このようにして私たちは、規制のハードルを最小限に抑えることができるインド、東部、その他発展途上のLMIC諸国向けに、低コストで手頃な価格のゲノムソリューションに従うよう科学者や商業界を説得しようと、かなり危険な茨の道に乗り出しました。 「将来の製薬はIT主導になるだろう。」 エリック・トポル博士が有名な著書『医学の創造的破壊』で提唱しているように、スマートフォンはゲノム医療に革命を起こすでしょう。
発見 20 世紀の代表的なインドのトウモロコシの名声、バーバラ マクリントック。 科学史にとって、それはあまり重要ではないかもしれません。 がんをなくすことは人類にとって死活問題となる。 最後にゲノム編集に関する地理戦略に関するメモです。 安全保障や諜報関係者の多くは、ゲノムは 編集 それは大量レベルで破壊を引き起こす可能性があるだけでなく、ゲノム操作で設計された兵士が生まれる可能性があるため、懸念の原因です。
情報界は、軽度に強力なゲノム操作バージョンのバイオ兵器の可能性が遠いという警告と可能性を無視することはできません。 これはガレージ風の DIY サイエンスではありませんが、科学者たちがすでに取り組んでいることは周知の事実です。 いわゆる当業者が最初に何を編集すべきかをほとんど解読できないとしても、現時点では悪用の危険は少なくとも現実からはほど遠いものである。 デザイナーベイビーが歓迎されず、生殖系列編集が規制の対象となる議論の多い問題である場合。 病気に対するゲノム編集は、今後 21 年、そして XNUMX 世紀の遺伝子工学の本当の可能性であると考えることができます。
フラクタルは古代インドの文化、建築、数学、現在ではコンピューター サイエンスとソフトウェアに深く組み込まれているため、フラクタル ゲノミクスは理にかなっており、インドと発展途上国にとってホームランとなるでしょう。 インドにとって、ゲノミクス事業という言葉の領域を主張できる稀な機会だ。 リンデンマイヤー フラクタルの象徴性は、この作品の作者である私に吸収されました。 インドはポストゲノム時代の世界で正当な地位を築くために、ゲノミクス事業の世界に力を入れなければならない。
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