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腫瘍の不均一性の定量化:データ取得からメトリック生成まで

日付:

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    • ポリアクK。

    腫瘍形成:それは村を取ります。

    ナットガン牧師。 2015。 15: 473-483

    • ハイリーCT
    • スワントンC。

    空間的および時間的な癌の進展:腫瘍の多様性の原因と結果。

    クリン メド。 2014。 14: s33-s37

    • ハイリーC。

    腫瘍内の不均一性を解読し、ドライバーイベントを一時的に取得して、精密医療を洗練させます。

    ゲノムバイオロジー。 2014。 15: 453

  • 腫瘍微小環境における空間的不均一性。

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    腫瘍内の不均一性と治療抵抗性への取り組み。

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    サンプル調製とトップダウンタンパク質分析を実行するための包括的なガイド。

    プロテオーム。 2017。 5: 1-31

    • カプリオッティAL

    サンプル前処理のための磁性固相抽出の最近の応用。

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    • HosicS。

    単一細胞分析のためのマイクロ流体サンプル調製。

    アナル。 Chem。 2016。 88: 354-380

    • ヘザーJM
    • チェーンB。

    シーケンサーのシーケンス:DNAシーケンスの歴史。

    ゲノミクス。 2016。 107: 1-8

    • アマラシンゲSL

    ロングリードシーケンスデータ分析の機会と課題。

    ゲノムバイオロジー。 2020。 21: 30

    • ストロムSP

    臨床次世代シーケンシング腫瘍学検査の現在の慣行とガイドライン。

    CancerBiol。 Med。 2016。 13: 3-11

  • 次世代シーケンシングとその臨床応用。

    CancerBiol。 Med。 2019。 16: 4-10

    • ティンプW。
    • ティンプG。

    質量分析を超えて、プロテオミクスの次のステップ。

    サイエンス。 前売 2020。 6: 1-17

    • Duong VA

    ボトムアッププロテオミクス用のXNUMX次元液体クロマトグラフィープラットフォームのレビュー。

    Int。 J.Mol。 Sci。 2020。 23: 1524

    • ラスIV、CW

    多くの場合意味がないのに、MSパフォーマンスの尺度として信号対雑音比を使用するのはなぜですか。

    Curr。 トピックス質量分析。 2011。 9: 28-33

    • StoeckliM。

    イメージング質量分析:哺乳類組織におけるタンパク質発現の分析のための新技術。

    Nat。 メド。 2001。 7: 493-496

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    ナノポアを使用した単一タンパク質のリアルタイム形状近似とフィンガープリント。

    Nat。 ナノテク。 2017。 12: 360-367

    • チャンQ。
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    固形腫瘍生物学におけるフローサイトメトリーの新たな応用。

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    • グリュンD。
    • vanOudenaardenA。

    シングルセルシーケンシング実験の設計と分析。

    セル。 2015。 163: 799-810

    • ワイアットシールズIV、C。

    マイクロ流体セルソーティング:減量からまれな細胞分離への細胞分離の進歩のレビュー。

    ラボチップ。 2015。 15: 1230-1249

    • サラフィーT。

    粒子の分離と検出のための決定論的横方向変位に関するレビュー。

    ナノマイクロレット。 2019。 11: 77

    • プンジヤM。

    誘電泳動セルトラッピングとACエレクトロポレーションを同時に行うためのフロースルーデバイス。

    サイ。 担当者 2019。 9: 1-11

    • サリバAE

    自己組織化磁気アレイにおける癌細胞のマイクロ流体ソーティングとマルチモーダルタイピング。

    手順 Natl。 アカド。 サイ。 米国 2010。 107: 14524-14529

    • オーガストソンP。

    音響泳動に基づく血液中の前立腺癌細胞のマイクロ流体、ラベルフリー濃縮。

    アナル。 Chem。 2012。 84: 7954-7962

    • 黄KW。

    単一細胞の調製と分析のためのマイクロ流体統合オプトエレクトロニクスピンセット。

    ラボチップ。 2013。 13: 3721-3727

    • Sanchez-FreireV。

    遺伝子発現パターンの比較分析のためのマイクロ流体単一細胞リアルタイムPCR。

    Nat。 プロトタイプ。 2012。 7: 829-838

    • マコスコEZ

    ナノリットルの液滴を使用した個々の細胞の高度に並列化されたゲノムワイドな発現プロファイリング。

    セル。 2015。 161: 1202-1214

    • 鄭GXY

    単一細胞の超並列デジタル転写プロファイリング。

    Nat。 コミュニ 2017。 8: 14049

    • BorgströmE。

    ヒト単一細胞エクソームシーケンシングのための全ゲノム増幅技術の比較。

    PLoSのONE。 2017。 12e0171566

    • ローソンDA

    単一細胞の解像度での腫瘍の不均一性と転移。

    Nat。 セルバイオル。 2018。 20: 1349-1360

    • StavrakisS。

    ハイスループットマイクロ流体イメージングフローサイトメトリー。

    Curr。 意見。 バイオテクノロジー。 2019。 55: 36-43

    • SohrabiS。

    液滴マイクロフルイディクス:基礎とその高度なアプリケーション。

    RSC Adv。 2020。 10: 27560-27574

    • SarkarS。

    マイクロ流体液滴における単一細胞レベルでの免疫および癌細胞相互作用の動的分析。

    バイオマイクロフルイディクス。 2016。 10: 1-12

    • バンデューラDR

    質量分析:誘導結合プラズマ飛行時間型質量分析に基づくリアルタイム単一細胞マルチターゲットイムノアッセイの手法。

    アナル。 Chem。 2009。 81: 6813-6822

    • ワーグナーJ。

    ヒト乳がんの腫瘍と免疫生態系の単一細胞アトラス。

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  • 完全に調理された魚。

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    • チェンKH

    単一細胞における空間的に分解された高度に多重化されたRNAプロファイリング。

    科学。 2015。 348: 1360-1363

    • ガイスGK

    色分けされたプローブペアによる遺伝子発現の直接多重測定。

    Nat。 バイオテクノロジー。 2008。 26: 317-325

    • リーJH

    insituでの高度に多重化された細胞内RNAシーケンシング。

    科学。 2014。 343: 1360-1363

    • ペインAC

    インサイチュゲノムシーケンシングは、無傷の生物学的サンプルのDNA配列と構造を解決します。

    科学。 2021。 371eaay3446

    • ロドリケスSG

    Slide-seq:高空間分解能でゲノムワイドな発現を測定するためのスケーラブルなテクノロジー。

    科学。 2019。 363: 1463-1467

    • サカSK

    Immuno-SABERは、組織内で高度に多重化および増幅されたタンパク質イメージングを可能にします。

    Nat。 バイオテクノロジー。 2019。 37: 1080-1090

    • シュルヒCM

    調整された細胞の近隣は、結腸直腸癌の浸潤前線で抗腫瘍免疫を調整します。

    セル。 2020。 182: 1341-1359

    • ギーゼンC。

    マスサイトメトリーによる細胞内分解能を備えた腫瘍組織の高度に多重化されたイメージング。

    Nat。 メソッド。 2014。 11: 417-422

    • アンジェロM.

    ヒト乳房腫瘍の多重イオンビームイメージング。

    Nat。 メド。 2014。 20: 436-442

    • エスピナV。

    レーザーキャプチャーマイクロダイセクション。

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    • チェンL.

    トランスレーショナルリサーチにおけるレーザー支援顕微解剖。

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    レーザーキャプチャーマイクロダイセクション:小さなサンプルからのビッグデータ。

    ヒストリー。 ヒストパトール。 2015。 30: 1255-1269

    • スミスEA
    • ホッジスHC

    単一細胞技術によって明らかにされた腫瘍生態系の空間的およびゲノム階層。

    トレンドがん。 2019。 5: 411-425

    • AdeyN。

    スライドに取り付けられた組織を解剖するためのミルベースの機器およびソフトウェアシステムで、デジタルガイダンスとドキュメントを提供します。

    BMCクリニックPathol。 2013。 13: 1-12

    • Lovchik RD

    マイクロ流体プローブを使用したマイクロ免疫組織化学。

    ラボチップ。 2012。 12: 1040-1043

    • KashyapA。

    腫瘍組織の免疫染色の等級付けのための定量的微小免疫組織化学。

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    • フーバーD。
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    組織切片における迅速なマイクロ蛍光insituハイブリダイゼーション。

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    • フォイトフォンフォイトバーグL。

    腫瘍の不均一性を明らかにするための空間的に多重化されたRNAinsituハイブリダイゼーション。

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    サンプリング方法論をゲノムワークフローにマイクロスケールで統合することにより、組織切片の空間的な遺伝的景観をマッピングします。

    小さい。 2021。 17: 2007901

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    マイクロスケールの流れ閉じ込め検索と等速電気泳動精製によって可能になった組織切片の空間的に分解された遺伝子解析。

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    Nat。 メソッド。 2019。 16: 533-544

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  • 単一細胞メタボロミクス:分析的および生物学的展望。

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    CTベースの放射性腫瘍生息地の超音波ガイド下標的生検:転移性卵巣癌の技術開発と初期経験。

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    腫瘍内の遺伝子の不均一性の新しい尺度であるMATHは、頭頸部扁平上皮癌の転帰不良クラスで高い。

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