Zephyrnet-logo

Vooruitgang in nanodisc-platforms voor zuivering van membraaneiwitten

Datum:

    • Yin H.
    • Flynn AD

    Membraaneiwitinteracties drogeren.

    Ann. ds. Biomed. Ing. 2016; 18: 51-76

    • García-Nafría J.
    • Tate CG

    Cryo-elektronenmicroscopie: verder gaan dan röntgenkristalstructuren voor medicijnreceptoren en medicijnontwikkeling.

    Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2019; 60: 51-71

    • SG patchen

    Oppervlakte-plasmonresonantiespectroscopie voor karakterisering van membraaneiwit-ligand-interacties en het potentieel ervan voor het ontdekken van geneesmiddelen.

    Biochim. Biophys. Acta. 2014; 1838: 43-55

    • Opella SJ
    • Marassi FM

    Structuurbepaling van membraaneiwitten door middel van NMR-spectroscopie.

    Chem. ds. 2004; 104: 3587-3606

    • Timmerman EP
    • et al.

    De uitdagingen van membraaneiwitkristallografie overwinnen.

    Curr. Opin. structuur Biol. 2008; 18: 581-586

    • Privé GG

    Detergenten voor de stabilisatie en kristallisatie van membraaneiwitten.

    Methods. 2007; 41: 388-397

    • Bayburt TH
    • Sligar SG

    Zelfassemblage van enkelvoudige integrale membraaneiwitten in oplosbare fosfolipidendubbellagen op nanoschaal.

    Prot. Wetenschap. 2009; 12: 2476-2481

    • Leitz A.J
    • et al.

    Functionele reconstitutie van β2-adrenerge receptoren met behulp van zelfassemblerende nanodisc-technologie.

    Biotechnieken. 2006; 40: 601-612

    • Denisov IG
    • et al.

    Gerichte zelfassemblage van monodisperse fosfolipide dubbellaagse nanodiscs met gecontroleerde grootte.

    J. Am. Chem. Soc. 2004; 126: 3477-3487

    • Shaw AW
    • et al.

    Faseovergangen van fosfolipiden in homogene dubbellaagse schijven op nanometerschaal.

    FEBS Lett. 2004; 556: 260-264

    • Arana MR
    • et al.

    Functionele en structurele vergelijking van de ABC-exporteur MsbA bestudeerd in wasmiddel en gereconstitueerd in nanodiscs.

    Biochem. Biophys. Res. Commun. 2019; 512: 448-452

    • Reis RI
    • Moraes ik.

    Onderzoek naar de assemblage van membraaneiwitten in nanodiscs door in situ dynamische lichtverstrooiing: A2a-receptor als casestudy.

    Biologie (Bazel). 2020; 9: 400

    • Bocket N.
    • et al.

    Real-time monitoring van bindingsgebeurtenissen op een thermisch gestabiliseerde menselijke A2A-receptor ingebed in een lipidedubbellaag door oppervlakte-plasmonresonantie.

    BBA Biomembr. 2015; 1848: 1224-1233

    • Staus DP
    • et al.

    Structuur van het M2-muscarinereceptor-β-arrestinecomplex in een lipide nanodisc.

    Natuur. 2020; 579: 297-302

    • Schen PS
    • et al.

    De structuur van het polycysteuze nierziektekanaal PKD2 in lipide nanodiscs.

    Cel 2016; 167: 763-773

    • Winterstein LM
    • et al.

    Reconstitutie en functionele karakterisering van ionkanalen van nanodiscs in lipidedubbellagen.

    J. Generaal Physiol. 2018; 150: 637-646

    • Autzen HE
    • et al.

    Structuur van het menselijke TRPM4-ionkanaal in een lipide nanodisc.

    Science. 2018; 359: 228-232

    • Borch J.
    • et al.

    Nanodiscs voor immobilisatie van lipidedubbellagen en membraanreceptoren: kinetische analyse van de binding van choleratoxine aan een glycolipidereceptor.

    Anaal. Chem. 2008; 80: 6245-6252

    • Boldog T.
    • et al.

    Nanodiscs scheiden chemoreceptor-oligomere toestanden en onthullen hun signaaleigenschappen.

    PNAS. 2006; 103: 11509-11514

    • Frauenfeld J.
    • et al.

    Een saposine-lipoproteïne-nanodeeltjessysteem voor membraaneiwitten.

    nat. Methoden. 2016; 13: 345-351

    • Flayhan A.
    • et al.

    Saposin-lipide-nanodeeltjes: een zeer veelzijdige en modulaire tool voor onderzoek naar membraaneiwitten.

    Structuur. 2018; 26: 345-355

    • Dorr JM
    • et al.

    Het styreen-maleïnezuurcopolymeer: ​​een veelzijdig hulpmiddel bij membraanonderzoek.

    EUR. Biophys. J. 2016; 45: 3-21

    • Ravula T.
    • et al.

    Polymeer nanodiscs: voordelen en beperkingen.

    Chem. Fysiek. Lipiden. 2019; 219: 45-49

    • Fiori MC
    • et al.

    Polymeer nanodiscs: schijfvormige amfifiele blokcopolymeermembranen als een nieuw platform voor membraaneiwitten.

    Sci. Rep. 2017; 7: 15227

    • Smit AAA
    • et al.

    Lipide nanodiscs via geordende copolymeren.

    Chem. 2020; 6: 2782-2795

    • Laurens T.
    • et al.

    Karakterisering van een dynamisch metabolon dat de afweerverbinding dhurrin in sorghum produceert.

    Science. 2016; 354: 890-893

    • Morrison KA
    • et al.

    Ontwikkeling van methodologie om de oppervlakte SMALPome van zoogdiercellen te onderzoeken.

    Voorkant. Mol. Biosc. 2021; 8780033

    • Thakur N.
    • et al.

    Productie van mens A2AAR in lipide nanodiscs voor 19F-NMR en fluorescentiespectroscopie met één molecuul.

    STAR-protocol. 2022; 3101535

    • Hagn F.
    • et al.

    Assemblage van fosfolipide nanodiscs van gecontroleerde grootte voor structurele studies van membraaneiwitten door NMR.

    Nat. Protoc. 2018; 13: 79-98

    • Lloris-Garcerá P.
    • et al.

    DirectMX - Reconstitutie in één stap van membraaneiwitten van ruwe celmembranen in salipro-nanodeeltjes.

    Voorkant. Bioeng. Biotechnol. 2020; 8: 215

    • Lyon JA
    • et al.

    Saposine-lipoproteïne steigers voor structuurbepaling van membraantransporters.

    Methoden Enzymol. 2017; 594: 85-99

    • Bal LE
    • et al.

    Invloed van DIBMA-polymeerlengte op de vorming van lipide nanodiscs en membraaneiwitextractie.

    Biomacromoleculen. 2021; 22: 763-772

    • Logez C.
    • et al.

    Wasmiddelvrije isolatie van functionele G-eiwit-gekoppelde receptoren in nanometrische lipidedeeltjes.

    Biochemie. 2016; 55: 38-48

    • Lavington S.
    • Watt A.

    Detergentvrije solubilisatie en zuivering van een G-eiwit-gekoppelde receptor met behulp van een polymethacrylaatpolymeer.

    Biochim. Biofysica. Acta Biomembr. 2021; 1863183441

    • Dimitrova VS
    • et al.

    Alternatieven voor wasmiddelen: zuivering van membraaneiwitten met behulp van synthetische nanodisc-polymeren.

    Methoden Mol. Biol. 2022; 2507: 375-387

    • Bayburt TH
    • et al.

    Zelfassemblage van schijfvormige fosfolipide dubbellaagse nanodeeltjes met membraansteigereiwitten.

    Nano Let. 2002; 2: 853-856

    • Inagaki S.
    • et al.

    Biofysische karakterisering van membraaneiwitten in nanodiscs.

    Methods. 2013; 59: 287-300

    • Haar C.
    • et al.

    De ladingseigenschappen van fosfolipide nanodiscs.

    Biophys. J. 2016; 111: 989-998

    • Julien JA
    • et al.

    Snelle voorbereiding van nanodiscs voor biofysische studies.

    Boog. Biochem. Biofysica. 2021; 712109051

    • Mak S.
    • et al.

    Express opname van membraaneiwitten van verschillende menselijke celtypen in fosfolipide dubbellaagse nanodiscs.

    Biochem. J. 2017; 474: 1361-1371

    • Civjan N.
    • et al.

    Directe solubilisatie van heteroloog tot expressie gebrachte membraaneiwitten door opname in lipidedubbellagen op nanoschaal.

    Biotechnieken. 2003; 35: 556-563

    • Duan H.
    • et al.

    Co-integratie van heteroloog uitgedrukt Arabidopsis cytochroom P450- en P450-reductase in oplosbare lipidedubbellagen op nanoschaal.

    Boog. Biochem. Biofysica. 2004; 424: 141-153

    • Marty MT
    • et al.

    Nanodisc-gesolubiliseerde membraaneiwitbibliotheek weerspiegelt het membraanproteoom.

    Anaal. Bioanal. Chem. 2013; 405: 4009-4016

    • Zhao DY
    • et al.

    Cryo-EM-structuur van het inheemse rodopsine-dimeer in nanodiscs.

    J. Biol. Chem. 2019; 294: 14215-14230

    • Bayburt TH
    • et al.

    Activering van transducine door lipidedubbellagen op nanoschaal die één en twee rodopsines bevatten.

    J. Biol. Chem. 2007; 282: 14875-14881

    • Huang W.
    • et al.

    Structuur van de neurotensinereceptor 1 in complex met β-arrestine 1.

    Natuur. 2020; 579: 303-308

    • Lee Y.
    • et al.

    Moleculaire basis van β-arrestinekoppeling aan formoterol-gebonden β1-adrenoceptor.

    Natuur. 2020; 583: 862-866

    • Maharadja J.
    • et al.

    Opkomende structurele inzichten in GPCR-β-arrestine-interactie en functionele resultaten.

    Curr. Opin. structuur Biol. 2022; 75102406

    • Zhang M.
    • et al.

    Cryo-EM-structuur van een geactiveerd GPCR-G-eiwitcomplex in lipide nanodiscs.

    nat. structuur. Mol. Biol. 2021; 28: 258-267

    • Nasr ML
    • et al.

    Covalent gecirculariseerde nanodiscs voor het bestuderen van membraaneiwitten en virale binnenkomst.

    nat. Methoden. 2017; 14: 49-52

    • Johansen NT
    • et al.

    Circulaire en oplosbaarheid-verbeterde MSP's vergemakkelijken de eenvoudige en hoogrenderende productie van stabiele nanodiscs voor studies van membraaneiwitten in oplossing.

    FEBS J. 2019; 286: 1734-1751

    • Zon R.
    • et al.

    Nanodiscs met natieve β1-adrenerge receptor als een nieuwe benadering voor de detectie van pathologische auto-antilichamen bij patiënten met gedilateerde cardiomyopathie.

    J. Appl. Laboratorium. Med. 2019; 4: 391-403

    • Gardill B.
    • et al.

    Nanodisc-technologie vergemakkelijkt de identificatie van monoklonale antilichamen gericht op multi-pass membraaneiwitten.

    Sci. Rep. 2020; 10: 1130

    • Shamin M.
    • et al.

    Een tetramere assemblage van saposine A: toenemende structurele diversiteit in lipidenoverdrachtseiwitten.

    Contact. 2021; 4: 1-11

    • Kishimoto Y.
    • et al.

    Saposins: structuur, functie, distributie en moleculaire genetica.

    J. Lipid-onderzoek. 1992; 33: 1255-1267

    • Popovic K.
    • et al.

    Structuur van saposine A-lipoproteïneschijven.

    PNAS. 2011; 109: 2908-2912

    • Chien CTH
    • et al.

    Een aanpasbaar fosfolipidenmembraan-mimetisch systeem voor NMR-studies in oplossing van membraaneiwitten.

    J. Am. Chem. Soc. 2017; 139: 14829-14832

    • Rahman MM
    • et al.

    Zuivering van een natieve nicotinereceptor.

    Methoden Enzymol. 2021; 653: 189-206

    • Zhou F.
    • et al.

    Footprinting massaspectrometrie van membraaneiwitten: ferroportine gereconstitueerd in saposine A picodiscs.

    Anaal. Chem. 2021; 93: 11370-11378

    • Du D.
    • et al.

    Interacties van een bacteriële RND-transporter met een transmembraan klein eiwit in een lipide-omgeving.

    Structuur. 2020; 28: 625-634

    • Zhang K.
    • et al.

    Fusie-eiwitstrategieën voor cryo-EM-studie van G-eiwit-gekoppelde receptoren.

    Nat. Commun. 2022; 13: 4366

    • Rahman MM
    • et al.

    Structuur van de natieve nicotinereceptor van het spiertype en remming door slangengiftoxines.

    Neuron. 2020; 106: 952-962

    • Noviello CM
    • et al.

    Structuur en poortmechanisme van de α7-nicotine-acetylcholinereceptor.

    Cel 2021; 184: 2121-2134

    • Gharpure A.
    • et al.

    Agonistselectiviteit en ionenpermeatie in de α3β4 ganglion nicotinereceptor.

    Neuron. 2019; 104: 501-511

    • Hawkins OP
    • et al.

    Membraaneiwitextractie en -zuivering met behulp van gedeeltelijk veresterde SMA-polymeren.

    Biochim. Biofysica. Acta Biomembr. 2021; 1863183758

    • Knowles TJ
    • et al.

    Membraaneiwitten intact opgelost in lipide bevattende nanodeeltjes begrensd door styreen-maleïnezuurcopolymeer.

    J. Am. Chem. Soc. 2009; 131: 7484-7485

    • Bada Juárez JF
    • et al.

    Wasmiddelvrije extractie van een functionele GPCR met lage expressie uit een menselijke cellijn.

    Biochim. Biofysica. Acta Biomembr. 2020; 1862183152

    • Morrison KA
    • et al.

    Membraaneiwitextractie en -zuivering met behulp van styreen-maleïnezuur (SMA) copolymeer: ​​effect van variaties in polymeerstructuur.

    Biochem. J. 2016; 473: 4349-4360

    • Dorr JM
    • et al.

    Wasmiddelvrije isolatie, karakterisering en functionele reconstitutie van een tetrameer K+ channel: de kracht van native nanodiscs.

    Proc. Natl. Acad. Sci. VS 2014; 111: 18607-18612

    • Stroud Z.
    • et al.

    Zuivering van membraaneiwitten vrij van conventionele detergenten: SMA, nieuwe polymeren, nieuwe kansen en nieuwe inzichten.

    Methods. 2018; 147: 106-117

    • Qiu W.
    • et al.

    Structuur en activiteit van lipidedubbellaag binnen een membraan-eiwittransporter.

    PNAS. 2018; 115: 12985-12990

    • Parmar M.
    • et al.

    Een SMALP-platform gebruiken om een ​​sub-nm single-particle cryo-EM-membraaneiwitstructuur te bepalen.

    Biochim. Biofysica. Acta Biomembr. 2018; 1860: 378-383

    • Li J.
    • et al.

    Cryo-EM structuren van Escherichia coli cytochroom bo3 onthullen gebonden fosfolipiden en ubiquinon-8 in een dynamische substraatbindingsplaats.

    Proc. Natl. Acad. Sci. VS 2021; 118e2106750118

    • zon C.
    • et al.

    Structuur van het alternatieve complex III in een supercomplex met cytochroomoxidase.

    Natuur. 2018; 557: 123-126

    • Hal SCL
    • et al.

    Een zuurcompatibel copolymeer voor het oplossen van membranen en eiwitten tot nanodeeltjes die een lipidedubbellaag bevatten.

    Nanoschaal. 2018; 10: 10609-10619

    • Ravula T.
    • et al.

    Bio-geïnspireerde, op grootte afstembare zelfassemblage van polymeer-lipide dubbellaagse nanodiscs.

    Ange. Chem. Int. Ed. 2017; 56: 11466-11470

    • Ravula T.
    • et al.

    Vorming van pH-resistente monodisperse polymeer-lipide nanodiscs.

    Ange. Chem. 2018; 130: 1356-1359

    • Ravula T.
    • et al.

    Effect van polymeerlading op functionele reconstitutie van membraaneiwitten in polymeer nanodiscs.

    Chem. gemeenschappelijk. 2018; 54: 9615-9618

    • Ravula T.
    • RamamoorthyA.

    Meting van resterende dipolaire koppelingen met behulp van magnetisch uitgelijnde en omgedraaide nanodiscs.

    Langmuir. 2022; 38: 244-252

    • Ravula T.
    • RamamoorthyA.

    Magnetische uitlijning van polymeer macro-nanodiscs maakt op residu-dipolaire koppeling gebaseerde structurele studies met hoge resolutie mogelijk door NMR-spectroscopie.

    Ange. Chem. Int. Ed. 2019; 58: 14925-14928

    • Oluwole AO
    • et al.

    Solubilisatie van membraaneiwitten in functionele lipide-dubbellaag nanodiscs met behulp van een diisobutyleen/maleïnezuurcopolymeer.

    Ange. Chem. 2017; 56: 1919-1924

    • Yasuhara K.
    • et al.

    Spontane vorming van lipide nanoschijven door amfifiele polymethacrylaatcopolymeren.

    J. Am. Chem. Soc. 2017; 139: 18657-18663

    • Ravula T.
    • et al.

    Synthese, karakterisering en nanodisc-vorming van niet-ionische polymeren.

    Ange. Chem. Int. Ed. 2021; 60: 16885-16888

    • Gulamhussein AA
    • et al.

    Een vergelijking van SMA (styreenmaleïnezuur) en DIBMA (di-isobutyleenmaleïnezuur) voor membraaneiwitzuivering.

    Biochim. Biofysica. Acta Biomembr. 2020; 1862183281

    • Voskoboynikova N.
    • et al.

    Lipidendynamiek in diisobutyleen-maleïnezuur (DIBMA) lipidedeeltjes in aanwezigheid van sensorische rodopsine II.

    Int. J. Mol. Sci. 2021; 22: 2548

    • Harwood CR
    • et al.

    Functionele solubilisatie van de β2-adrenoceptor met behulp van diisobutyleenmaleïnezuur.

    iWetenschap. 2021; 24103362

    • Oluwole AO
    • et al.

    Vorming van lipide-bilayer nanodiscs door diisobutyleen/maleïnezuur (DIBMA) copolymeer.

    Langmuir. 2017; 33: 14378-14388

    • Krishnarjuna B.
    • et al.

    Verbetering van de stabiliteit en homogeniteit van niet-ionische polymeer nanodiscs door elektrostatische interacties af te stemmen.

    J. Colloïde Interface Sci. 2023; 634: 887-896

    • Krishnarjuna B.
    • et al.

    Niet-ionische inuline-gebaseerde polymeer nanodiscs maken functionele reconstitutie mogelijk van een redoxcomplex bestaande uit tegengesteld geladen CYP450 en CPR in een lipide dubbellaagse membraan.

    Anaal. Chem. 2022; 94: 11908-11915

    • Kehlenbeck DM
    • et al.

    Vergelijking van lipidische dragersystemen voor integrale membraaneiwitten - MsbA als casestudy.

    Biol. Chem. 2019; 400: 1509-1518

    • Denisov IG
    • et al.

    Coöperativiteit in cytochroom P450 3A4: koppelingen in substraatbinding, spintoestand, ontkoppeling en productvorming.

    J. Biol. Chem. 2007; 282: 7066-7076

    • Grinkova Yv
    • et al.

    Engineering van verlengde membraansteiger-eiwitten voor zelfassemblage van oplosbare lipidedubbellagen op nanoschaal.

    Eiwit Eng. des. Sel. 2010; 23: 843-848

    • Hagn F.
    • et al.

    Geoptimaliseerde fosfolipide dubbellaagse nanodiscs vergemakkelijken structuurbepaling met hoge resolutie van membraaneiwitten.

    J. Am. Chem. Soc. 2013; 135: 1919-1925

    • Miehling J.
    • et al.

    Een op split-inteïne gebaseerde methode voor de efficiënte productie van circulaire nanodiscs voor structurele studies van membraaneiwitten.

    ChemBioChem. 2018; 19: 1927-1933

    • Jozef Y.
    • et al.

    Optimalisatie van de productie van covalent gecirculariseerde nanodiscs en hun karakterisering in fysiologische omstandigheden.

    Langmuir. 2018; 34: 3525-3532

    • Zhang S.
    • et al.

    Constructie in één stap van circulaire nanodiscs met behulp van SpyCatcher-SpyTag.

    Nat. Commun. 2021; 12: 5451

  • spot_img

    Laatste intelligentie

    spot_img