Zephyrnet-logo

NCI's CPTAC geeft nieuwe proteogenomische dataset vrij

Datum:

Een conceptueel beeld van een onderzoeker die wat vloeistof in een reageerbuisje pipettert. Chemische structuren zweven rond het beeld.

De uitgebreide proteogenomische dataset zou veel nieuwe ontdekkingen op het gebied van kankeronderzoek mogelijk kunnen maken.

Krediet: iStock

Wat

De National Institutes of Health geeft een uitgebreide dataset vrij die genomische, proteomische, beeldvormende en klinische gegevens uit individuele onderzoeken van meer dan 1,000 tumoren in 10 soorten kanker standaardiseert. Onderzoekers van over de hele wereld zullen deze openbaar beschikbare bron kunnen gebruiken om nieuwe moleculaire inzichten te ontdekken in de manier waarop kanker zich ontwikkelt en vordert. De dataset is gegenereerd door het Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) van het National Cancer Institute, onderdeel van de National Institutes of Health.

De proteogenomische dataset voor pan-kanker, die wordt beschreven in a paper gepubliceerd in Cancer Cell, bouwt op decennia van technologische vooruitgang in de proteomische wetenschap. De lancering van deze dataset ondersteunt het Cancer Moonshot℠-doel van de Biden-Harris Administration om het kankeronderzoek te versnellen door een betere uitwisseling van gegevens. Twee aanvullende onderzoeksartikelen gepubliceerd in Cel door CPTAC-onderzoekers bieden een eerste demonstratie van het potentieel van de dataset als een waardevolle bron voor wetenschappelijke ontdekkingen. In het eerste artikel wordt gebruik gemaakt van multi-omic-analyses mutaties van kankerdrivers koppelen aan eiwitpatronen. Het tweede artikel gaat daar dieper op in eiwitmodificaties die celsignalering en fysiologie reguleren om associaties aan te tonen met DNA-reparatie, metabolisme en immuniteit bij verschillende tumortypen.

De proteogenomische dataset voor pan-kanker zal publiekelijk beschikbaar zijn via de NCI Cancer Research Data Commons-repository's. Proteomics-gegevens zijn toegankelijk via de Proteomic Data Commons op https://pdc.cancer.gov/pdc/cptac-pancancer. Genomische en transcriptomische gegevens zijn toegankelijk via de Genomic Data Commons op https://portal.gdc.cancer.gov en de Cancer Data Service op https://dataservice.datacommons.cancer.gov/.

Wie

Henry Rodriguez, Ph.D., MBA, en Ana I. Robles, Ph.D., Afdeling Kankerbehandeling en Diagnose, National Cancer Institute

De studies

"Proteogenomische gegevens en bronnen voor pan-kankeranalyse” verschijnt 14 augustus in Kanker cel. "Pan-kanker proteogenomics verbindt oncogene factoren met functionele toestanden"En"Pan-kankeranalyse van post-translationele modificaties onthult gedeelde patronen van eiwitregulatie”verschijnt op 14 augustus Cel.

Over het National Cancer Institute (NCI): NCI leidt het Nationale Kankerprogramma en de inspanningen van NIH om de prevalentie van kanker drastisch terug te dringen en de levens van kankerpatiënten en hun families te verbeteren, door onderzoek naar preventie en kankerbiologie, de ontwikkeling van nieuwe interventies en de opleiding en begeleiding van nieuwe onderzoekers. Voor meer informatie over kanker kunt u de NCI-website bezoeken op cancer.gov of bellen met het contactcentrum van NCI, de Cancer Information Service, op 1-800-4-CANCER (1-800-422-6237).

Over de National Institutes of Health (NIH): NIH, het medische onderzoeksbureau van het land, omvat 27 instituten en centra en is een onderdeel van het Amerikaanse ministerie van Volksgezondheid en Human Services. NIH is de belangrijkste federale instantie die fundamenteel, klinisch en translationeel medisch onderzoek uitvoert en ondersteunt, en onderzoekt de oorzaken, behandelingen en genezingen voor zowel veel voorkomende als zeldzame ziekten. Bezoek nih.gov voor meer informatie over NIH en zijn programma's.

spot_img

Laatste intelligentie

spot_img