Greenough, L. et al. Aanpassing van capillaire gelelektroforese als een gevoelige methode met hoge doorvoer om de karakterisering van metabolische nucleïnezuurenzymen te versnellen. Nucleic Acids Res. 44, e15 (2016).
Farag, N. et al. Opvouwbare DNA-nanoschakelaars voor het monitoren van de activiteit van DNA-reparatie-enzymen. Ange. Chem. 133, 7359â € "7365 (2021).
Luo, X. & Hsing, I.-M. Immobilisatievrije elektrochemische DNA-polymerasetest. Elektroanalyse 23, 923â € "926 (2011).
Boehr, DD, Nussinov, R. & Wright, PE De rol van dynamische conformationele ensembles bij biomoleculaire herkenning. Nat. Chem. Biol. 5, 789â € "796 (2009).
Henzler-Wildman, K. & Kern, D. Dynamische persoonlijkheden van eiwitten. NATUUR 450, 964â € "972 (2007).
Leveson-Gower, RB, Mayer, C. & Roelfes, G. Het belang van katalytische promiscuïteit voor het ontwerp en de evolutie van enzymen. nat. ds. Chem. 3, 687â € "705 (2019).
Rotman, B. Meting van de activiteit van enkele β-moleculend-galactosidase. Proc. Natl Acad. Sci. Verenigde Staten van Amerika 47, 1981â € "1991 (1961).
Vogelstein, B. & Kinzler, KW Digitale PCR. Proc. Natl Acad. Sci. Verenigde Staten van Amerika 96, 9236â € "9241 (1999).
Rondelez, Y. et al. Microgefabriceerde reeksen femtoliterkamers maken enzymologie van één molecuul mogelijk. Nat. Biotechnologie. 23, 361â € "365 (2005).
Ono, T., Ichiki, T. & Noji, H. Digitale enzymtest met behulp van attoliter-druppelarray. Analyst 143, 4923â € "4929 (2018).
Guan, Z. et al. Een zeer parallelle microfluïdische druppelmethode die het tellen van afzonderlijke moleculen mogelijk maakt voor digitale enzymdetectie. Biomicrofluïdica 8, 014110 (2014).
Rojek, MJ & Walt, DR Het observeren van afzonderlijke enzymmoleculen die bij verhitting onderling worden omgezet tussen activiteitstoestanden. PLoS One 9, e86224 (2014).
Rissin, DM & Walt, DR Digitale concentratie-uitlezing van afzonderlijke enzymmoleculen met behulp van femtoliter-arrays en Poisson-statistieken. Nano Let. 6, 520â € "523 (2006).
Liebherr, RB et al. Drie-in-één-enzymtest gebaseerd op detectie van één molecuul in femtoliter-arrays. Anaal. Bioanal. Chem. 407, 7443â € "7452 (2015).
Obayashi, Y., Iino, R. & Noji, H. Een digitale enzymtest met één molecuul waarbij gebruik wordt gemaakt van alkalische fosfatase met een op cumarine gebaseerd fluorogeen substraat. Analyst 140, 5065â € "5073 (2015).
Gorris, HH, Rissin, DM & Walt, DR Afgifte en binding van stochastische remmers van moleculen met één enzym. Proc. Natl Acad. Sci. Verenigde Staten van Amerika 104, 17680â € "17685 (2007).
Engels, BP et al. Steeds fluctuerende afzonderlijke enzymmoleculen: Michaelis-Menten-vergelijking opnieuw bekeken. Nat. Chem. Biol. 2, 87â € "94 (2006).
Hsin, T.-M. & Yeung, ES Reacties met één molecuul in liposomen. Ange. Chem. Int. Ed. 46, 8032â € "8035 (2007).
Ueno, H., Kato, M., Minagawa, Y., Hirose, Y. & Noji, H. Opheldering en controle van lage en hoge actieve populaties van alkalische fosfatasemoleculen voor kwantitatieve digitale bioassay. Eiwit Sc. 30, 1628â € "1639 (2021).
Jiang, Y., Li, X. & Walt, DR Analyse van één molecuul bepaalt isozymen van menselijke alkalische fosfatase in serum. Ange. Chem. Int. Ed. 59, 18010â € "18015 (2020).
Craig, DB, Arriaga, EA, Wong, JCY, Lu, H. & Dovichi, NJ Studies over afzonderlijke alkalische fosfatasemoleculen: reactiesnelheid en activeringsenergie van een reactie gekatalyseerd door een enkel molecuul en het effect van thermische denaturatie - de dood van een enzym. J. Am. Chem. Soc. 118, 5245â € "5253 (1996).
Sakuma, M. et al. Genetische verstoring verandert functionele substaten in alkalische fosfatase. J. Am. Chem. Soc. 145, 2806â € "2814 (2023).
Gorris, HH & Walt, DR Mechanistische aspecten van mierikswortelperoxidase opgehelderd door studies met één molecuul. J. Am. Chem. Soc. 131, 6277â € "6282 (2009).
Ehrl, BN, Liebherr, RB & Gorris, HH Kinetiek van één molecuul van mierikswortelperoxidase blootgesteld in grote reeksen gesmolten silicakamers van femtoliter-formaat. Analyst 138, 4260â € "4265 (2013).
Comellas-Aragonès, M. et al. Een op virussen gebaseerde nanoreactor met één enzym. nat. Nanotechnologie. 2, 635â € "639 (2007).
Liebherr, RB, Renner, M. & Gorris, HH Een enkel molecuulperspectief op de functionele diversiteit van in vitro geëvolueerd β-glucuronidase. J. Am. Chem. Soc. 136, 5949â € "5955 (2014).
Jiang, Y. et al. Mechanistische studie met één molecuul van enzymhysterese. ACS Cent. Wetenschap. 5, 1691â € "1698 (2019).
Watanabe, R., Sakuragi, T., Noji, H. & Nagata, S. Analyse van één molecuul van fosfolipide-vervorming door TMEM16F. Biophys. J. 114, 558a (2018).
Tan, W. & Yeung, ES Monitoring van de reacties van afzonderlijke enzymmoleculen en afzonderlijke metaalionen. Anaal. Chem. 69, 4242â € "4248 (1997).
Sakakihara, S., Araki, S., Iino, R. & Noji, H. Een enzymatische test met één molecuul in een direct toegankelijke femtoliter-druppelarray. Lab-chip 10, 3355â € "3362 (2010).
Watanabe, R. et al. Opgestelde lipidedubbellaagkamers maken analyse van membraantransporteurs met één molecuul mogelijk. Nat. Commun. 5, 4519 (2014).
Ueno, H., Sano, M., Hara, M. & Noji, H. Digitale cascadetesten voor ADP- of ATP-producerende enzymen met behulp van een femtoliter reactorarray-apparaat. ACS Sens. 8, 3400â € "3407 (2023).
Noji, H., Minagawa, Y. & Ueno, H. Op enzymen gebaseerde digitale bioassaytechnologie: sleutelstrategieën en toekomstperspectieven. Lab-chip 22, 3092â € "3109 (2022).
Cox, KJ, Subramanian, HKK, Samaniego, CC, Franco, E. & Choudhary, A. Een universele methode voor gevoelige en celvrije detectie van CRISPR-geassocieerde nucleasen. Chem. Wetenschap. 10, 2653â € "2662 (2019).
Sternberg, SH, Redding, S., Jinek, M., Greene, EC & Doudna, JA DNA-ondervraging door de CRISPR RNA-geleide endonuclease Cas9. NATUUR 507, 62â € "67 (2014).
Montagne, K., Gines, G., Fujii, T. & Rondelez, Y. Verbetering van de functionaliteit van synthetische DNA-circuits met op maat gemaakte deactivering. Nat. Commun. 7, 13474 (2016).
Gines, G. et al. Isothermische digitale detectie van microRNA met behulp van een achtergrondvrij moleculair circuit. Wetenschap. Adv. 6, eaay5952 (2020).
Shenshin, VA, Lescanne, C., Gines, G. & Rondelez, Y. Een chemische interface met kleine moleculen voor moleculaire programma's. Nucleic Acids Res. 49, 7765â € "7774 (2021).
Okumura, S. et al. Niet-lineaire besluitvorming met enzymatische neurale netwerken. NATUUR 610, 496â € "501 (2022).
Li, Y. et al. Ultragevoelige isotherme detectie van SARS-CoV-2 op basis van zelfaanzuigende haarspeld-gebruikte amplificatie van de G-rijke sequentie. Anaal. Chem. 94, 17448â € "17455 (2022).
Richardson, CD, Ray, GJ, DeWitt, MA, Curie, GL & Corn, JE Verbetering van op homologie gerichte genoombewerking door katalytisch actieve en inactieve CRISPR-Cas9 met behulp van asymmetrisch donor-DNA. Nat. Biotechnologie. 34, 339â € "344 (2016).
Raper, AT, Stephenson, AA & Suo, Z. Functionele inzichten onthuld door het kinetische mechanisme van CRISPR/Cas9. J. Am. Chem. Soc. 140, 2971â € "2984 (2018).
Phaneuf, CR et al. Ultragevoelige detectie van meerdere soorten van CRISPR-Cas9 door een draagbaar centrifugaal microfluïdisch platform. Anaal. methoden 11, 559â € "565 (2019).
Zhang, X.-P. & Heyer, W.-D. in DNA-recombinatie: methoden en protocollen (red. Tsubouchi, H.) 329-343 (Humana Press, 2011); https://doi.org/10.1007/978-1-61779-129-1_19
Tanford, C.in Vooruitgang in eiwitchemie vol. 23 (red. Anfinsen, CB et al.) 121–282 (Academic Press, 1968).
Berlett, BS & Stadtman, ER Eiwitoxidatie bij veroudering, ziekte en oxidatieve stress. J. Biol. Chem. 272, 20313â € "20316 (1997).
Liu, G., Lin, Q., Jin, S. & Gao, C. De CRISPR-Cas-toolbox en technologieën voor genbewerking. Mol. Cel 82, 333â € "347 (2022).
Phan, QA, Truong, LB, Medina-Cruz, D., Dincer, C. & Mostafavi, E. CRISPR/Cas-aangedreven nanobiosensoren voor diagnostiek. Biosens. Bio-elektron. 197, 113732 (2022).
Abate, AR, Hung, T., Mary, P., Agresti, JJ & Weitz, DA High-throughput injectie met microfluidica met behulp van pico-injectoren. Proc. Natl Acad. Sci. Verenigde Staten van Amerika 107, 19163â € "19166 (2010).
Mazutis, L. & Griffiths, AD Selectieve druppelcoalescentie met behulp van microfluïdische systemen. Lab-chip 12, 1800â € "1806 (2012).
Mattox, AK et al. Toepassingen van vloeibare biopsieën voor kanker. Sci. Vert. Med. 11, eaay1984 (2019).
Heitzer, E., Haque, IS, Roberts, CES & Speicher, MR Huidige en toekomstige perspectieven van vloeibare biopsieën in genomica-gedreven oncologie. Nat. Genet. 20, 71â € "88 (2019).
Abbotts, R. & Madhusudan, S. Human AP-endonuclease 1 (APE1): van mechanistische inzichten tot medicijnbare doelwitten bij kanker. Kanker behandelen. Rev. 36, 425â € "435 (2010).
Collins, AR & Gaivão, I. Reparatie van DNA-base-excisie als biomarker in moleculaire epidemiologische studies. Mol. Adder. Med. 28, 307â € "322 (2007).
Zaher, DM et al. Recente ontwikkelingen met iso-enzymen van alkalische fosfatase en hun remmers. Boog. Pharm. 353, e2000011 (2020).
Sachsenhauser, V. & Bardwell, JC Geregisseerde evolutie om de eiwitvouwing in vivo te verbeteren. Curr. Opin. structuur Biol. 48, 117â € "123 (2018).
Dramé-Maigné, A. et al. In vitro zelfselectie van enzymen met behulp van moleculaire programma's. ACS-synth. Biol. https://doi.org/10.1021/acssynbio.3c00385 (2024).
Xue, Q. & Yeung, ES Verschillen in de chemische reactiviteit van individuele moleculen van een enzym. NATUUR 373, 681â € "683 (1995).
Craig, DB et al. Verschillen in de gemiddelde activiteiten van één molecuul van E. coli β-galactosidase: effect van de bron, leeftijd van het enzymmolecuul en inductietemperatuur. J. Eiwit Chem. 22, 555â € "561 (2003).
Tawfik, DS Rommelige biologie en de oorsprong van evolutionaire innovaties. Nat. Chem. Biol. 6, 692â € "696 (2010).
Willensdorfer, M., Bürger, R. & Nowak, MA Fenotypische mutatiesnelheden en de overvloed aan abnormale eiwitten in gist. PLoS-computer. Biol. 3, e203 (2007).
Yamagata, A., Masui, R., Kakuta, Y., Kuramitsu, S. & Fukuyama, K. Overexpressie, zuivering en karakterisering van RecJ-eiwit uit Thermus thermophilus HB8 en zijn kerndomein. Nucleic Acids Res. 29, 4617â € "4624 (2001).
Menezes, R., Dramé-Maigné, A., Taly, V., Rondelez, Y. & Gines, G. Gestroomlijnde digitale bioassays met een 3D-geprinte monsterwisselaar. Analyst 145, 572â € "581 (2019).
Lobato-Dauzier, N. et al. Siliciumkamers voor verbeterde incubatie en beeldvorming van microfluïdische druppels. Lab-chip 23, 2854â € "2865 (2023).
Pekin, D. et al. Kwantitatieve en gevoelige detectie van zeldzame mutaties met behulp van druppeltjesgebaseerde microfluïdica. Lab-chip 11, 2156â € "2166 (2011).
- Door SEO aangedreven content en PR-distributie. Word vandaag nog versterkt.
- PlatoData.Network Verticale generatieve AI. Versterk jezelf. Toegang hier.
- PlatoAiStream. Web3-intelligentie. Kennis versterkt. Toegang hier.
- PlatoESG. carbon, CleanTech, Energie, Milieu, Zonne, Afvalbeheer. Toegang hier.
- Plato Gezondheid. Intelligentie op het gebied van biotech en klinische proeven. Toegang hier.
- Bron: https://www.nature.com/articles/s41565-024-01617-1
