أتاناسوف، أ.ج وآخرون. اكتشاف وإعادة إمداد المنتجات الطبيعية المشتقة من النباتات النشطة دوائيًا: مراجعة. البيوتكنول. حال. 33، 1582 – 1614 (2015).
سوامي، عضو الكنيست وآخرون. التقانة الحيوية لإنتاج الكامبتوثيسين Nothapodytes نيمونيانا, Ophiorrhiza sp. و Camptotheca المؤنف. تطبيق ميكروبيول. التكنولوجيا الحيوية. 105، 9089 – 9102 (2021).
Mohinudeen، IAHK، Pandey، S.، Kanniyappan، H.، Muthuvijayan، V. & Srivastava، S. فحص واختيار الخلايا الداخلية المنتجة للكامبتوثيسين من Nothapodytes نيمونيانا. الخيال العلمي. النائب 11، 11205 (2021).
Almeida، A.، Fernandes، E.، Sarmento، B. & Lúcio، M. نظرة فيزيائية حيوية للتوزيع الحيوي للكامبتوثيسين: نحو فهم جزيئي لقضايا الحرائك الدوائية. صيدلة 13، 869 (2021).
نجوين، T.-AM وآخرون. اكتشاف وتسخير الإنزيمات المؤكسدة للتوليف الكيميائي الأنزيمي وتنويع نظائرها المضادة للسرطان. كومون. تشيم. 4، 1 – 7 (2021).
Shrivastava، V.، Sharma، N.، Shrivastava، V. & Sharma، A. مراجعة للنباتات الطبية المنتجة للكامبتوثيسين: Nothapodytes نيمونيانا. بيوميد. فارماكول. ج. 14، 1799 – 1813 (2021).
Venugopalan، A. & Srivastava، S. Endophytes كما هو الحال في منصات الإنتاج المختبري للأيضات الثانوية النباتية عالية القيمة. البيوتكنول. حال. 33، 873 – 887 (2015).
Narayani، M.، Chadha، A. & Srivastava، S. Cyclotides من النبات الطبي الهندي فيولا أودوراتا (Banafsha): تحديد وتوصيف. ج. نات. همز. 80، 1972 – 1980 (2017).
Kharissova، OV، Kharisov، BI، Oliva González، CM، Méndez، YP & López، I. توليف أكثر خضرة للمركبات والمواد الكيميائية. ر. سوك فتح العلم. 6، 191378 (2019).
Li، S.، Li، Y. & Smolke، CD استراتيجيات التوليف الميكروبي للمواد الكيميائية النباتية عالية القيمة. نات. كيم. 10، 395 – 404 (2018).
محي الدين، IAHK وآخرون. الإنتاج المستدام للكامبتوثيسين من نبات Alternaria sp. معزول عن Nothapodytes نيمونيانا. الخيال العلمي. النائب 11، 1478 (2021).
Ludwig-Müller، J. النباتات والنباتات الداخلية: شركاء متساوون في إنتاج المستقلبات الثانوية؟. البيوتكنول. بادئة رسالة. 37، 1325 – 1334 (2015).
Kusari، S.، Košuth، J.، Čellarová، E. & Spiteller، M. Survival-strategies of endophytic Fusarium solani ضد التخليق الحيوي للكامبتوثيسين الأصلي. ايكول فطري. 4، 219 – 223 (2011).
Bielecka، M.، Pencakowski، B. & Nicoletti، R. استخدام تقنية التسلسل من الجيل التالي لاستكشاف المسارات الوراثية في الفطريات الداخلية في تخليق المستقلبات النشطة بيولوجيًا في النبات. زراعة 12، 187 (2022).
Kusari، S.، Zühlke، S. & Spiteller، M. فطريات داخلية من Camptotheca المؤنف التي تنتج الكامبتوثيسين ونظائرها. ج. نات. همز. 72، 2 – 7 (2009).
شيانغ، P. وآخرون. الفطريات الداخلية المنتجة للكامبتوثيسين Trichoderma atroviride LY357: تحسين ظروف العزل والتحديد والتخمير لإنتاج الكامبتوثيسين. تطبيق ميكروبيول. التكنولوجيا الحيوية. 97، 9365 – 9375 (2013).
ديغامبادا، دينار كويتي، كومارا، باسب، سالم، ن.، أبيسيكيرا، آم & تشاندريكا، يو جي ديابورتي sp F18؛ مصدر جديد للفطريات الداخلية المنتجة للكامبتوثيسين Nothapodytes نيمونيانا تزايد في سري لانكا. نات. همز. الدقة. 0، 1 – 6 (2021).
فنغ، ج. وآخرون. طريقة غير مكلفة لاستخراج الحمض النووي الجينومي من الفطريات الفطرية. علبة. J. بلانت باثول. 32، 396 – 401 (2010).
بابراهام المعلوماتية الحيوية: FastQC أداة لمراقبة الجودة لبيانات التسلسل عالية الإنتاجية. https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/.
Bolger، AM، Lohse، M. & Usadel، B. Trimmomatic: أداة تشذيب مرنة لبيانات تسلسل Illumina. المعلومات الحيوية. أوكسف. الإنجليزية. 30، 2114 – 2120 (2014).
Prjibelski، A.، Antipov، D.، Meleshko، D.، Lapidus، A. & Korobeynikov، A. استخدام مجمع SPAdes de novo. بالعملة. بروتوك. بيوينفورما. 70و e102 (2020).
Gurevich، A.، Saveliev، V.، Vyahhi، N. & Tesler، G. QUAST: أداة تقييم الجودة لتجمعات الجينوم. المعلومات الحيوية. أوكسف. الإنجليزية. 29، 1072 – 1075 (2013).
بوكر، ب. وآخرون. مجموعة تسلسل الجينوم دي نوفو من انضمام أرابيدوبسيس ثاليانا نيديرزينز-1 تعرض تباين الحضور / الغياب والتزامن القوي. بلوس ONE 11و e0164321 (2016).
Dang، H.، Pryor، B.، Peever، T. & Lawrence، C. قاعدة بيانات جينومات البديل: مورد شامل لجنس فطري يتكون من الخلايا الرخوة ومسببات الأمراض النباتية والأنواع المسببة للحساسية. BMC الجينوم 16، 1 – 9 (2015).
مسني، ف. وآخرون. المحددات الوراثية للنمو الداخلي في فطر الأرابيدوبسيس الجذري. نات. COMMUN. 12، 7227 (2021).
زينر، كاليفورنيا وآخرون. تحليل مقارن لمحات سيكوم من الفطريات المترافقة المؤكسدة للمنجنيز (II). بلوس ONE 11و e0157844 (2016).
Brůna، T.، Hoff، KJ، Lomsadze، A.، Stanke، M. & Borodovsky، M. BRAKER2: شرح الجينوم حقيقي النواة التلقائي مع GeneMark-EP+ وAUGUSTUS مدعومًا بقاعدة بيانات البروتين. NAR الجينوم Bioinform. 3, lqaa108 (2021).
Gabriel، L.، Hoff، KJ، Brůna، T.، Borodovsky، M. & Stanke، M. TSEBRA: محدد النص لـ BRAKER. معلومات بي إم سي الحيوية. 22، 566 (2021).
تحديث Manni، M.، Berkeley، MR، Seppey، M.، Simão، FA & Zdobnov، EM BUSCO: سير عمل جديد ومبسط إلى جانب تغطية نشوء أوسع وأعمق لتسجيل الجينومات حقيقية النواة، وبدائية النواة، والفيروسية. مول. بيول. Evol. 38، 4647 – 4654 (2021).
جونز، P. وآخرون. InterProScan 5: تصنيف وظيفة البروتين على نطاق الجينوم. المعلومات الحيوية. أوكسف. الإنجليزية. 30، 1236 – 1240 (2014).
رمش. وآخرون. AntiSMASH 6.0: تحسين قدرات الكشف عن المجموعة ومقارنتها. الأحماض النووية الدقة. 49، W29-W35 (2021).
تشاو، د. وآخرون. مجموعة الجينوم الجديدة لـ Camptotheca acuminata، وهو مصدر طبيعي لمركب الكامبتوثيسين المضاد للسرطان. جيجا ساينس 6، gix065 (2017).
بدلا من ذلك، غا وآخرون. تكشف تحليلات نسخة دي نوفو عن جينات المسار المفترضة المشاركة في التخليق الحيوي وتنظيم الكامبتوثيسين في Nothapodytes nimmoniana (Graham) Mabb. مصنع مول. بيول. 96، 197 – 215 (2018).
راي، أ. وآخرون. تجميع الجينوم على مستوى الكروموسوم أوفيورهيزا بوميلا يكشف عن تطور التخليق الحيوي للكامبتوثيسين. نات. COMMUN. 12، 405 (2021).
كيلنر، ف. وآخرون. التحقيق الموجه بالجينوم في التخليق الحيوي للمنتجات الطبيعية النباتية. نبات J. خلية مول. بيول. 82، 680 – 692 (2015).
إيمز، د. وكيلي، س. OrthoFinder2: تحليل سريع ودقيق لعلم تقويم النشوء والتطور من تسلسل الجينات. (2018). https://doi.org/10.1101/466201
Lallemand، T.، Leduc، M.، Landès، C.، Rizzon، C. & Lerat، E. نظرة عامة على طرق الكشف عن الجينات المكررة: لماذا يجب مراعاة آلية الازدواجية في اختيارهم. الجينات. 11، 1046 (2020).
تانغ، ه. وآخرون. Tanghaibao/jcvi: JCVI v0.7.5. (2017) https://doi.org/10.5281/zenodo.846919
Katoh، K. & Standley، DM MAFFT الإصدار 7 من برنامج محاذاة التسلسل المتعدد: تحسينات في الأداء وسهولة الاستخدام. مول. بيول. Evol. 30، 772 – 780 (2013).
صدري، ر. وآخرون. تنوع المستقلبات في التخليق الحيوي القلوي: طريق سريع متعدد الحارات (دياستريومر) لتخليق الكامبتوثيسين في Camptotheca المؤنف. الخلية النباتية 28، 1926 – 1944 (2016).
Kusari، S.، Hertweck، C. & Spiteller، M. البيئة الكيميائية للفطريات الداخلية: أصول المستقلبات الثانوية. تشيم. بيول. 19، 792 – 798 (2012).
بو، X. وآخرون. القرائن المحتملة للتخليق الحيوي للكامبتوثيسين من المستقلبات في النباتات المنتجة للكامبتوثيسين. Fitoterapia 134، 113 – 128 (2019).
يانغ، م. وآخرون. مسار التخليق الحيوي للكامبتوثيسين المتباين أوفيورهيزا بوميلا. بي إم سي بيول. 19، 1 – 16 (2021).
Ding، X.، Liu، K.، Zhang، Y. & Liu، FD novo Transcriptome Assembly وتوصيف Xylaria sp المنتجة لـ 10-hydroxycamptothecin. M71 بعد علاج حمض الساليسيليك. J. ميكروبيول. 55، 871 – 876 (2017).
Sirikantaramas، S.، Yamazaki، M. & Saito، K. Mutations in topoisomeramas I كآلية مقاومة ذاتية تضافرت مع إنتاج قلويد كامبتوثيسين المضاد للسرطان في النباتات. بروك. NATL. أكاد. الخيال العلمي. 105، 6782 – 6786 (2008).
ستيكر، بي إل وآخرون. هياكل ثلاث فئات من العوامل المضادة للسرطان المرتبطة بالمركب التساهمي توبويزوميراز I-DNA البشري. ميد. علم. 48، 2336 – 2345 (2005).
Fujimori، A.، Harker، WG، Kohlhagen، G.، Hoki، Y. & Pommier، Y. Mutation at the catalytic site of topoisomerase I in CEM / C2، وهو خط خلايا سرطان الدم البشري المقاوم للكامبتوثيسين. مرض السرطان 55، 1339 – 1346 (1995).
كوليمار، جيه. وليبرون، إم.-إتش. المستقلبات الثانوية الفطرية: السموم القديمة والمؤثرات الجديدة في التفاعلات بين النبات والميكروبات. في المؤثرات في التفاعلات بين النبات والميكروبات 377-400 (جون وايلي وأولاده، المحدودة، 2011). https://doi.org/10.1002/9781119949138.ch15.
مانجوناثا، ب.ل وآخرون. تحليل النسخ للخشب الجذعي لـ Nothapodytes nimmoniana (Graham) Mabb. يحدد الجينات المرتبطة بالتخليق الحيوي للكامبتوثيسين، وهو جزيء مضاد للسرطان. جيه بيوسشي. 41، 119 – 131 (2016).
Heinig، U.، Scholz، S. & Jennewein، S. الوصول إلى الجزء السفلي من التخليق الحيوي للتاكسول بواسطة الفطريات. الغواصين الفطريين. 60، 161 – 170 (2013).
يانغ ، واي. وآخرون. تسلسل الجينوم وتحليل الفطريات الداخلية المنتجة للباكليتاكسيل البنسليوم أورانتيوجريسيوم نر رل 62431. BMC الجينوم 15، 69 (2014).
شو، Z. وآخرون. تؤدي ازدواجية الجينات الترادفية إلى تطور متباين لمسارات التخليق الحيوي للكافيين والكروسين في النباتات. بي إم سي بيول. 18، 63 (2020).
شويتا، س. وآخرون. تثبيط الفطريات الداخلية بواسطة الكامبتوثيسين الذي ينتجه النبات المضيف لها. Nothapodytes نيمونيانا (جرام) ماب. (إيكاسيناسيا). العملة. الخيال العلمي. 107، 994 – 1000 (2014).
- محتوى مدعوم من تحسين محركات البحث وتوزيع العلاقات العامة. تضخيم اليوم.
- PlatoData.Network Vertical Generative Ai. تمكين نفسك. الوصول هنا.
- أفلاطونايستريم. ذكاء Web3. تضخيم المعرفة. الوصول هنا.
- أفلاطون السيارات / المركبات الكهربائية ، كربون، كلينتك ، الطاقة، بيئة، شمسي، إدارة المخلفات. الوصول هنا.
- أفلاطون هيلث. التكنولوجيا الحيوية وذكاء التجارب السريرية. الوصول هنا.
- تشارت بريم. ارفع مستوى لعبة التداول الخاصة بك مع ChartPrime. الوصول هنا.
- BlockOffsets. تحديث ملكية الأوفست البيئية. الوصول هنا.
- المصدر https://www.nature.com/articles/s41598-023-41738-6
