Zephyrnet Logosu

Biyoteknolojik uygulamalar için Pleurotus pulmonarius'ta gen ekspresyonunun RT-qPCR analizi için referans genlerin geliştirilmesi – Bilimsel Raporlar

Tarih:

  • Giva, A. ve ark. Mikroalg ve Jatropha'dan entegre bir biyorafinerinin sürdürülebilirliğinin tekno-ekonomik değerlendirmesi: Bir inceleme ve vaka çalışması. Yenile. Sürdürmek. Enerji Rev. 88, 239 – 257 (2018).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Piloto-Rodriguez, R. ve ark. kullanımına yönelik bir yaklaşım jatrofa Curcas Tarımsal sanayide enerji kaynağı olarak yan ürünler. Enerji. Kaynak. Bölüm A 2020, 1 – 21 (2020).

    makale  Google Scholar 

  • Gomes, TG ve ark. Forbol ester biyolojik parçalanması jatrofa Curcas kek ve enzim için bir substrat olarak potansiyel ve Pleurotus pulmonerius yenilebilir mantar üretimi. Biyokatal. Tarım. Biyoteknoloji. 45, 102498 (2022).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Makkar, H., Becker, K., Sporer, F. & Wink, M. Farklı kökenlerden gelen besleyici potansiyel ve toksik bileşenler üzerine çalışmalar jatropha curcas. J. Agric. Gıda Kimyası 45, 3152 – 3157 (1997).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Makkar, HP ve Becker, K. jatropha curcasbiyodizel ve katma değerli yan ürünlerin üretimi için umut verici bir ürün. Avro. J. Lipid Sci. Teknoloji. 111, 773 – 787 (2009).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Devappa, RK, Makkar, HP & Becker, K. Jatropha toksisitesi - bir inceleme. Kısım B Krit. Rev. J. Toxicol. 13, 476 – 507 (2010).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Tholl, D. Terpen sentezleri ve terpen metabolizmasının düzenlenmesi, çeşitliliği ve biyolojik rolleri. Kör. Görüş. Bitki Biol. 9, 297 – 304 (2006).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Jia, Q. ve ark. Mikrobiyal tipte terpen sentaz genleri tohumsuz kara bitkilerinde yaygın olarak bulunur, ancak tohumlu bitkilerde görülmez. Proc. Natl. Acad. Sci. 113, 12328 – 12333 (2016).

    makale  ADS  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • Maurya, R., Ravi, M., Singh, S. & Yadav, PP Cassane ve norcassane diterpenler ve bunların farmakolojik çalışmaları üzerine bir inceleme. Fitoterapi 83, 272 – 280 (2012).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Zerbe, P. ve ark. Tıbbi açıdan aktif diterpenoidlerin biyosentetik sisteminin diterpen sentezleri Marrubium vulgare. Bitki J. 79, 914 – 927 (2014).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Vilanova, C., Marin, M., Baixeras, J., Latorre, A. ve Porcar, M. Çam ağacı reçinesinden mikrobiyal türlerin seçilmesi: Terpen dünyasından biyoteknolojik uygulamalar. PLoS ONE 9, e100740 (2014).

    makale  ADS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • Gomes, TG ve ark. Detoksifikasyon için mevcut stratejiler jatropha curcas tohum keki: Bir inceleme. J. Agric. Gıda Kimyası 66, 2510 – 2522 (2018).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Wang, S. ve ark. Birinci yıkama ve ikinci yıkamanın verimi, besin değeri, umami bileşenleri ve mineral içerikleri Pleurotus pulmonerius üç orman atığında yetişen mantarlar. Gıda Kimyası 397, 133714 (2022).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Mahari, WAW ve ark. İstiridye mantarının değerlendirilmesi ve mantar yetiştirme endüstrisinde üretilen atıkların değerlendirilmesi üzerine bir inceleme. J. Tehard. Mater. 400, 123156 (2020).

    makale  Google Scholar 

  • Kaewlaoyoong, A. ve ark. Beyaz çürüklük mantarı Pleurotus pulmonerius Yüksek oranda PCDD/F ile kirlenmiş tarla toprağının katı hal fermantasyonu yoluyla gelişmiş biyolojik ıslahı. Sci. Toplam Çevre 738, 139670 (2020).

    makale  ADS  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Vidal-Diez-de-Ulzurrun, G., Lee, Y.-Y., Stajich, JE, Schwarz, EM & Hsueh, Y.-P. İki İtalyan istiridye mantarının genomik analizi Pleurotus pulmonerius suşlar. G3 11, jkaa007 (2021).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Yunan, NAM, Shin, TY & Sabaratnam, V. Gri istiridye mantarının kullanılmış mantar substratının ileri dönüştürülmesi Pleurotus pulmonerius hurma yağı değirmeni atık su hidrolizi için lignoselülolitik enzimlerin kaynağı olarak. J. Mikrobiyol. Biyoteknoloji. 6, 823 – 832 (2021).

    makale  Google Scholar 

  • Chen, F., Xiong, S., Sundelin, J., Martín, C. & Hultberg, M. Gıda ve biyoyakıtın kombine üretimi potansiyeli: Pleurotus pulmonerius yumuşak ve sert ağaç talaşlarında. J. Temiz. Ürün 266, 122011 (2020).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Castanera, R., López-Varas, L., Pisabarro, AG & Ramírez, L. Transkripsiyonel analizler için referans genlerin doğrulanması Pleurotus ostreatus ters transkripsiyon kantitatif PCR kullanılarak. Uygulama Çevre. Mikrobiyol. 81, 4120 – 4129 (2015).

    makale  ADS  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • Devonshire, AS ve ark. Yeni nesil qPCR ve sıralama platformlarının mRNA biyobelirteç analizine uygulanması. Yöntemler 59, 89 – 100 (2013).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Galiveti, CR, Rozhdestvensky, TS, Brosius, J., Lehrach, H. ve Konthur, Z. Gerçek zamanlı PCR ile insan transkriptomunun kantitatif ekspresyon analizi için temizlik npcRNA'larının uygulanması. RNA 16, 450 – 461 (2010).

    makale  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • VanGuilder, HD, Vrana, KE & Freeman, WM Gen ekspresyonu analizi için yirmi beş yıllık kantitatif PCR. Biyoteknikler 44, 619 – 626 (2008).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Albuquerque, GM ve ark. Uyumlu ve uyumsuz olan RT-qPCR analizleri için referans genlerin stabilite analizi Ralstonia solanacearum-domates 'Hawaii 7996' etkileşimleri. Sci. Cum. 11, 18719 (2021).

    makale  ADS  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • Rego, ECS ve ark. Gen ifadesinin RT-qPCR analizi için kararlı referans genleri Musa acuminata-Pseudocercospora musae etkileşim. Sci. Cum. 9, 1 – 11 (2019).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Bustin, SA ve ark. MIQE yönergeleri: Kantitatif gerçek zamanlı PCR deneylerinin yayınlanması için minimum bilgi. Klinik. Kimya 55, 611 – 622 (2009).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Bustin, S., Benes, V., Nolan, T. & Pfaffl, M. Kantitatif gerçek zamanlı RT-PCR — bir perspektif. J. Mol. Endokrinol. 34, 597 – 601 (2005).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Gutierrez, L. ve ark. Referans genlerin sistematik olarak doğrulanmaması: Bitkilerde ters transkripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) analizinde yeterince değer verilmeyen ciddi bir tuzak. Bitki Biyoteknolojisi. J. 6, 609 – 618 (2008).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Vandesompele, J. ve ark. Çoklu dahili kontrol genlerinin geometrik ortalaması alınarak gerçek zamanlı kantitatif RT-PCR verilerinin doğru normalleştirilmesi. Genom Biol. 3, 1 – 12 (2002).

    makale  Google Scholar 

  • Andersen, CL, Jensen, JL & Ørntoft, TF Gerçek zamanlı kantitatif ters transkripsiyon-PCR verilerinin normalleştirilmesi: Mesane ve kolon kanseri veri setlerine uygulanan, normalizasyona uygun genleri tanımlamaya yönelik model bazlı bir varyans tahmin yaklaşımı. Kanser Res. 64, 5245 – 5250 (2004).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Wang, S. ve ark. Kantitatif gerçek zamanlı PCR verilerinin normalleştirilmesi için ölüm sonrası insan beynindeki endojen referans genlerin stabilitesi: geNorm, NormFinder ve BestKeeper kullanılarak kapsamlı değerlendirme. Int. J. Hukuk Med. 126, 943 – 952 (2012).

    makale  ADS  PubMed  Google Scholar 

  • Yakup, F. ve ark. İnsan normal ve kanser hücre hatlarında RT-qPCR'nin güvenilir performansı için referans genlerin dikkatli seçimi gereklidir. PLoS ONE 8, e59180 (2013).

    makale  ADS  CAS  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • De Spiegelaere, W. ve ark. RT-qPCR için referans gen doğrulaması, mevcut farklı yazılım paketleri hakkında bir not. PLoS ONE 10, e0122515 (2015).

    makale  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • Zheng, S., Shan, L., Zhuang, Y. ve Shang, Y. Kalitatif ve gerçek zamanlı kantitatif PCR tespitinde endojen referans gen olarak kullanılan pyrG'nin tanımlanması Pleurotus ostreatus. J. Gıda Bilimi 83, 750 – 755 (2018).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Hou, Z. ve ark. Gerçek zamanlı kantitatif PCR için referans genlerin seçimi Pleurotus ostreatus ısı stresi altında. Acta Edulis Fung. 26, 11 – 18 (2019).

    Google Scholar 

  • Garrido-Bazan, V. ve ark. Tekstil boyalarının lakkaz genlerinin aktivitesi ve diferansiyel düzenlenmesi üzerine etkisi Pleurotus ostreatus batık fermantasyonda yetiştirilir. AMB Ekspres 6, 1 – 9 (2016).

    makale  Google Scholar 

  • Wei, Y. ve ark. Kalitatif ve gerçek zamanlı kantitatif PCR tespitinde endojen referans gen olarak kullanılan s9ap'ın tanımlanması Pleurotus eryngii. Mol. Biyol. Temsilci 50, 621 – 629 (2023).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Sun, X., Wu, J., Mo, C. & Ma, A. Kaplan sütü mantarının farklı streslerinde ve dokularında RT-qPCR normalizasyonu için endojen referans genlerin seçimi ve doğrulanması, Pleurotus yumru-regium. Mikozbilim 62, 281 – 288 (2021).

    makale  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • Guranowski, A. & Paszewski, A. 5′-metiltiyoadenozinin Metabolizması Aspergillus nidulanları nükleosid metiltiyo grubunun kullanımı yoluyla metiyonin sentezi için alternatif bir yol. Acta Gen. Subj. 717, 289 – 294 (1982).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Negrutskii, B. ve El-Skaya, A. Ökaryotik çeviri uzatma faktörü 1α: Aminoasil-tRNA kanallanmasında yapı, ifade, işlevler ve olası rol. Prog. Nükleik Asit Res. Mol. Biyol. 60, 47 – 78 (1998).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Luo, Y., Li, W.-M. & Wang, W. Trehalose: Isı stresi altında antioksidan enzimlerin koruyucusu mu yoksa reaktif oksijen türleri temizleyicisi mi? Çevre. Tecrübe. Bot. 63, 378 – 384 (2008).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Pfaffl, MW, Tichopad, A., Prgomet, C. & Neuvians, TP Kararlı temizlik genlerinin, diferansiyel olarak düzenlenmiş hedef genlerin ve örnek bütünlüğünün belirlenmesi: Çift yönlü korelasyonlar kullanan BestKeeper–Excel tabanlı araç. Çevre. Tecrübe. Bot. 26, 509 – 515 (2004).

    CAS  Google Scholar 

  • Hibbeler, S., Scharsack, JP & Becker, S. Üç dikenli dikenli balıkta niceliksel ifade çalışmaları için temizlik genleri Gasterosteus aculeatus. BMC Mol. Biyol. 9, 1 – 10 (2008).

    makale  Google Scholar 

  • Hoang, MTV ve ark. İnvaziv mantar enfeksiyonlarının etkenlerinin moleküler tanımlanması için ikili DNA barkodlaması. Ön. Microbiol. 10, 1647 (2019).

    makale  PubMed  PubMed Central  Google Scholar 

  • O, X.-L. ve ark. Pleurotus'ta ribozomal ve protein kodlayan genlerin izolat içi ve izolatlar arası varyasyonu: Mantar grupları üzerindeki moleküler tanımlama ve filogeninin etkileri. BMC Mikrobiyol. 17, 1 – 9 (2017).

    makale  Google Scholar 

  • O, X.-L. ve ark. Çin'deki iki popüler yenilebilir Pleurotus'un filogenetik ilişkisi, Bailinggu (P. eryngii var. tuoliensis) ve Xingbaogu (P. eryngii), ITS, RPB2 ve EF1α dizileri tarafından belirlenir. Mol. Biyol. Temsilci 43, 573 – 582 (2016).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • de Oliveira, Los Angeles ve ark. Okaliptüs türlerinde gen ifadesinin normalleştirilmesi için referans genler. Bitki Hücresi Fizyol. 53, 405 – 422 (2012).

    makale  PubMed  Google Scholar 

  • Boddy, L. & Heilmann-Clausen, J. Bölüm 12 Ilıman kapalı tohumlu ağaçta Basidiomycete topluluğunun gelişimi. İçinde İngiliz Mikoloji Derneği Sempozyum Serisi (ed. Boddy, L.) 211–237 (Elsevier, 2008).

  • Velázquez-Cedeño, MA, Mata, G. ve Savoie, J.-M. Atık azaltıcı ekim Pleurotus ostreatus ve Pleurotus pulmonerius kahve posası üzerinde: Bazı lignoselülolitik enzimlerin üretimindeki değişiklikler. Dünya J. Mikrobiyol. Biyoteknoloji. 18, 201 – 207 (2002).

    makale  Google Scholar 

  • Janusz, G., Kucharzyk, KH, Pawlik, A., Staszczak, M. & Paszczynski, AJ Fungal lakkaz, manganez peroksidaz ve lignin peroksidaz: Gen ekspresyonu ve regülasyonu. Enzim Mikrobu. Teknoloji. 52, 1 – 12 (2013).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Akinfemi, A., Adu, O. & Doherty, F. Sorgum sobasının beyaz çürükçül mantarlarla hayvan yemine dönüştürülmesi: Pleurotus ostreatus ve Pleurotus pulmonerius. J. Biyoteknoloji. 9, 875 (2010).

    Google Scholar 

  • Wirasnita, R. ve Hadibarata, T. Beyaz çürüklük mantarının potansiyeli Pleurotus pulmonerius Florantenin bozulması ve dönüşümü için F043. pedosfer 26, 49 – 54 (2016).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Fernández-Fueyo, E. ve ark. İstiridye mantarı genomundaki ligninolitik peroksidaz genleri: Heterolog ekspresyon, moleküler yapı, katalitik ve stabilite özellikleri ve lignini parçalama yeteneği. Biotechnol. Biyoyakıtlar 7, 1 – 23 (2014).

    makale  Google Scholar 

  • Yamaguchi, M., Nakamura, M., Takano, M. & Sekiya, A. Beyaz çürüklük mantarının misel kütlesinin miktarının belirlenmesi Pleurotus pulmonerius gerçek zamanlı PCR ile. Boğa FFPRI 8, 133 – 141 (2009).

    CAS  Google Scholar 

  • Phengnuam, T. & Suntornsuk, W. Detoksifikasyon ve anti-besinlerin azaltılması jatropha curcas tohum keki basil Fermantasyon. J. Biosci. Biyomüh. 115, 168 – 172 (2013).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Nakao, M., Hasegawa, G., Yasuhara, T. & Ishihara, Y. Degradation of jatropha curcas Jatropha yağı kekinden türetilen forbol esterleri ve bunların tümör teşvik edici aktiviteleri. Ekotoksikol. Çevre. Saf. 114, 357 – 364 (2015).

    makale  CAS  PubMed  Google Scholar 

  • Castellani, O., Ribeiro, L. & Fernandes, J. Farklılaşması tripanosoma cruzi kültürde. J. Protozool. Res. 14, 447 – 451 (1967).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • Makkar, H., Aderibigbe, A. ve Becker, K. Jatropha curcas'ın toksik olmayan ve toksik çeşitlerinin kimyasal bileşim, sindirilebilirlik, protein parçalanabilirliği ve toksik faktörler açısından karşılaştırmalı değerlendirilmesi. Gıda Kimyası 62, 207 – 215 (1998).

    makale  CAS  Google Scholar 

  • spot_img

    En Son İstihbarat

    spot_img