[Ingediend op 5 mei 2020]
Abstract: COVID-19 heeft een wereldwijde pandemie veroorzaakt met een hoge morbiditeit en mortaliteit
2020. Nieuw coronavirus (nCoV), ook bekend als ernstig acuut ademhalingssyndroom
Coronavirus 2 (SARS-CoV2) is verantwoordelijk voor deze dodelijke ziekte.
Internationaal Comité voor Taxonomie van Virussen (ICTV) heeft verklaard dat nCoV is
zeer genetisch vergelijkbaar met de SARS-CoV-epidemie in 2003 (89% overeenkomst).
Er is een beperkt aantal klinisch gevalideerde gegevens over interactie tussen mens en nCoV-eiwit
beschikbaar in de literatuur. Met deze hypothese richt het huidige werk zich op
het ontwikkelen van een computermodel voor het nCoV-menselijke eiwitinteractienetwerk,
met behulp van de experimenteel gevalideerde SARS-CoV-menselijke eiwitinteracties.
In eerste instantie worden humane spreider-eiwitten van niveau 1 en niveau 2 geïdentificeerd in
SARS-CoV-Human interactienetwerk, gebruikmakend van Susceptible-Infected-Susceptible
(SIS) model. Deze eiwitten worden beschouwd als potentiële menselijke doelwitten voor nCoV
lokaas-eiwitten. Er is gebruik gemaakt van een op genontologie gebaseerde fuzzy affiniteitsfunctie
construeer het nCoV-humane eiwit-interactienetwerk met een specificiteit van 99.98%
drempel. Dit identificeert ook de menselijke spreiders van niveau 1 voor COVID-19 in
menselijk eiwit-interactienetwerk. Menselijke strooiers van niveau 2 zijn daarna
geïdentificeerd met behulp van het SIS-model. Het afgeleide gastheer-pathogeen interactienetwerk
wordt uiteindelijk gevalideerd met 7 potentiële door de FDA vermelde geneesmiddelen voor COVID-19 met
significante overlapping tussen de bekende doeleiwitten van het geneesmiddel en de geïdentificeerde
spreader eiwitten.
Inzendingsgeschiedenis
Van: Subhadip Basu [e-mail bekijken]
[V1]
Di 5 mei 2020 04:16:21 UTC (1,346 KB)
