ジャーナルに掲載された新しい研究 自然 は、これまでに実施された古代のうんちの最も広範なゲノム分析について報告しています。 この研究は、古代の腸内細菌組成の手がかりを明らかにし、現代の微生物叢ではこれまで見られなかった微生物種を検出します。
この研究は、米国南西部とメキシコの乾燥した洞窟で見つかった1,000つの認証された人間の糞便サンプルに焦点を当てました。 放射性炭素年代測定は、サンプルが2,000、XNUMX年からXNUMX、XNUMX年前のものであることを示しました。
研究の一環として約500の微生物ゲノムが再構築され、研究者たちは約180が古代のヒトマイクロバイオームと強く関連している可能性があると確信しています。 驚くべきことに、これらの微生物ゲノムの39％はこれまで知られておらず、現代のヒトマイクロバイオームでは検出されていません。
この研究の上級著者であるAleksandarKosticは、古代の腸内微生物叢における信じられないほどの微生物の多様性は、食事の違いによるものかもしれないと言います。 工業化された農業は作物の多様性の欠如をもたらしました。つまり、腸内細菌は以前ほど多様である必要はありません。
「古代の文化では、あなたが食べている食べ物は非常に多様であり、より折衷的な微生物のコレクションをサポートすることができます」とコスティックは言います。 「しかし、工業化や食料品店での食事に移行すると、より多様なマイクロバイオームをサポートするのに役立つ多くの栄養素が失われます。」
これらの発見を現代の微生物叢と比較するために、研究者たちは今日、人間から数百の糞便サンプルを集めました。 現代のサンプルの半分は、西洋型の食事を食べている米国またはヨーロッパのサンプルからのものであり、残りの半分は、タンザニア、ペルー、メキシコなどのより孤立した先住民コミュニティから収集されました。
興味深い発見のXNUMXつは、 トレポネーマsuccinifaciens しかし、すべての古代のサンプルでは、現代の西洋の微生物叢には見られませんでした。 これまでの研究 は、孤立した先住民コミュニティのマイクロバイオームでこの細菌を検出し、現代の産業用ヒト腸内マイクロバイオームがより伝統的な州から分岐した兆候であると仮定されています。
別の興味深い発見は、古代の微生物叢がトランスポザーゼと呼ばれる大量の酵素を示したことでした。これは本質的に動的な環境条件への遺伝的適応性を助けます。
「これは、微生物が、同じものを食べ、ほぼ一年中同じ生活を送る現代の工業化された微生物叢よりもはるかに変化する環境に適応するために使用する戦略である可能性があると考えています」とKosticは説明します。 「対照的に、変化が見られる環境では、微生物はこのはるかに多くのトランスポザーゼのコレクションを使用して、さまざまな環境に適応するのに役立つ遺伝子を取得して収集する可能性があります。」
そして、全体的な微生物の多様性は古代の微生物叢のサンプルでより高かったが、古いうんちには目立って存在しない微生物がいくつかあるように見えた。 アッカーマンシア・ムシニフィラたとえば、すべての古代のサンプルには存在せず、西洋以外の現代のサンプルではめったに検出されませんでした。 以前の研究 の増加したボリュームを発見しました アッカーマンシア・ムシニフィラ 加工肉や砂糖を多く含む食事をしている人に。 この微生物は、炎症に関連するエンドトキシンを生成することが知られています。
この研究に取り組んでいるモンタナ大学の人類学者であるメラデス・スノーは、この種の研究は現代の西洋社会の人々に影響を与える病気への重要な洞察を提供すると言います。
「それは共生関係です」とスノーは言います。 「しかし、今日、地球上のどこでも人々を研究するとき、彼らの腸内微生物叢は、食事、化学物質、抗生物質、または他の多くのもののいずれかを通じて、現代の世界から影響を受けていることがわかります。 したがって、工業化が起こる前に腸内細菌叢がどのように見えたかを理解することは、今日の腸の違いを理解するのに役立ちます。」
プロジェクトに取り組んでいる何人かの研究者にとっての次のステップは、これらの古代の細菌種のいくつかについて可能な代謝機能が何であったかを調査することです。 コスティックは、これらの新しく再構築された古代のゲノムを使用して、これらの絶滅した種のいくつかを復活させ、それらが古代の人間にどのように影響していたかを解明することが可能であると推測しています。
「ラボでそれらを育てることができれば、これらの微生物の生理機能をはるかによく理解することができます」とKostic氏は言います。
新しい研究がジャーナルに掲載されました 自然.
ソース： ハーバード·メディカル·スクール, モンタナ大学
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出典：https：//newatlas.com/science/ancient-gut-bacteria-discovers-unknown-species/
