Mitchell, RS et αϊ. Το Vpu ανταγωνίζεται τον περιορισμό της απελευθέρωσης HIV-2 με τη μεσολάβηση BST-1 μέσω βήτα-TrCP και ενδολυσοσωμικής διακίνησης. PLOS Pathog. 5, e1000450 (2009).
Roy, Ν., Pacini, G., Berlioz-Torrent, C. & Janvier, Κ. Μηχανισμοί υποκείμενοι του HIV-1 Vpu-mediated virus egress. Εμπρός. Μικροβιολί. 5, 177 (2014).
Strebel, Κ., Klimkait, T. & Martin, MA Ένα νέο γονίδιο του HIV-1, vpu, και του προϊόντος 16-kilodalton. Επιστήμη 241, 1221-1223 (1988).
Gonzalez, ME Vpu πρωτεΐνη: Η βιροπορίνη που κωδικοποιείται από τον HIV-1. Ιοί 7, 4352-4368 (2015).
Khan, N. & Geiger, JD Ρόλος της ιικής πρωτεΐνης U (Vpu) στη μόλυνση και παθογένεση HIV-1. Ιοί 13, 1466 (2021).
Dube, M., Bego, MG, Paquay, C. & Cohen, EA Modulation of HIV-1-host interaction: Role of the Vpu accessory protein. Ρετροϊολογία 7, 114 (2010).
Cohen, EA, Terwilliger, EF, Sodroski, JG & Haseltine, WA Ταυτοποίηση πρωτεΐνης που κωδικοποιείται από το γονίδιο vpu του HIV-1. Φύση 334, 532-534 (1988).
Strebel, Κ., Klimkait, Τ., Maldarelli, F. & Martin, ΜΑ Μοριακές και βιοχημικές αναλύσεις της πρωτεΐνης vpu του ιού της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας τύπου 1. J.Virol. 63, 3784-3791 (1989).
Ramirez, PW et αϊ. Περιοριστικοί παράγοντες που σχετίζονται με την πλασματική μεμβράνη και η αντιδρασή τους από τις βοηθητικές πρωτεΐνες HIV-1. Κύτταρα 8, 1020 (2019).
Hussain, A., Das, SR, Tanwar, C. & Jameel, S. Ολιγομερισμός της πρωτεΐνης Vpu του ιού της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας τύπου 1 (HIV-1) – μια γενετική, βιοχημική και βιοφυσική ανάλυση. Βιρόλ. Ι. 4, 81 (2007).
Λάνγκερ, Σ. et αϊ. Ο HIV-1 Vpu είναι ένας ισχυρός μεταγραφικός καταστολέας των αντιιικών ανοσοαποκρίσεων που προκαλούνται από το NF-kappaB. Ελιφέ https://doi.org/10.7554/eLife.41930 (2019).
Μακ. et αϊ. Έκφραση, καθαρισμός και δραστηριότητες πλήρους μήκους και περικομμένες εκδόσεις της ενσωματωμένης μεμβρανικής πρωτεΐνης Vpu από τον HIV-1. Protein Sci. 11, 546-557 (2002).
Maldarelli, F., Chen, MY, Willey, RL & Strebel, Κ. Η πρωτεΐνη Vpu του ιού ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας τύπου 1 είναι μια ολιγομερής τύπου Ι ενσωματωμένη πρωτεΐνη μεμβράνης. J.Virol. 67, 5056-5061 (1993).
Neil, SJ, Sandrin, V., Sundquist, WI & Bieniasz, PD Ένας μηχανισμός πρόσδεσης που προκαλείται από ιντερφερόνη άλφα αναστέλλει την απελευθέρωση σωματιδίων του ιού HIV-1 και του ιού Έμπολα, αλλά εξουδετερώνεται από την πρωτεΐνη HIV-1 Vpu. Μικρόβιο Host Host 2, 193-203 (2007).
Neil, SJ, Zang, T. & Bieniasz, PD Tetherin αναστέλλει την απελευθέρωση ρετροϊού και ανταγωνίζεται με τον HIV-1 Vpu. Φύση 451, 425-430 (2008).
Majeed, S. et αϊ. Πληροφορίες για την ολιγομερική δομή της πρωτεΐνης HIV-1 Vpu. J. Struct. Βιολ. 215, 107943 (2023).
Hsu, YT, Wolter, KG & Youle, RJ Ανακατανομή κυτοσόλης σε μεμβράνη του Bax και του Bcl-X(L) κατά την απόπτωση. Proc. Natl. Acad. Sci. ΗΠΑ 94, 3668-3672 (1997).
Lesieur, C., Vecsey-Semjen, B., Abrami, L., Fivaz, M. & Gisou van der Goot, F. Membrane insertation: The strategies of toxins (ανασκόπηση). ΜοΙ. Μέλος. Biol. 14, 45-64 (1997).
Scheres, SH RELION: Εφαρμογή μιας Bayesian προσέγγισης για τον προσδιορισμό της δομής κρυο-ΕΜ. J. Struct. Βιολ. 180, 519-530 (2012).
Τανγκ, Γ. et αϊ. EMAN2: Μια επεκτάσιμη σουίτα επεξεργασίας εικόνας για ηλεκτρονική μικροσκοπία. J. Struct. Βιολ. 157, 38-46 (2007).
Bell, JM, Chen, M., Baldwin, PR & Ludtke, SJ Βελτιστοποίηση μεμονωμένων σωματιδίων υψηλής ανάλυσης στο EMAN2.1. Μέθοδοι 100, 25-34 (2016).
Bell, JM, Chen, M., Durmaz, T., Fluty, AC & Ludtke, SJ Νέα εργαλεία λογισμικού στο EMAN2 εμπνευσμένα από την πρόκληση χάρτη EMDatabank. J. Struct. Βιολ. 204, 283-290 (2018).
Χέντερσον, Ρ. et αϊ. Αποτέλεσμα της πρώτης συνάντησης της ομάδας εργασίας επικύρωσης ηλεκτρονικής μικροσκοπίας. Structure 20, 205-214 (2012).
Ludtke, SJ Μονοσωματιδιακή διύλιση και ανάλυση μεταβλητότητας στο EMAN2.1. Μέθοδοι Enzymol. 579, 159-89 (2016).
Chen, M. & Ludtke, SJ Μικτό μοντέλο Gaussian μείγματος με βάση τη βαθιά μάθηση για τον χαρακτηρισμό της μεταβλητότητας στο Cryo-EM. Nat. Μέθοδοι 18, 930-936 (2021).
Borbat, PP & Freed, JH Παλμός διπολικός συντονισμός σπιν ηλεκτρονίων: Μετρήσεις απόστασης. Struct. Inf. Spin-Labels Intrinsic Paramagn. Σεντ. Biosci. 152, 1-82 (2014).
Jeschke, G. μετρήσεις απόστασης ελαφιού σε πρωτεΐνες. Ανου. Αναθ. Phys. Chem. 63, 419-446 (2012).
Milov, AD, Ponomarev, AB & Tsvetkov, YD Κτύποι διαμόρφωσης σήματος διπλού συντονισμού ηλεκτρονίου-ηλεκτρονίου σε spin echo για διριζικά συστήματα. J. Struc. Chem. 25, 710-713 (1984).
Borbat, PP, Georgieva, ER & Freed, JH Βελτιωμένη ευαισθησία για μετρήσεις μεγάλων αποστάσεων σε βιομόρια: Διπλός συντονισμός ηλεκτρονίου-ηλεκτρονίου πέντε παλμών. J. Φυσ. Chem. Κάτοικος της Λατβίας. 4, 170-175 (2013).
Borbat, PP, Crepeau, RH & Freed, JH Multifrequency δισδιάστατος μετασχηματισμός Fourier ESR: Ένα φασματόμετρο ζώνης X/Ku. J. Magn. Ρον. 127, 155-167 (1997).
Jeschke, G. & Polyhach, Y. Μετρήσεις απόστασης σε σημασμένα με σπιν βιομακρομόρια με παλμικό παραμαγνητικό συντονισμό ηλεκτρονίων. Φυσ. Chem. Chem. Φυσ. 9, 1895-1910 (2007).
Gamliel, D. & Freed, JH Theory of 2-dimensional ESR with πυρηνική διαμόρφωση. J. Magn. Ρον. 89, 60-93 (1990).
Borbat, PP & Freed, JH Pulse διπολικό ESR: Μετρήσεις απόστασης. Σε Δομή και Συγκόλληση Τομ. 152 (επιμ. Timmel, CR & Harmer, JR) 1–82 (Springer Heidelberg, 2014).
Tang, SG et αϊ. Δομική βάση για ενεργοποίηση, συναρμολόγηση και δέσμευση μεμβράνης νημάτων ESCRT-III Snf7. Ελιφέ https://doi.org/10.7554/eLife.12548 (2015).
Borbat, PP & Freed, JH Μέτρηση αποστάσεων με παλμική διπολική φασματοσκοπία ESR: Επισημασμένες με σπιν κινάσες ιστιδίνης. Μέθοδοι Enzymol. 423, 52-116 (2007).
Jeschke, G. μετρήσεις απόστασης ελαφιού σε πρωτεΐνες. Αννα. Αναθ. Phys. Chem. 63, 419-446 (2012).
Cabra, V. & Samso, M. Do's and don'ts της κρυοηλεκτρονικής μικροσκοπίας: Ένας εκκινητής για την προετοιμασία του δείγματος και τη συλλογή δεδομένων υψηλής ποιότητας για μακρομοριακή 3D ανακατασκευή. J. Vis. Λήξη https://doi.org/10.3791/52311 (2015).
Cooper, RS, Georgieva, ER, Borbat, PP, Freed, JH & Heldwein, EE Δομική βάση για αγκύρωση μεμβράνης και ρύθμιση σύντηξης του συντηκτογόνου του ιού του απλού έρπητα gB. Nat. Struct. ΜοΙ. Biol. 25, 416-424 (2018).
Οι Georgieva, ER, Xiao, S., Borbat, PP, Freed, JH & Eliezer, D. Tau συνδέονται με τις επιφάνειες της λιπιδικής μεμβράνης μέσω κοντών αμφιπαθικών ελίκων που βρίσκονται στις επαναλήψεις της που συνδέονται με μικροσωληνίσκους. Biophys. J. 107, 1441-1452 (2014).
Georgieva, ER Μιμητικές μιμήσεις λιπιδικής μεμβράνης νανοκλίμακας σε μελέτες φασματοσκοπίας φασματοσκοπίας παραμαγνητικού συντονισμού ηλεκτρονίων για τη δομή και τη λειτουργία των πρωτεϊνών. Νανοτεχνολ. Στροφή μηχανής. 6, 75-92 (2017).
Torricella, F., Pierro, A., Mileo, E., Belle, V. & Bonucci, A. Nitroxide spin labels and EPR spectroscopy: Ένας ισχυρός συσχετισμός για μελέτες δυναμικής πρωτεϊνών. Biochim. Biophys. Acta Proteins Proteom. 1869, 140653 (2021).
McHaourab, HS, Steed, PR & Kazmier, K. Προς την τέταρτη διάσταση της δομής των πρωτεϊνών της μεμβράνης: Insight into dynamics from spin-labeling EPR spectroscopy. Structure 19, 1549-1561 (2011).
Zhang, Η., Lin, EC, Das, BB, Tian, Y. & Opella, SJ Δομικός προσδιορισμός πρωτεΐνης ιού U από HIV-1 με NMR σε περιβάλλοντα μεμβράνης. Βιοχίμ. Biophys. Acta 1848, 3007-3018 (2015).
Willbold, D., Hoffmann, S. & Rosch, Ρ. Δευτερεύουσα δομή και τριτοταγής πτυχή της κυτταροπλασματικής περιοχής πρωτεΐνης U (Vpu) του ιού ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας σε διάλυμα. Ευρώ. J. Biochem. 245, 581-588 (1997).
Borbat, PP, Georgieva, ER & Freed, JH Βελτιωμένη ευαισθησία για μετρήσεις μεγάλων αποστάσεων σε βιομόρια: Διπλός συντονισμός ηλεκτρονίου-ηλεκτρονίου πέντε παλμών. J. Φυσ. Chem. Κάτοικος της Λατβίας. 4, 170-175 (2013).
Georgieva, ER et αϊ. Επίδραση των συνθηκών κατάψυξης στις αποστάσεις και τις κατανομές τους που προέρχονται από συντονισμό διπλού ηλεκτρονίου (DEER): Μια μελέτη λυσοζύμης Τ4 με διπλή περιστροφή. J. Magn. Ρον. 216, 69-77 (2012).
Georgieva, ER, Borbat, PP, Ginter, C., Freed, JH & Boudker, O. Διαμορφωτικό σύνολο του μεταφορέα ασπαρτικού με νάτριο. Nat. Struct. ΜοΙ. Biol. 20, 215-221 (2013).
Borbat, PP et αϊ. Διαμορφωτική κίνηση του μεταφορέα ABC MsbA που προκαλείται από υδρόλυση ATP. PLoS Biol. 5, e271 (2007).
Borbat, PP, McHaourab, HS & Freed, JH Προσδιορισμός δομής πρωτεΐνης με χρήση περιορισμών μεγάλων αποστάσεων από ESR διπλής κβαντικής συνοχής: μελέτη λυσοζύμης Τ4. Μαρμελάδα. Chem. Soc. 124, 5304-5314 (2002).
Ντάγκλας, JL et αϊ. Το Vpu κατευθύνει την αποικοδόμηση του περιοριστικού παράγοντα του ιού της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας BST-2/Tetherin μέσω ενός μηχανισμού που εξαρτάται από το {beta}TrCP. J.Virol. 83, 7931-7947 (2009).
Ewart, GD, Sutherland, T., Gage, PW & Cox, GB Η πρωτεΐνη Vpu του ιού της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας τύπου 1 σχηματίζει διαύλους ιόντων επιλεκτικών κατιόντων. J.Virol. 70, 7108-7115 (1996).
Nygaard, R., Kim, J. & Mancia, F. Ανάλυση μικροσκοπίας κρυοηλεκτρονικών πρωτεϊνών μικρών μεμβρανών. Curr. Γνώμη. Struct. Biol. 64, 26-33 (2020).
Coscia, F. et αϊ. Η σύντηξη σε ένα ομο-ολιγομερές ικρίωμα επιτρέπει την κρυο-ΕΜ ανάλυση μιας μικρής πρωτεΐνης. Sci. Μαλλομέταξο ύφασμα. 6, 30909 (2016).
Σέλμκε, Β. et αϊ. Ανοικτή και κλειστή μορφή πρωτεΐνης δέσμευσης μαλτόζης στη φυσική και τηγμένη σφαιρική της κατάσταση όπως μελετήθηκε με φασματοσκοπία παραμαγνητικού συντονισμού ηλεκτρονίων. Βιοχημεία 57, 5507-5512 (2018).
Chen, CP et αϊ. Συγκρότημα πρωτεΐνης μεμβράνης: Δύο κυτταροπλασματικές φωσφορυλιωμένες θέσεις σερίνης του Vpu από τον HIV-1 επηρεάζουν τον ολιγομερισμό. Sci. Μαλλομέταξο ύφασμα. 6, 28866 (2016).
Lu, JX, Sharpe, S., Ghirlando, R., Yau, WM & Tycko, R. Κατάσταση ολιγομερισμού και υπερμοριακή δομή του διαμεμβρανικού τμήματος πρωτεΐνης HIV-1 Vpu σε φωσφολιπιδικές διπλές στοιβάδες. Protein Sci. 19, 1877-1896 (2010).
Sharpe, S., Yau, WM & Tycko, R. Δομή και δυναμική της διαμεμβρανικής περιοχής HIV-1 Vpu που αποκαλύφθηκε με NMR στερεάς κατάστασης με περιστροφή μαγικής γωνίας. Βιοχημεία 45, 918-933 (2006).
Park, SH, De Angelis, AA, Nevzorov, AA, Wu, CH & Opella, SJ Τρισδιάστατη δομή της διαμεμβρανικής περιοχής του Vpu από τον HIV-1 σε ευθυγραμμισμένα δικύτταρα φωσφολιπιδίων. Biophys. J. 91, 3032-3042 (2006).
Stangl, M. & Schneider, D. Λειτουργικός ανταγωνισμός εντός μιας μεμβράνης: Αναγνώριση λιπιδίων έναντι ολιγομερισμού διαμεμβρανικής έλικας. Βιοχίμ. Biophys. Acta 1848, 1886-96 (2015).
- SEO Powered Content & PR Distribution. Ενισχύστε σήμερα.
- PlatoData.Network Vertical Generative Ai. Ενδυναμώστε τον εαυτό σας. Πρόσβαση εδώ.
- PlatoAiStream. Web3 Intelligence. Ενισχύθηκε η γνώση. Πρόσβαση εδώ.
- PlatoESG. Αυτοκίνητο / EVs, Ανθρακας, Cleantech, Ενέργεια, Περιβάλλον, Ηλιακός, Διαχείριση των αποβλήτων. Πρόσβαση εδώ.
- PlatoHealth. Ευφυΐα βιοτεχνολογίας και κλινικών δοκιμών. Πρόσβαση εδώ.
- ChartPrime. Ανεβάστε το Trading Game σας με το ChartPrime. Πρόσβαση εδώ.
- BlockOffsets. Εκσυγχρονισμός της περιβαλλοντικής αντιστάθμισης ιδιοκτησίας. Πρόσβαση εδώ.
- πηγή: https://www.nature.com/articles/s41598-023-41873-0
